RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529677.1

PACS1-208, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene PACS1, Length 679 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-208ENST00000529677 KIF15Q9NS87 1388 aa25.32■■□□□ 1.64
PACS1-208ENST00000529677 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
PACS1-208ENST00000529677 NAIPQ13075 1403 aa25.31■■□□□ 1.64
PACS1-208ENST00000529677 EFCAB6Q5THR3 1501 aa25.28■■□□□ 1.64
PACS1-208ENST00000529677 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
PACS1-208ENST00000529677 SLC26A8Q96RN1 970 aa25.28■■□□□ 1.64
PACS1-208ENST00000529677 EID1Q9Y6B2 187 aa25.28■■□□□ 1.64
PACS1-208ENST00000529677 ERBINQ96RT1 1412 aa25.27■■□□□ 1.64
PACS1-208ENST00000529677 TRIM52Q96A61 297 aa25.26■■□□□ 1.63
PACS1-208ENST00000529677 SHPRHQ149N8 1683 aa25.24■■□□□ 1.63
PACS1-208ENST00000529677 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa25.24■■□□□ 1.63
PACS1-208ENST00000529677 SLAIN2Q9P270 581 aa25.24■■□□□ 1.63
PACS1-208ENST00000529677 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa25.22■■□□□ 1.63
PACS1-208ENST00000529677 SETD5Q9C0A6 1442 aa25.21■■□□□ 1.63
PACS1-208ENST00000529677 MSH6P52701 1360 aa25.21■■□□□ 1.63
PACS1-208ENST00000529677 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
PACS1-208ENST00000529677 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
PACS1-208ENST00000529677 DIP2AQ14689 1571 aa25.19■■□□□ 1.62
PACS1-208ENST00000529677 PCGF6Q9BYE7 350 aa25.19■■□□□ 1.62
PACS1-208ENST00000529677 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa25.18■■□□□ 1.62
PACS1-208ENST00000529677 ADGRB3O60242 1522 aa25.18■■□□□ 1.62
PACS1-208ENST00000529677 IDI1Q13907 227 aa25.18■■□□□ 1.62
PACS1-208ENST00000529677 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
PACS1-208ENST00000529677 UNC13BO14795 1591 aa25.16■■□□□ 1.62
PACS1-208ENST00000529677 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
PACS1-208ENST00000529677 LMTK2Q8IWU2 1503 aa25.13■■□□□ 1.61
PACS1-208ENST00000529677 HRCP23327 699 aa25.13■■□□□ 1.61
PACS1-208ENST00000529677 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa25.13■■□□□ 1.61
PACS1-208ENST00000529677 NOS1P29475 1434 aa25.12■■□□□ 1.61
PACS1-208ENST00000529677 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
PACS1-208ENST00000529677 MYO5BQ9ULV0 1848 aa25.1■■□□□ 1.61
PACS1-208ENST00000529677 ZFYVE9O95405 1425 aa25.1■■□□□ 1.61
PACS1-208ENST00000529677 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
PACS1-208ENST00000529677 RXRBP28702 533 aa25.08■■□□□ 1.61
PACS1-208ENST00000529677 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
PACS1-208ENST00000529677 STAG3Q9UJ98 1225 aa25.08■■□□□ 1.61
PACS1-208ENST00000529677 RGS12O14924 1447 aa25.08■■□□□ 1.61
PACS1-208ENST00000529677 IQGAP3Q86VI3 1631 aa25.04■■□□□ 1.6
PACS1-208ENST00000529677 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP25.03■■□□□ 1.6
PACS1-208ENST00000529677 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa25.03■■□□□ 1.6
PACS1-208ENST00000529677 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa25.03■■□□□ 1.6
PACS1-208ENST00000529677 AFF2P51816 1311 aa25.01■■□□□ 1.59
PACS1-208ENST00000529677 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa24.98■■□□□ 1.59
PACS1-208ENST00000529677 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa24.98■■□□□ 1.59
PACS1-208ENST00000529677 NHSL1Q5SYE7 1610 aa24.97■■□□□ 1.59
PACS1-208ENST00000529677 RIMS2Q9UQ26 1411 aa24.95■■□□□ 1.59
PACS1-208ENST00000529677 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
PACS1-208ENST00000529677 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
PACS1-208ENST00000529677 BRINP3Q76B58 766 aa24.95■■□□□ 1.58
