RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495305.5

MKRN1-214, Transcript of makorin ring finger protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene MKRN1, Length 1,390 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN1-214ENST00000495305 BCANQ96GW7 911 aa42.32■■■■■ 4.37
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MKRN1-214ENST00000495305 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP42.29■■■■■ 4.36
MKRN1-214ENST00000495305 TOM1O60784 492 aa42.28■■■■■ 4.36
MKRN1-214ENST00000495305 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP42.27■■■■■ 4.36
MKRN1-214ENST00000495305 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa42.26■■■■■ 4.36
MKRN1-214ENST00000495305 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa42.25■■■■■ 4.35
MKRN1-214ENST00000495305 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP42.23■■■■■ 4.35
MKRN1-214ENST00000495305 KCNA6P17658 529 aa42.21■■■■■ 4.35
MKRN1-214ENST00000495305 PIP4K2BP78356 416 aa42.21■■■■■ 4.35
MKRN1-214ENST00000495305 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP42.2■■■■■ 4.35
MKRN1-214ENST00000495305 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP42.2■■■■■ 4.35
MKRN1-214ENST00000495305 TRPM2O94759 1503 aa42.14■■■■■ 4.34
MKRN1-214ENST00000495305 ALKQ9UM73 1620 aa42.1■■■■■ 4.33
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MKRN1-214ENST00000495305 TBX22Q9Y458 520 aa42.1■■■■■ 4.33
MKRN1-214ENST00000495305 CLTCL1P53675 1640 aa42.09■■■■■ 4.33
MKRN1-214ENST00000495305 TMEM94Q12767 1356 aa42.07■■■■■ 4.33
MKRN1-214ENST00000495305 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP42.07■■■■■ 4.33
MKRN1-214ENST00000495305 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa42.06■■■■■ 4.32
MKRN1-214ENST00000495305 NWD1Q149M9 1564 aa42.04■■■■■ 4.32
MKRN1-214ENST00000495305 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP42.02■■■■■ 4.32
MKRN1-214ENST00000495305 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP42.01■■■■■ 4.32
MKRN1-214ENST00000495305 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP42.01■■■■■ 4.32
MKRN1-214ENST00000495305 HSPA1LP34931 641 aa42.01■■■■■ 4.31
MKRN1-214ENST00000495305 FOXD1Q16676 465 aa42■■■■■ 4.31
MKRN1-214ENST00000495305 SETD5Q9C0A6 1442 aa41.97■■■■■ 4.31
MKRN1-214ENST00000495305 DIP2AQ14689 1571 aa41.97■■■■■ 4.31
MKRN1-214ENST00000495305 MPHOSPH9Q99550 1183 aa41.96■■■■■ 4.31
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MKRN1-214ENST00000495305 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa41.9■■■■■ 4.3
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MKRN1-214ENST00000495305 DISP3Q9P2K9 1392 aa41.84■■■■■ 4.29
MKRN1-214ENST00000495305 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa41.83■■■■■ 4.29
MKRN1-214ENST00000495305 MSH6P52701 1360 aa41.82■■■■■ 4.29
MKRN1-214ENST00000495305 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa41.82■■■■■ 4.29
MKRN1-214ENST00000495305 PTPRUQ92729 1446 aa41.82■■■■■ 4.28
MKRN1-214ENST00000495305 CCDC144AA2RUR9 1427 aa41.8■■■■■ 4.28
MKRN1-214ENST00000495305 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa41.79■■■■■ 4.28
MKRN1-214ENST00000495305 VGFO15240 615 aaPredicted RBP41.78■■■■■ 4.28
MKRN1-214ENST00000495305 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa41.76■■■■■ 4.28
MKRN1-214ENST00000495305 METP08581 1390 aa41.75■■■■■ 4.27
MKRN1-214ENST00000495305 FAM135BQ49AJ0 1406 aa41.74■■■■■ 4.27
MKRN1-214ENST00000495305 C14orf37Q86TY3 774 aa41.74■■■■■ 4.27
MKRN1-214ENST00000495305 RGL3Q3MIN7 710 aa41.66■■■■■ 4.26
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MKRN1-214ENST00000495305 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa41.65■■■■■ 4.26
MKRN1-214ENST00000495305 C19orf44Q9H6X5 657 aa41.64■■■■■ 4.26
MKRN1-214ENST00000495305 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP41.64■■■■■ 4.26
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MKRN1-214ENST00000495305 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa41.59■■■■■ 4.25
MKRN1-214ENST00000495305 CADPS2Q86UW7 1296 aa41.58■■■■■ 4.25
MKRN1-214ENST00000495305 ATF3P18847 181 aa41.57■■■■■ 4.25
MKRN1-214ENST00000495305 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa41.55■■■■■ 4.24
MKRN1-214ENST00000495305 HRCP23327 699 aa41.55■■■■■ 4.24
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MKRN1-214ENST00000495305 DCCP43146 1447 aa41.46■■■■■ 4.23
MKRN1-214ENST00000495305 PTCH1Q13635 1447 aa41.43■■■■■ 4.22
MKRN1-214ENST00000495305 ROBO2Q9HCK4 1378 aa41.43■■■■■ 4.22
MKRN1-214ENST00000495305 IFT172Q9UG01 1749 aa41.42■■■■■ 4.22
MKRN1-214ENST00000495305 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa41.41■■■■■ 4.22
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MKRN1-214ENST00000495305 PIK3C2GO75747 1445 aa41.36■■■■■ 4.21
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MKRN1-214ENST00000495305 PHLPP1O60346 1717 aa41.31■■■■■ 4.2
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MKRN1-214ENST00000495305 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP41.23■■■■■ 4.19
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MKRN1-214ENST00000495305 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa41.13■■■■■ 4.18
MKRN1-214ENST00000495305 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP41.1■■■■■ 4.17
MKRN1-214ENST00000495305 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa41.1■■■■■ 4.17
MKRN1-214ENST00000495305 KNDC1Q76NI1 1749 aa41.09■■■■■ 4.17
MKRN1-214ENST00000495305 SOCS7O14512 581 aa41.09■■■■■ 4.17
MKRN1-214ENST00000495305 LAMC1P11047 1609 aa41.08■■■■■ 4.17
MKRN1-214ENST00000495305 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP41.08■■■■■ 4.17
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