RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550632.5

USP15-216, Transcript of ubiquitin specific peptidase 15, humanhuman

TSL 3

Gene USP15, Length 728 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15-216ENST00000550632 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
USP15-216ENST00000550632 SHPRHQ149N8 1683 aa23.73■■□□□ 1.39
USP15-216ENST00000550632 AFF2P51816 1311 aa23.72■■□□□ 1.39
USP15-216ENST00000550632 KIF15Q9NS87 1388 aa23.69■■□□□ 1.38
USP15-216ENST00000550632 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa23.69■■□□□ 1.38
USP15-216ENST00000550632 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
USP15-216ENST00000550632 RGS12O14924 1447 aa23.68■■□□□ 1.38
USP15-216ENST00000550632 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
USP15-216ENST00000550632 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
USP15-216ENST00000550632 ADGRB3O60242 1522 aa23.67■■□□□ 1.38
USP15-216ENST00000550632 ERBINQ96RT1 1412 aa23.64■■□□□ 1.37
USP15-216ENST00000550632 KANK1Q14678 1352 aa23.64■■□□□ 1.37
USP15-216ENST00000550632 ATF3P18847 181 aa23.63■■□□□ 1.37
USP15-216ENST00000550632 DIP2AQ14689 1571 aa23.63■■□□□ 1.37
USP15-216ENST00000550632 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
USP15-216ENST00000550632 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
USP15-216ENST00000550632 CADPS2Q86UW7 1296 aa23.62■■□□□ 1.37
USP15-216ENST00000550632 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
USP15-216ENST00000550632 BRINP3Q76B58 766 aa23.61■■□□□ 1.37
USP15-216ENST00000550632 C8orf37Q96NL8 207 aa23.61■■□□□ 1.37
USP15-216ENST00000550632 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa23.61■■□□□ 1.37
USP15-216ENST00000550632 MYOM3Q5VTT5 1437 aa23.6■■□□□ 1.37
USP15-216ENST00000550632 C19orf44Q9H6X5 657 aa23.6■■□□□ 1.37
USP15-216ENST00000550632 NOS1P29475 1434 aa23.59■■□□□ 1.37
USP15-216ENST00000550632 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
USP15-216ENST00000550632 ZFYVE9O95405 1425 aa23.59■■□□□ 1.37
USP15-216ENST00000550632 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa23.58■■□□□ 1.36
USP15-216ENST00000550632 RIMS2Q9UQ26 1411 aa23.57■■□□□ 1.36
USP15-216ENST00000550632 LMTK2Q8IWU2 1503 aa23.56■■□□□ 1.36
USP15-216ENST00000550632 ZRANB1Q9UGI0 708 aa23.56■■□□□ 1.36
USP15-216ENST00000550632 MYO5BQ9ULV0 1848 aa23.56■■□□□ 1.36
USP15-216ENST00000550632 SLC52A1Q9NWF4 448 aa23.55■■□□□ 1.36
USP15-216ENST00000550632 TBX22Q9Y458 520 aa23.55■■□□□ 1.36
USP15-216ENST00000550632 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa23.55■■□□□ 1.36
USP15-216ENST00000550632 ABCC5O15440 1437 aa23.54■■□□□ 1.36
USP15-216ENST00000550632 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
USP15-216ENST00000550632 CROCC2H7BZ55 1655 aa23.51■■□□□ 1.35
USP15-216ENST00000550632 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
USP15-216ENST00000550632 ATAD2Q6PL18 1390 aa23.51■■□□□ 1.35
USP15-216ENST00000550632 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa23.5■■□□□ 1.35
USP15-216ENST00000550632 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa23.5■■□□□ 1.35
USP15-216ENST00000550632 SETD5Q9C0A6 1442 aa23.5■■□□□ 1.35
USP15-216ENST00000550632 GCC2Q8IWJ2 1684 aa23.49■■□□□ 1.35
USP15-216ENST00000550632 CHIC2Q9UKJ5 165 aa23.49■■□□□ 1.35
USP15-216ENST00000550632 ADAMTS2O95450 1211 aa23.48■■□□□ 1.35
USP15-216ENST00000550632 HDGFP51858 240 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
USP15-216ENST00000550632 CHGAP10645 457 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
USP15-216ENST00000550632 NGLY1Q96IV0 654 aa23.47■■□□□ 1.35
USP15-216ENST00000550632 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
