RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566635.5

HERC2-208, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene HERC2, Length 2,114 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC2-208ENST00000566635 NRXN1Q9ULB1 1477 aa24.96■■□□□ 1.59
HERC2-208ENST00000566635 STAC3Q96MF2 364 aa24.96■■□□□ 1.59
HERC2-208ENST00000566635 GPRASP1Q5JY77 1395 aa24.95■■□□□ 1.59
HERC2-208ENST00000566635 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa24.94■■□□□ 1.58
HERC2-208ENST00000566635 TNRQ92752 1358 aa24.93■■□□□ 1.58
HERC2-208ENST00000566635 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa24.92■■□□□ 1.58
HERC2-208ENST00000566635 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
HERC2-208ENST00000566635 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
HERC2-208ENST00000566635 A2ML1A8K2U0 1454 aa24.9■■□□□ 1.58
HERC2-208ENST00000566635 ADAMTSL3P82987 1691 aa24.9■■□□□ 1.58
HERC2-208ENST00000566635 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
HERC2-208ENST00000566635 PIK3C2GO75747 1445 aa24.89■■□□□ 1.58
HERC2-208ENST00000566635 PLPPR3Q6T4P5 718 aa24.88■■□□□ 1.57
HERC2-208ENST00000566635 STAG3Q9UJ98 1225 aa24.88■■□□□ 1.57
HERC2-208ENST00000566635 IQGAP1P46940 1657 aa24.87■■□□□ 1.57
HERC2-208ENST00000566635 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
HERC2-208ENST00000566635 CFAP70Q5T0N1 1121 aa24.85■■□□□ 1.57
HERC2-208ENST00000566635 UBR1Q8IWV7 1749 aa24.84■■□□□ 1.57
HERC2-208ENST00000566635 WASHC2AQ641Q2 1341 aa24.84■■□□□ 1.57
HERC2-208ENST00000566635 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
HERC2-208ENST00000566635 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
HERC2-208ENST00000566635 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa24.82■■□□□ 1.56
HERC2-208ENST00000566635 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
HERC2-208ENST00000566635 ZFYVE9O95405 1425 aa24.81■■□□□ 1.56
HERC2-208ENST00000566635 VGFO15240 615 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
HERC2-208ENST00000566635 NLRP1Q9C000 1473 aa24.8■■□□□ 1.56
HERC2-208ENST00000566635 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa24.8■■□□□ 1.56
HERC2-208ENST00000566635 RIMS2Q9UQ26 1411 aa24.79■■□□□ 1.56
HERC2-208ENST00000566635 MYO3AQ8NEV4 1616 aa24.79■■□□□ 1.56
HERC2-208ENST00000566635 CCDC7Q96M83 1385 aa24.79■■□□□ 1.56
HERC2-208ENST00000566635 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
HERC2-208ENST00000566635 ADGRB1O14514 1584 aa24.78■■□□□ 1.56
HERC2-208ENST00000566635 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
HERC2-208ENST00000566635 KIF7Q2M1P5 1343 aa24.76■■□□□ 1.55
HERC2-208ENST00000566635 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
HERC2-208ENST00000566635 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa24.72■■□□□ 1.55
HERC2-208ENST00000566635 TMEM132EQ6IEE7 984 aa24.7■■□□□ 1.54
HERC2-208ENST00000566635 TMEM2Q9UHN6 1383 aa24.69■■□□□ 1.54
HERC2-208ENST00000566635 MIER1Q8N108 512 aa24.69■■□□□ 1.54
HERC2-208ENST00000566635 TESK2Q96S53 571 aa24.69■■□□□ 1.54
HERC2-208ENST00000566635 ALKQ9UM73 1620 aa24.69■■□□□ 1.54
HERC2-208ENST00000566635 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa24.68■■□□□ 1.54
HERC2-208ENST00000566635 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
HERC2-208ENST00000566635 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
HERC2-208ENST00000566635 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
HERC2-208ENST00000566635 POLR3GLQ9BT43 218 aa24.66■■□□□ 1.54
HERC2-208ENST00000566635 DISP3Q9P2K9 1392 aa24.65■■□□□ 1.54
HERC2-208ENST00000566635 PTPRMP28827 1452 aa24.65■■□□□ 1.54
