RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591041.5

CAPNS1-212, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 812 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-212ENST00000591041 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa31.6■■■□□ 2.65
CAPNS1-212ENST00000591041 ZMYM3Q14202 1370 aa31.6■■■□□ 2.65
CAPNS1-212ENST00000591041 STAG3Q9UJ98 1225 aa31.6■■■□□ 2.65
CAPNS1-212ENST00000591041 VGFO15240 615 aaPredicted RBP31.59■■■□□ 2.65
CAPNS1-212ENST00000591041 IFT172Q9UG01 1749 aa31.58■■■□□ 2.65
CAPNS1-212ENST00000591041 SLC24A1O60721 1099 aa31.57■■■□□ 2.64
CAPNS1-212ENST00000591041 IDI1Q13907 227 aa31.56■■■□□ 2.64
CAPNS1-212ENST00000591041 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP31.56■■■□□ 2.64
CAPNS1-212ENST00000591041 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP31.54■■■□□ 2.64
CAPNS1-212ENST00000591041 PPLO60437 1756 aa31.52■■■□□ 2.64
CAPNS1-212ENST00000591041 NRXN1Q9ULB1 1477 aa31.51■■■□□ 2.63
CAPNS1-212ENST00000591041 HDGFP51858 240 aaKnown RBP31.5■■■□□ 2.63
CAPNS1-212ENST00000591041 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa31.5■■■□□ 2.63
CAPNS1-212ENST00000591041 ZFYVE9O95405 1425 aa31.49■■■□□ 2.63
CAPNS1-212ENST00000591041 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP31.49■■■□□ 2.63
CAPNS1-212ENST00000591041 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP31.49■■■□□ 2.63
CAPNS1-212ENST00000591041 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP31.49■■■□□ 2.63
CAPNS1-212ENST00000591041 CERKQ8TCT0 537 aa31.48■■■□□ 2.63
CAPNS1-212ENST00000591041 TNRQ92752 1358 aa31.47■■■□□ 2.63
CAPNS1-212ENST00000591041 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa31.46■■■□□ 2.63
CAPNS1-212ENST00000591041 CCDC7Q96M83 1385 aa31.45■■■□□ 2.63
CAPNS1-212ENST00000591041 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP31.44■■■□□ 2.62
CAPNS1-212ENST00000591041 NBPF1Q3BBV0 1214 aa31.43■■■□□ 2.62
CAPNS1-212ENST00000591041 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP31.42■■■□□ 2.62
CAPNS1-212ENST00000591041 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa31.42■■■□□ 2.62
CAPNS1-212ENST00000591041 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa31.42■■■□□ 2.62
CAPNS1-212ENST00000591041 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa31.42■■■□□ 2.62
CAPNS1-212ENST00000591041 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa31.41■■■□□ 2.62
CAPNS1-212ENST00000591041 WASHC2AQ641Q2 1341 aa31.41■■■□□ 2.62
CAPNS1-212ENST00000591041 PIK3C2GO75747 1445 aa31.41■■■□□ 2.62
CAPNS1-212ENST00000591041 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP31.4■■■□□ 2.62
CAPNS1-212ENST00000591041 NLRP1Q9C000 1473 aa31.4■■■□□ 2.62
CAPNS1-212ENST00000591041 CDCA8Q53HL2 280 aa31.38■■■□□ 2.61
CAPNS1-212ENST00000591041 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP31.37■■■□□ 2.61
CAPNS1-212ENST00000591041 ANP32CO43423 234 aa31.36■■■□□ 2.61
CAPNS1-212ENST00000591041 TMF1P82094 1093 aa31.35■■■□□ 2.61
CAPNS1-212ENST00000591041 IQGAP1P46940 1657 aa31.35■■■□□ 2.61
CAPNS1-212ENST00000591041 KIF7Q2M1P5 1343 aa31.34■■■□□ 2.61
CAPNS1-212ENST00000591041 CFAP70Q5T0N1 1121 aa31.33■■■□□ 2.61
CAPNS1-212ENST00000591041 A2ML1A8K2U0 1454 aa31.33■■■□□ 2.61
CAPNS1-212ENST00000591041 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP31.32■■■□□ 2.6
CAPNS1-212ENST00000591041 MIER1Q8N108 512 aa31.32■■■□□ 2.6
CAPNS1-212ENST00000591041 MYO5BQ9ULV0 1848 aa31.28■■■□□ 2.6
CAPNS1-212ENST00000591041 RIMS2Q9UQ26 1411 aa31.28■■■□□ 2.6
CAPNS1-212ENST00000591041 C3P01024 1663 aa31.28■■■□□ 2.6
CAPNS1-212ENST00000591041 DMRT2Q9Y5R5 561 aa31.27■■■□□ 2.6
CAPNS1-212ENST00000591041 POLR3GLQ9BT43 218 aa31.23■■■□□ 2.59
CAPNS1-212ENST00000591041 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP31.21■■■□□ 2.59
