RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511309.5

PRELID1-208, Transcript of PRELI domain containing 1, human

TSL 2

Gene PRELID1, Length 778 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRELID1-208	ENST00000511309	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		33.03	■■■□□ 2.88
PRELID1-208	ENST00000511309	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	33.03	■■■□□ 2.88
PRELID1-208	ENST00000511309	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		33.01	■■■□□ 2.87
PRELID1-208	ENST00000511309	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	33.01	■■■□□ 2.87
PRELID1-208	ENST00000511309	FOXD1	Q16676	465 aa		32.98	■■■□□ 2.87
PRELID1-208	ENST00000511309	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	32.97	■■■□□ 2.87
PRELID1-208	ENST00000511309	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	32.97	■■■□□ 2.87
PRELID1-208	ENST00000511309	EID1	Q9Y6B2	187 aa		32.97	■■■□□ 2.87
PRELID1-208	ENST00000511309	ADGRB3	O60242	1522 aa		32.97	■■■□□ 2.87
PRELID1-208	ENST00000511309	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		32.95	■■■□□ 2.86
PRELID1-208	ENST00000511309	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	32.94	■■■□□ 2.86
PRELID1-208	ENST00000511309	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		32.94	■■■□□ 2.86
PRELID1-208	ENST00000511309	TRPM2	O94759	1503 aa		32.91	■■■□□ 2.86
PRELID1-208	ENST00000511309	HRC	P23327	699 aa		32.9	■■■□□ 2.86
PRELID1-208	ENST00000511309	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		32.9	■■■□□ 2.86
PRELID1-208	ENST00000511309	CLTCL1	P53675	1640 aa		32.88	■■■□□ 2.85
PRELID1-208	ENST00000511309	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	32.87	■■■□□ 2.85
PRELID1-208	ENST00000511309	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	32.85	■■■□□ 2.85
PRELID1-208	ENST00000511309	KIF1B	O60333	1816 aa		32.8	■■■□□ 2.84
PRELID1-208	ENST00000511309	PHF23	Q9BUL5	403 aa	Predicted RBP	32.79	■■■□□ 2.84
PRELID1-208	ENST00000511309	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		32.77	■■■□□ 2.84
PRELID1-208	ENST00000511309	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	32.76	■■■□□ 2.83
PRELID1-208	ENST00000511309	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		32.75	■■■□□ 2.83
PRELID1-208	ENST00000511309	KCNA6	P17658	529 aa		32.74	■■■□□ 2.83
PRELID1-208	ENST00000511309	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	32.74	■■■□□ 2.83
PRELID1-208	ENST00000511309	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		32.74	■■■□□ 2.83
PRELID1-208	ENST00000511309	TMEM94	Q12767	1356 aa		32.73	■■■□□ 2.83
PRELID1-208	ENST00000511309	ZFYVE9	O95405	1425 aa		32.72	■■■□□ 2.83
PRELID1-208	ENST00000511309	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	32.72	■■■□□ 2.83
PRELID1-208	ENST00000511309	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	32.71	■■■□□ 2.83
PRELID1-208	ENST00000511309	BCAN	Q96GW7	911 aa		32.7	■■■□□ 2.83
PRELID1-208	ENST00000511309	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		32.68	■■■□□ 2.82
PRELID1-208	ENST00000511309	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	32.67	■■■□□ 2.82
PRELID1-208	ENST00000511309	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	32.67	■■■□□ 2.82
PRELID1-208	ENST00000511309	NWD1	Q149M9	1564 aa		32.65	■■■□□ 2.82
PRELID1-208	ENST00000511309	NKTR	P30414	1462 aa	Known RBP	32.63	■■■□□ 2.81
PRELID1-208	ENST00000511309	RBM33	Q96EV2	1170 aa	Known RBP	32.63	■■■□□ 2.81
PRELID1-208	ENST00000511309	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		32.61	■■■□□ 2.81
PRELID1-208	ENST00000511309	PLEKHG1	Q9ULL1	1385 aa		32.59	■■■□□ 2.81
PRELID1-208	ENST00000511309	RGL3	Q3MIN7	710 aa		32.59	■■■□□ 2.81
PRELID1-208	ENST00000511309	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		32.59	■■■□□ 2.81
PRELID1-208	ENST00000511309	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		32.57	■■■□□ 2.8
PRELID1-208	ENST00000511309	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		32.57	■■■□□ 2.8
PRELID1-208	ENST00000511309	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		32.54	■■■□□ 2.8
PRELID1-208	ENST00000511309	MSH6	P52701	1360 aa		32.53	■■■□□ 2.8
PRELID1-208	ENST00000511309	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	32.52	■■■□□ 2.8