HERC2-208ENST00000566635 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP24.64■■□□□ 1.54
HERC2-208ENST00000566635 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.53
HERC2-208ENST00000566635 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
HERC2-208ENST00000566635 SLIT1O75093 1534 aa24.63■■□□□ 1.53
HERC2-208ENST00000566635 TRAK1Q9UPV9 953 aa24.62■■□□□ 1.53
HERC2-208ENST00000566635 ARHGAP23Q9P227 1491 aa24.61■■□□□ 1.53
HERC2-208ENST00000566635 QRICH2Q9H0J4 1663 aa24.6■■□□□ 1.53
HERC2-208ENST00000566635 LTKP29376 864 aa24.59■■□□□ 1.53
HERC2-208ENST00000566635 HDGFP51858 240 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.52
HERC2-208ENST00000566635 TMF1P82094 1093 aa24.57■■□□□ 1.52
HERC2-208ENST00000566635 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
HERC2-208ENST00000566635 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
HERC2-208ENST00000566635 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
HERC2-208ENST00000566635 STK26Q9P289 416 aa24.55■■□□□ 1.52
HERC2-208ENST00000566635 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
HERC2-208ENST00000566635 TXNDC2Q86VQ3 553 aa24.54■■□□□ 1.52
HERC2-208ENST00000566635 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa24.54■■□□□ 1.52
HERC2-208ENST00000566635 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa24.52■■□□□ 1.52
HERC2-208ENST00000566635 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa24.51■■□□□ 1.51
HERC2-208ENST00000566635 BCANQ96GW7 911 aa24.51■■□□□ 1.51
HERC2-208ENST00000566635 EID1Q9Y6B2 187 aa24.51■■□□□ 1.51
HERC2-208ENST00000566635 METP08581 1390 aa24.51■■□□□ 1.51
HERC2-208ENST00000566635 MYOM1P52179 1685 aa24.48■■□□□ 1.51
HERC2-208ENST00000566635 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
HERC2-208ENST00000566635 ANP32CO43423 234 aa24.46■■□□□ 1.51
HERC2-208ENST00000566635 KNDC1Q76NI1 1749 aa24.46■■□□□ 1.51
HERC2-208ENST00000566635 DLC1Q96QB1 1528 aa24.45■■□□□ 1.51
HERC2-208ENST00000566635 MED14O60244 1454 aa24.45■■□□□ 1.5
HERC2-208ENST00000566635 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP24.44■■□□□ 1.5
HERC2-208ENST00000566635 TULP4Q9NRJ4 1543 aa24.44■■□□□ 1.5
HERC2-208ENST00000566635 PRAM1Q96QH2 718 aa24.43■■□□□ 1.5
HERC2-208ENST00000566635 CDCA8Q53HL2 280 aa24.41■■□□□ 1.5
HERC2-208ENST00000566635 SLC26A8Q96RN1 970 aa24.41■■□□□ 1.5
HERC2-208ENST00000566635 ABCC11Q96J66 1382 aa24.41■■□□□ 1.5
HERC2-208ENST00000566635 DIP2AQ14689 1571 aa24.41■■□□□ 1.5
HERC2-208ENST00000566635 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa24.4■■□□□ 1.5
HERC2-208ENST00000566635 CPS1P31327 1500 aa24.4■■□□□ 1.5
HERC2-208ENST00000566635 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa24.4■■□□□ 1.5
HERC2-208ENST00000566635 SLC24A1O60721 1099 aa24.4■■□□□ 1.5
HERC2-208ENST00000566635 POGKQ9P215 609 aa24.39■■□□□ 1.49
HERC2-208ENST00000566635 TECPR2O15040 1411 aa24.38■■□□□ 1.49
HERC2-208ENST00000566635 PTPRUQ92729 1446 aa24.37■■□□□ 1.49
HERC2-208ENST00000566635 WAPLQ7Z5K2 1190 aa24.36■■□□□ 1.49
HERC2-208ENST00000566635 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
HERC2-208ENST00000566635 ANKLE2Q86XL3 938 aa24.35■■□□□ 1.49
HERC2-208ENST00000566635 PANK3Q9H999 370 aa24.34■■□□□ 1.49
HERC2-208ENST00000566635 EVC2Q86UK5 1308 aa24.34■■□□□ 1.49
HERC2-208ENST00000566635 TBX22Q9Y458 520 aa24.33■■□□□ 1.49
HERC2-208ENST00000566635 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
HERC2-208ENST00000566635 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
HERC2-208ENST00000566635 FAM135BQ49AJ0 1406 aa24.32■■□□□ 1.48
HERC2-208ENST00000566635 ROBO2Q9HCK4 1378 aa24.32■■□□□ 1.48
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