RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525194.5

ACER3-202, Transcript of alkaline ceramidase 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACER3, Length 846 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER3-202ENST00000525194 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa31.41■■■□□ 2.62
ACER3-202ENST00000525194 HDGFP51858 240 aaKnown RBP31.4■■■□□ 2.62
ACER3-202ENST00000525194 UBR1Q8IWV7 1749 aa31.4■■■□□ 2.62
ACER3-202ENST00000525194 ZFYVE9O95405 1425 aa31.4■■■□□ 2.62
ACER3-202ENST00000525194 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP31.39■■■□□ 2.62
ACER3-202ENST00000525194 RALGAPBQ86X10 1494 aa31.38■■■□□ 2.61
ACER3-202ENST00000525194 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP31.37■■■□□ 2.61
ACER3-202ENST00000525194 NRXN1Q9ULB1 1477 aa31.36■■■□□ 2.61
ACER3-202ENST00000525194 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP31.35■■■□□ 2.61
ACER3-202ENST00000525194 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP31.34■■■□□ 2.61
ACER3-202ENST00000525194 RIMS2Q9UQ26 1411 aa31.33■■■□□ 2.61
ACER3-202ENST00000525194 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa31.33■■■□□ 2.61
ACER3-202ENST00000525194 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa31.32■■■□□ 2.6
ACER3-202ENST00000525194 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa31.32■■■□□ 2.6
ACER3-202ENST00000525194 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP31.31■■■□□ 2.6
ACER3-202ENST00000525194 TMEM2Q9UHN6 1383 aa31.3■■■□□ 2.6
ACER3-202ENST00000525194 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa31.3■■■□□ 2.6
ACER3-202ENST00000525194 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP31.29■■■□□ 2.6
ACER3-202ENST00000525194 PIK3C2GO75747 1445 aa31.28■■■□□ 2.6
ACER3-202ENST00000525194 SLIT1O75093 1534 aa31.25■■■□□ 2.59
ACER3-202ENST00000525194 EID1Q9Y6B2 187 aa31.25■■■□□ 2.59
ACER3-202ENST00000525194 CARD11Q9BXL7 1154 aa31.24■■■□□ 2.59
ACER3-202ENST00000525194 GPRASP1Q5JY77 1395 aa31.24■■■□□ 2.59
ACER3-202ENST00000525194 ARHGAP23Q9P227 1491 aa31.23■■■□□ 2.59
ACER3-202ENST00000525194 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP31.23■■■□□ 2.59
ACER3-202ENST00000525194 LAMC1P11047 1609 aa31.23■■■□□ 2.59
ACER3-202ENST00000525194 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP31.22■■■□□ 2.59
ACER3-202ENST00000525194 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP31.21■■■□□ 2.59
ACER3-202ENST00000525194 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP31.18■■■□□ 2.58
ACER3-202ENST00000525194 NBPF1Q3BBV0 1214 aa31.18■■■□□ 2.58
ACER3-202ENST00000525194 CFAP70Q5T0N1 1121 aa31.18■■■□□ 2.58
ACER3-202ENST00000525194 TXNDC2Q86VQ3 553 aa31.17■■■□□ 2.58
ACER3-202ENST00000525194 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa31.17■■■□□ 2.58
ACER3-202ENST00000525194 USP47Q96K76 1375 aa31.13■■■□□ 2.57
ACER3-202ENST00000525194 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa31.12■■■□□ 2.57
ACER3-202ENST00000525194 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP31.11■■■□□ 2.57
ACER3-202ENST00000525194 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP31.11■■■□□ 2.57
ACER3-202ENST00000525194 LTKP29376 864 aa31.1■■■□□ 2.57
ACER3-202ENST00000525194 ANKLE2Q86XL3 938 aa31.1■■■□□ 2.57
ACER3-202ENST00000525194 ALKQ9UM73 1620 aa31.09■■■□□ 2.57
ACER3-202ENST00000525194 BCANQ96GW7 911 aa31.08■■■□□ 2.57
ACER3-202ENST00000525194 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP31.05■■■□□ 2.56
ACER3-202ENST00000525194 ADGRB1O14514 1584 aa31.05■■■□□ 2.56
ACER3-202ENST00000525194 IQGAP1P46940 1657 aa31.04■■■□□ 2.56
ACER3-202ENST00000525194 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa31.02■■■□□ 2.56
ACER3-202ENST00000525194 TMEM132EQ6IEE7 984 aa30.99■■■□□ 2.55
