RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492545.1

CTDSP1-211, Transcript of CTD small phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDSP1, Length 634 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1-211ENST00000492545 SLC26A8Q96RN1 970 aa35.6■■■■□ 3.29
CTDSP1-211ENST00000492545 KCNA6P17658 529 aa35.59■■■■□ 3.29
CTDSP1-211ENST00000492545 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa35.59■■■■□ 3.29
CTDSP1-211ENST00000492545 STRCP1A6NGW2 1772 aa35.57■■■■□ 3.28
CTDSP1-211ENST00000492545 TRIM52Q96A61 297 aa35.55■■■■□ 3.28
CTDSP1-211ENST00000492545 PIP4K2BP78356 416 aa35.52■■■■□ 3.28
CTDSP1-211ENST00000492545 TBX22Q9Y458 520 aa35.51■■■■□ 3.28
CTDSP1-211ENST00000492545 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP35.51■■■■□ 3.27
CTDSP1-211ENST00000492545 MYO5BQ9ULV0 1848 aa35.5■■■■□ 3.27
CTDSP1-211ENST00000492545 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa35.46■■■■□ 3.27
CTDSP1-211ENST00000492545 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP35.46■■■■□ 3.27
CTDSP1-211ENST00000492545 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP35.46■■■■□ 3.27
CTDSP1-211ENST00000492545 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP35.44■■■■□ 3.26
CTDSP1-211ENST00000492545 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP35.41■■■■□ 3.26
CTDSP1-211ENST00000492545 TRPM2O94759 1503 aa35.41■■■■□ 3.26
CTDSP1-211ENST00000492545 TMEM94Q12767 1356 aa35.4■■■■□ 3.26
CTDSP1-211ENST00000492545 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP35.4■■■■□ 3.26
CTDSP1-211ENST00000492545 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP35.39■■■■□ 3.26
CTDSP1-211ENST00000492545 PIK3R4Q99570 1358 aa35.38■■■■□ 3.26
CTDSP1-211ENST00000492545 HSPA1LP34931 641 aa35.38■■■■□ 3.25
CTDSP1-211ENST00000492545 ALKQ9UM73 1620 aa35.38■■■■□ 3.25
CTDSP1-211ENST00000492545 NWD1Q149M9 1564 aa35.38■■■■□ 3.25
CTDSP1-211ENST00000492545 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa35.36■■■■□ 3.25
CTDSP1-211ENST00000492545 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP35.36■■■■□ 3.25
CTDSP1-211ENST00000492545 DIP2AQ14689 1571 aa35.34■■■■□ 3.25
CTDSP1-211ENST00000492545 CLTCL1P53675 1640 aa35.3■■■■□ 3.24
CTDSP1-211ENST00000492545 DISP3Q9P2K9 1392 aa35.29■■■■□ 3.24
CTDSP1-211ENST00000492545 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP35.29■■■■□ 3.24
CTDSP1-211ENST00000492545 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP35.28■■■■□ 3.24
CTDSP1-211ENST00000492545 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa35.28■■■■□ 3.24
CTDSP1-211ENST00000492545 MPHOSPH9Q99550 1183 aa35.26■■■■□ 3.24
CTDSP1-211ENST00000492545 MSH6P52701 1360 aa35.25■■■■□ 3.23
CTDSP1-211ENST00000492545 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa35.25■■■■□ 3.23
CTDSP1-211ENST00000492545 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP35.24■■■■□ 3.23
CTDSP1-211ENST00000492545 SETD5Q9C0A6 1442 aa35.23■■■■□ 3.23
CTDSP1-211ENST00000492545 VGFO15240 615 aaPredicted RBP35.23■■■■□ 3.23
CTDSP1-211ENST00000492545 FAM135BQ49AJ0 1406 aa35.23■■■■□ 3.23
CTDSP1-211ENST00000492545 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa35.22■■■■□ 3.23
CTDSP1-211ENST00000492545 KIF1BO60333 1816 aa35.22■■■■□ 3.23