USP15-216ENST00000550632 PNPLA6Q8IY17 1366 aa23.45■■□□□ 1.34
USP15-216ENST00000550632 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa23.45■■□□□ 1.34
USP15-216ENST00000550632 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa23.44■■□□□ 1.34
USP15-216ENST00000550632 NHSL1Q5SYE7 1610 aa23.44■■□□□ 1.34
USP15-216ENST00000550632 DAPK1P53355 1430 aa23.43■■□□□ 1.34
USP15-216ENST00000550632 PTPRUQ92729 1446 aa23.43■■□□□ 1.34
USP15-216ENST00000550632 FOXD1Q16676 465 aa23.42■■□□□ 1.34
USP15-216ENST00000550632 MST1RQ04912 1400 aa23.42■■□□□ 1.34
USP15-216ENST00000550632 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP23.41■■□□□ 1.34
USP15-216ENST00000550632 PIK3R4Q99570 1358 aa23.4■■□□□ 1.34
USP15-216ENST00000550632 USP21Q9UK80 565 aa23.39■■□□□ 1.33
USP15-216ENST00000550632 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa23.39■■□□□ 1.33
USP15-216ENST00000550632 PTPN23Q9H3S7 1636 aa23.38■■□□□ 1.33
USP15-216ENST00000550632 DCCP43146 1447 aa23.37■■□□□ 1.33
USP15-216ENST00000550632 TRPM2O94759 1503 aa23.36■■□□□ 1.33
USP15-216ENST00000550632 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
USP15-216ENST00000550632 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
USP15-216ENST00000550632 VPS8Q8N3P4 1428 aa23.33■■□□□ 1.33
USP15-216ENST00000550632 EP400Q96L91 3159 aa23.32■■□□□ 1.32
USP15-216ENST00000550632 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
USP15-216ENST00000550632 UNC13BO14795 1591 aa23.28■■□□□ 1.32
USP15-216ENST00000550632 ATRNO75882 1429 aa23.28■■□□□ 1.32
USP15-216ENST00000550632 CCDC125Q86Z20 511 aa23.28■■□□□ 1.32
USP15-216ENST00000550632 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
USP15-216ENST00000550632 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa23.24■■□□□ 1.31
USP15-216ENST00000550632 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa23.22■■□□□ 1.31
USP15-216ENST00000550632 DEFB132Q7Z7B7 95 aa23.22■■□□□ 1.31
USP15-216ENST00000550632 METP08581 1390 aa23.22■■□□□ 1.31
USP15-216ENST00000550632 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa23.22■■□□□ 1.31
USP15-216ENST00000550632 ORAI2Q96SN7 254 aa23.21■■□□□ 1.31
USP15-216ENST00000550632 PTCH1Q13635 1447 aa23.21■■□□□ 1.31
USP15-216ENST00000550632 NALCNQ8IZF0 1738 aa23.21■■□□□ 1.31
USP15-216ENST00000550632 C1orf167Q5SNV9 1468 aa23.2■■□□□ 1.3
USP15-216ENST00000550632 E9PCH4 1651 aa23.19■■□□□ 1.3
USP15-216ENST00000550632 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
USP15-216ENST00000550632 ADGRL2O95490 1459 aa23.18■■□□□ 1.3
USP15-216ENST00000550632 BCL9LQ86UU0 1499 aa23.17■■□□□ 1.3
USP15-216ENST00000550632 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
USP15-216ENST00000550632 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
USP15-216ENST00000550632 LRP5O75197 1615 aa23.15■■□□□ 1.3
USP15-216ENST00000550632 LAMC1P11047 1609 aa23.15■■□□□ 1.3
USP15-216ENST00000550632 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
USP15-216ENST00000550632 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
USP15-216ENST00000550632 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
USP15-216ENST00000550632 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
USP15-216ENST00000550632 MYOM2P54296 1465 aa23.1■■□□□ 1.29
USP15-216ENST00000550632 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa23.07■■□□□ 1.28
USP15-216ENST00000550632 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
USP15-216ENST00000550632 RALGAPBQ86X10 1494 aa23.06■■□□□ 1.28
USP15-216ENST00000550632 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
USP15-216ENST00000550632 GLI3P10071 1580 aa23.06■■□□□ 1.28
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