PRELID1-208	ENST00000511309	PPL	O60437	1756 aa		32.52	■■■□□ 2.8
PRELID1-208	ENST00000511309	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		32.51	■■■□□ 2.8
PRELID1-208	ENST00000511309	CHD2	O14647	1828 aa	Known RBP	32.51	■■■□□ 2.8
PRELID1-208	ENST00000511309	VGF	O15240	615 aa	Predicted RBP	32.47	■■■□□ 2.79
PRELID1-208	ENST00000511309	TBX22	Q9Y458	520 aa		32.47	■■■□□ 2.79
PRELID1-208	ENST00000511309	ADAMTS13	Q76LX8	1427 aa		32.45	■■■□□ 2.79
PRELID1-208	ENST00000511309	SLAIN2	Q9P270	581 aa		32.45	■■■□□ 2.79
PRELID1-208	ENST00000511309	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	32.45	■■■□□ 2.78
PRELID1-208	ENST00000511309	IFT172	Q9UG01	1749 aa		32.44	■■■□□ 2.78
PRELID1-208	ENST00000511309	NRXN3	Q9Y4C0	1643 aa		32.44	■■■□□ 2.78
PRELID1-208	ENST00000511309	SETBP1	Q9Y6X0	1596 aa		32.42	■■■□□ 2.78
PRELID1-208	ENST00000511309	DIP2A	Q14689	1571 aa		32.41	■■■□□ 2.78
PRELID1-208	ENST00000511309	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		32.38	■■■□□ 2.77
PRELID1-208	ENST00000511309	ADGRF5	Q8IZF2	1346 aa		32.38	■■■□□ 2.77
PRELID1-208	ENST00000511309	PHLPP1	O60346	1717 aa		32.37	■■■□□ 2.77
PRELID1-208	ENST00000511309	PIK3R4	Q99570	1358 aa		32.34	■■■□□ 2.77
PRELID1-208	ENST00000511309	POTEA	Q6S8J7	498 aa		32.33	■■■□□ 2.77
PRELID1-208	ENST00000511309	C14orf37	Q86TY3	774 aa		32.33	■■■□□ 2.77
PRELID1-208	ENST00000511309	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		32.32	■■■□□ 2.76
PRELID1-208	ENST00000511309	JCAD	Q9P266	1359 aa		32.31	■■■□□ 2.76
PRELID1-208	ENST00000511309	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		32.3	■■■□□ 2.76
PRELID1-208	ENST00000511309	KDM2A	Q9Y2K7	1162 aa		32.3	■■■□□ 2.76
PRELID1-208	ENST00000511309	MET	P08581	1390 aa		32.3	■■■□□ 2.76
PRELID1-208	ENST00000511309	NEUROD1	Q13562	356 aa		32.29	■■■□□ 2.76
PRELID1-208	ENST00000511309	SIPA1L2	Q9P2F8	1722 aa	Predicted RBP	32.28	■■■□□ 2.76
PRELID1-208	ENST00000511309	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	32.27	■■■□□ 2.76
PRELID1-208	ENST00000511309	C19orf44	Q9H6X5	657 aa		32.27	■■■□□ 2.76
PRELID1-208	ENST00000511309	PTPRU	Q92729	1446 aa		32.26	■■■□□ 2.76
PRELID1-208	ENST00000511309	SETD1A	O15047	1707 aa	Known RBP	32.26	■■■□□ 2.76
PRELID1-208	ENST00000511309	CADPS2	Q86UW7	1296 aa		32.26	■■■□□ 2.75
PRELID1-208	ENST00000511309	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		32.26	■■■□□ 2.75
PRELID1-208	ENST00000511309	MYOM2	P54296	1465 aa		32.26	■■■□□ 2.75
PRELID1-208	ENST00000511309	PIK3C2G	O75747	1445 aa		32.24	■■■□□ 2.75
PRELID1-208	ENST00000511309	ATF3	P18847	181 aa		32.23	■■■□□ 2.75
PRELID1-208	ENST00000511309	NRXN1	Q9ULB1	1477 aa		32.2	■■■□□ 2.75
PRELID1-208	ENST00000511309	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	32.19	■■■□□ 2.74
PRELID1-208	ENST00000511309	AHDC1	Q5TGY3	1603 aa	Predicted RBP	32.18	■■■□□ 2.74
PRELID1-208	ENST00000511309	CFAP70	Q5T0N1	1121 aa		32.16	■■■□□ 2.74
PRELID1-208	ENST00000511309	TMEM132E	Q6IEE7	984 aa		32.15	■■■□□ 2.74
PRELID1-208	ENST00000511309	C14orf93	Q9H972	538 aa	Known RBP	32.14	■■■□□ 2.74
PRELID1-208	ENST00000511309	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		32.14	■■■□□ 2.74
PRELID1-208	ENST00000511309	LRP6	O75581	1613 aa		32.14	■■■□□ 2.74
PRELID1-208	ENST00000511309	STAC3	Q96MF2	364 aa		32.13	■■■□□ 2.73
PRELID1-208	ENST00000511309	LAMC1	P11047	1609 aa		32.12	■■■□□ 2.73
PRELID1-208	ENST00000511309	DCC	P43146	1447 aa		32.12	■■■□□ 2.73
PRELID1-208	ENST00000511309	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		32.12	■■■□□ 2.73
PRELID1-208	ENST00000511309	BRINP3	Q76B58	766 aa		32.11	■■■□□ 2.73
PRELID1-208	ENST00000511309	STK26	Q9P289	416 aa		32.11	■■■□□ 2.73
PRELID1-208	ENST00000511309	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		32.1	■■■□□ 2.73
PRELID1-208	ENST00000511309	SHPRH	Q149N8	1683 aa		32.09	■■■□□ 2.73
PRELID1-208	ENST00000511309	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	32.06	■■■□□ 2.72
PRELID1-208	ENST00000511309	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		32.04	■■■□□ 2.72
PRELID1-208	ENST00000511309	MST1R	Q04912	1400 aa		32.03	■■■□□ 2.72
PRELID1-208	ENST00000511309	LRPPRC	P42704	1394 aa	Known RBP	32.03	■■■□□ 2.72

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