CAPNS1-212ENST00000591041 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa31.17■■■□□ 2.58
CAPNS1-212ENST00000591041 TESK2Q96S53 571 aa31.17■■■□□ 2.58
CAPNS1-212ENST00000591041 EID1Q9Y6B2 187 aa31.17■■■□□ 2.58
CAPNS1-212ENST00000591041 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP31.17■■■□□ 2.58
CAPNS1-212ENST00000591041 DISP3Q9P2K9 1392 aa31.17■■■□□ 2.58
CAPNS1-212ENST00000591041 UBR1Q8IWV7 1749 aa31.16■■■□□ 2.58
CAPNS1-212ENST00000591041 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP31.16■■■□□ 2.58
CAPNS1-212ENST00000591041 ADGRB1O14514 1584 aa31.16■■■□□ 2.58
CAPNS1-212ENST00000591041 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP31.16■■■□□ 2.58
CAPNS1-212ENST00000591041 TMEM2Q9UHN6 1383 aa31.16■■■□□ 2.58
CAPNS1-212ENST00000591041 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP31.15■■■□□ 2.58
CAPNS1-212ENST00000591041 MYO3AQ8NEV4 1616 aa31.15■■■□□ 2.58
CAPNS1-212ENST00000591041 STRCQ7RTU9 1775 aa31.15■■■□□ 2.58
CAPNS1-212ENST00000591041 CCER2I3L3R5 266 aa31.13■■■□□ 2.57
CAPNS1-212ENST00000591041 ALKQ9UM73 1620 aa31.09■■■□□ 2.57
CAPNS1-212ENST00000591041 TRAK1Q9UPV9 953 aa31.09■■■□□ 2.57
CAPNS1-212ENST00000591041 BCANQ96GW7 911 aa31.07■■■□□ 2.56
CAPNS1-212ENST00000591041 TMEM132EQ6IEE7 984 aa31.05■■■□□ 2.56
CAPNS1-212ENST00000591041 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP31.04■■■□□ 2.56
CAPNS1-212ENST00000591041 SLIT1O75093 1534 aa31.03■■■□□ 2.56
CAPNS1-212ENST00000591041 ILDR2Q71H61 639 aa31.03■■■□□ 2.56
CAPNS1-212ENST00000591041 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP31.03■■■□□ 2.56
CAPNS1-212ENST00000591041 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP31.02■■■□□ 2.56
CAPNS1-212ENST00000591041 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa31.02■■■□□ 2.56
CAPNS1-212ENST00000591041 QRICH2Q9H0J4 1663 aa31■■■□□ 2.55
CAPNS1-212ENST00000591041 TXNDC2Q86VQ3 553 aa30.99■■■□□ 2.55
CAPNS1-212ENST00000591041 ARHGAP23Q9P227 1491 aa30.99■■■□□ 2.55
CAPNS1-212ENST00000591041 EVC2Q86UK5 1308 aa30.98■■■□□ 2.55
CAPNS1-212ENST00000591041 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP30.98■■■□□ 2.55
CAPNS1-212ENST00000591041 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP30.98■■■□□ 2.55
CAPNS1-212ENST00000591041 POGKQ9P215 609 aa30.98■■■□□ 2.55
CAPNS1-212ENST00000591041 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP30.97■■■□□ 2.55
CAPNS1-212ENST00000591041 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP30.97■■■□□ 2.55
CAPNS1-212ENST00000591041 DLC1Q96QB1 1528 aa30.97■■■□□ 2.55
CAPNS1-212ENST00000591041 SOCS7O14512 581 aa30.96■■■□□ 2.55
CAPNS1-212ENST00000591041 STK26Q9P289 416 aa30.94■■■□□ 2.54
CAPNS1-212ENST00000591041 ABCC11Q96J66 1382 aa30.93■■■□□ 2.54
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP30.93■■■□□ 2.54
CAPNS1-212ENST00000591041 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa30.93■■■□□ 2.54
CAPNS1-212ENST00000591041 SIRT1Q96EB6 747 aa30.92■■■□□ 2.54
CAPNS1-212ENST00000591041 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP30.92■■■□□ 2.54
CAPNS1-212ENST00000591041 DIP2AQ14689 1571 aa30.91■■■□□ 2.54
CAPNS1-212ENST00000591041 RALBP1Q15311 655 aa30.89■■■□□ 2.54
CAPNS1-212ENST00000591041 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa30.87■■■□□ 2.53
CAPNS1-212ENST00000591041 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP30.87■■■□□ 2.53
CAPNS1-212ENST00000591041 ANKLE2Q86XL3 938 aa30.86■■■□□ 2.53
CAPNS1-212ENST00000591041 NINLQ9Y2I6 1382 aa30.86■■■□□ 2.53
CAPNS1-212ENST00000591041 LTBP4Q8N2S1 1624 aa30.85■■■□□ 2.53
CAPNS1-212ENST00000591041 PRAM1Q96QH2 718 aa30.85■■■□□ 2.53
CAPNS1-212ENST00000591041 PANK3Q9H999 370 aa30.85■■■□□ 2.53
CAPNS1-212ENST00000591041 KNSTRNQ9Y448 316 aa30.85■■■□□ 2.53
CAPNS1-212ENST00000591041 TBX22Q9Y458 520 aa30.85■■■□□ 2.53
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