PACS1-208ENST00000529677 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
PACS1-208ENST00000529677 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa24.94■■□□□ 1.58
PACS1-208ENST00000529677 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa24.94■■□□□ 1.58
PACS1-208ENST00000529677 NUP155O75694 1391 aa24.93■■□□□ 1.58
PACS1-208ENST00000529677 KANK1Q14678 1352 aa24.93■■□□□ 1.58
PACS1-208ENST00000529677 BCANQ96GW7 911 aa24.92■■□□□ 1.58
PACS1-208ENST00000529677 CADPS2Q86UW7 1296 aa24.91■■□□□ 1.58
PACS1-208ENST00000529677 TBX22Q9Y458 520 aa24.91■■□□□ 1.58
PACS1-208ENST00000529677 C19orf44Q9H6X5 657 aa24.9■■□□□ 1.58
PACS1-208ENST00000529677 SLC52A1Q9NWF4 448 aa24.9■■□□□ 1.58
PACS1-208ENST00000529677 PTPRUQ92729 1446 aa24.89■■□□□ 1.58
PACS1-208ENST00000529677 EP400Q96L91 3159 aa24.89■■□□□ 1.57
PACS1-208ENST00000529677 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
PACS1-208ENST00000529677 MST1RQ04912 1400 aa24.86■■□□□ 1.57
PACS1-208ENST00000529677 C14orf37Q86TY3 774 aa24.85■■□□□ 1.57
PACS1-208ENST00000529677 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
PACS1-208ENST00000529677 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
PACS1-208ENST00000529677 PNPLA6Q8IY17 1366 aa24.84■■□□□ 1.57
PACS1-208ENST00000529677 ATF3P18847 181 aa24.84■■□□□ 1.57
PACS1-208ENST00000529677 E9PCH4 1651 aa24.84■■□□□ 1.57
PACS1-208ENST00000529677 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
PACS1-208ENST00000529677 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
PACS1-208ENST00000529677 PIK3R4Q99570 1358 aa24.82■■□□□ 1.56
PACS1-208ENST00000529677 DCCP43146 1447 aa24.82■■□□□ 1.56
PACS1-208ENST00000529677 C8orf37Q96NL8 207 aa24.82■■□□□ 1.56
PACS1-208ENST00000529677 MPHOSPH9Q99550 1183 aa24.82■■□□□ 1.56
PACS1-208ENST00000529677 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
PACS1-208ENST00000529677 TRPM2O94759 1503 aa24.81■■□□□ 1.56
PACS1-208ENST00000529677 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa24.8■■□□□ 1.56
PACS1-208ENST00000529677 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
PACS1-208ENST00000529677 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
PACS1-208ENST00000529677 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
PACS1-208ENST00000529677 ATAD2Q6PL18 1390 aa24.78■■□□□ 1.56
PACS1-208ENST00000529677 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa24.75■■□□□ 1.55
PACS1-208ENST00000529677 LAMC1P11047 1609 aa24.73■■□□□ 1.55
PACS1-208ENST00000529677 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa24.72■■□□□ 1.55
PACS1-208ENST00000529677 NALCNQ8IZF0 1738 aa24.72■■□□□ 1.55
PACS1-208ENST00000529677 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
PACS1-208ENST00000529677 ZRANB1Q9UGI0 708 aa24.71■■□□□ 1.55
PACS1-208ENST00000529677 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP24.69■■□□□ 1.54
PACS1-208ENST00000529677 ADAMTS2O95450 1211 aa24.68■■□□□ 1.54
PACS1-208ENST00000529677 HDGFP51858 240 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
PACS1-208ENST00000529677 ATRNO75882 1429 aa24.68■■□□□ 1.54
PACS1-208ENST00000529677 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa24.67■■□□□ 1.54
PACS1-208ENST00000529677 NGLY1Q96IV0 654 aa24.65■■□□□ 1.54
PACS1-208ENST00000529677 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa24.65■■□□□ 1.54
PACS1-208ENST00000529677 CLSPNQ9HAW4 1339 aa24.64■■□□□ 1.54
PACS1-208ENST00000529677 CHGAP10645 457 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
PACS1-208ENST00000529677 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
PACS1-208ENST00000529677 FOXD1Q16676 465 aa24.62■■□□□ 1.53
PACS1-208ENST00000529677 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
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