ACER3-202ENST00000525194 DIP2AQ14689 1571 aa30.98■■■□□ 2.55
ACER3-202ENST00000525194 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP30.98■■■□□ 2.55
ACER3-202ENST00000525194 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP30.97■■■□□ 2.55
ACER3-202ENST00000525194 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP30.97■■■□□ 2.55
ACER3-202ENST00000525194 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa30.97■■■□□ 2.55
ACER3-202ENST00000525194 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa30.96■■■□□ 2.55
ACER3-202ENST00000525194 TBX22Q9Y458 520 aa30.96■■■□□ 2.55
ACER3-202ENST00000525194 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa30.95■■■□□ 2.55
ACER3-202ENST00000525194 SLC24A1O60721 1099 aa30.95■■■□□ 2.55
ACER3-202ENST00000525194 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP30.95■■■□□ 2.54
ACER3-202ENST00000525194 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP30.94■■■□□ 2.54
ACER3-202ENST00000525194 MED14O60244 1454 aa30.94■■■□□ 2.54
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ACER3-202ENST00000525194 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP30.9■■■□□ 2.54
ACER3-202ENST00000525194 METP08581 1390 aa30.89■■■□□ 2.54
ACER3-202ENST00000525194 SLC26A8Q96RN1 970 aa30.88■■■□□ 2.53
ACER3-202ENST00000525194 ABCC11Q96J66 1382 aa30.87■■■□□ 2.53
ACER3-202ENST00000525194 PIK3R4Q99570 1358 aa30.87■■■□□ 2.53
ACER3-202ENST00000525194 STK26Q9P289 416 aa30.86■■■□□ 2.53
ACER3-202ENST00000525194 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP30.86■■■□□ 2.53
ACER3-202ENST00000525194 DLC1Q96QB1 1528 aa30.86■■■□□ 2.53
ACER3-202ENST00000525194 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa30.85■■■□□ 2.53
ACER3-202ENST00000525194 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP30.84■■■□□ 2.53
ACER3-202ENST00000525194 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa30.82■■■□□ 2.52
ACER3-202ENST00000525194 SIRT1Q96EB6 747 aa30.82■■■□□ 2.52
ACER3-202ENST00000525194 TESK2Q96S53 571 aa30.82■■■□□ 2.52
ACER3-202ENST00000525194 KNDC1Q76NI1 1749 aa30.81■■■□□ 2.52
ACER3-202ENST00000525194 HSPA2P54652 639 aa30.81■■■□□ 2.52
ACER3-202ENST00000525194 TMF1P82094 1093 aa30.81■■■□□ 2.52
ACER3-202ENST00000525194 TECPR2O15040 1411 aa30.81■■■□□ 2.52
ACER3-202ENST00000525194 POGKQ9P215 609 aa30.79■■■□□ 2.52
ACER3-202ENST00000525194 FAM135BQ49AJ0 1406 aa30.77■■■□□ 2.52
ACER3-202ENST00000525194 CDCA8Q53HL2 280 aa30.77■■■□□ 2.52
ACER3-202ENST00000525194 CCDC7Q96M83 1385 aa30.77■■■□□ 2.52
ACER3-202ENST00000525194 QRICH2Q9H0J4 1663 aa30.76■■■□□ 2.51
ACER3-202ENST00000525194 CPS1P31327 1500 aa30.76■■■□□ 2.51
ACER3-202ENST00000525194 WASHC2AQ641Q2 1341 aa30.74■■■□□ 2.51
ACER3-202ENST00000525194 PRAM1Q96QH2 718 aa30.74■■■□□ 2.51
ACER3-202ENST00000525194 KIF7Q2M1P5 1343 aa30.73■■■□□ 2.51
ACER3-202ENST00000525194 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP30.73■■■□□ 2.51
ACER3-202ENST00000525194 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa30.73■■■□□ 2.51
ACER3-202ENST00000525194 PTPRUQ92729 1446 aa30.72■■■□□ 2.51
ACER3-202ENST00000525194 PTCH1Q13635 1447 aa30.69■■■□□ 2.5
ACER3-202ENST00000525194 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP30.69■■■□□ 2.5
ACER3-202ENST00000525194 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP30.68■■■□□ 2.5
ACER3-202ENST00000525194 DISP3Q9P2K9 1392 aa30.67■■■□□ 2.5
ACER3-202ENST00000525194 STRCQ7RTU9 1775 aa30.66■■■□□ 2.5
ACER3-202ENST00000525194 EVC2Q86UK5 1308 aa30.66■■■□□ 2.5
ACER3-202ENST00000525194 ROBO2Q9HCK4 1378 aa30.65■■■□□ 2.5
ACER3-202ENST00000525194 KCNA6P17658 529 aa30.64■■■□□ 2.5
ACER3-202ENST00000525194 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP30.64■■■□□ 2.5
ACER3-202ENST00000525194 WAPLQ7Z5K2 1190 aa30.64■■■□□ 2.5
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