CTDSP1-211ENST00000492545 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa35.21■■■■□ 3.23
CTDSP1-211ENST00000492545 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa35.18■■■■□ 3.22
CTDSP1-211ENST00000492545 FOXD1Q16676 465 aa35.17■■■■□ 3.22
CTDSP1-211ENST00000492545 CCDC144AA2RUR9 1427 aa35.14■■■■□ 3.22
CTDSP1-211ENST00000492545 C14orf37Q86TY3 774 aa35.13■■■■□ 3.21
CTDSP1-211ENST00000492545 C19orf44Q9H6X5 657 aa35.13■■■■□ 3.21
CTDSP1-211ENST00000492545 SLAIN2Q9P270 581 aa35.13■■■■□ 3.21
CTDSP1-211ENST00000492545 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa35.12■■■■□ 3.21
CTDSP1-211ENST00000492545 PTPRUQ92729 1446 aa35.12■■■■□ 3.21
CTDSP1-211ENST00000492545 METP08581 1390 aa35.1■■■■□ 3.21
CTDSP1-211ENST00000492545 CADPS2Q86UW7 1296 aa35.09■■■■□ 3.21
CTDSP1-211ENST00000492545 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa35.07■■■■□ 3.2
CTDSP1-211ENST00000492545 ATF3P18847 181 aa35.06■■■■□ 3.2
CTDSP1-211ENST00000492545 HRCP23327 699 aa35.04■■■■□ 3.2
CTDSP1-211ENST00000492545 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa35■■■■□ 3.19
CTDSP1-211ENST00000492545 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP35■■■■□ 3.19
CTDSP1-211ENST00000492545 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa34.99■■■■□ 3.19
CTDSP1-211ENST00000492545 RGL3Q3MIN7 710 aa34.98■■■■□ 3.19
CTDSP1-211ENST00000492545 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa34.97■■■■□ 3.19
CTDSP1-211ENST00000492545 DCCP43146 1447 aa34.97■■■■□ 3.19
CTDSP1-211ENST00000492545 ILDR2Q71H61 639 aa34.95■■■■□ 3.19
CTDSP1-211ENST00000492545 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP34.94■■■■□ 3.18
CTDSP1-211ENST00000492545 PPLO60437 1756 aa34.93■■■■□ 3.18
CTDSP1-211ENST00000492545 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP34.92■■■■□ 3.18
CTDSP1-211ENST00000492545 PRAG1Q86YV5 1406 aa34.89■■■■□ 3.18
CTDSP1-211ENST00000492545 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa34.88■■■■□ 3.17
CTDSP1-211ENST00000492545 PTCH1Q13635 1447 aa34.88■■■■□ 3.17
CTDSP1-211ENST00000492545 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP34.85■■■■□ 3.17
CTDSP1-211ENST00000492545 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa34.85■■■■□ 3.17
CTDSP1-211ENST00000492545 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP34.83■■■■□ 3.17
CTDSP1-211ENST00000492545 ROBO2Q9HCK4 1378 aa34.81■■■■□ 3.16
CTDSP1-211ENST00000492545 BRINP3Q76B58 766 aa34.79■■■■□ 3.16
CTDSP1-211ENST00000492545 JCADQ9P266 1359 aa34.78■■■■□ 3.16
CTDSP1-211ENST00000492545 PIK3C2GO75747 1445 aa34.77■■■■□ 3.16
CTDSP1-211ENST00000492545 MST1RQ04912 1400 aa34.76■■■■□ 3.16
CTDSP1-211ENST00000492545 SOCS7O14512 581 aa34.76■■■■□ 3.16
CTDSP1-211ENST00000492545 PHLPP1O60346 1717 aa34.75■■■■□ 3.15
CTDSP1-211ENST00000492545 IFT172Q9UG01 1749 aa34.75■■■■□ 3.15
CTDSP1-211ENST00000492545 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP34.73■■■■□ 3.15
CTDSP1-211ENST00000492545 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP34.72■■■■□ 3.15
CTDSP1-211ENST00000492545 ABCC11Q96J66 1382 aa34.72■■■■□ 3.15
CTDSP1-211ENST00000492545 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP34.71■■■■□ 3.15
CTDSP1-211ENST00000492545 STAC3Q96MF2 364 aa34.7■■■■□ 3.15
CTDSP1-211ENST00000492545 TECPR2O15040 1411 aa34.7■■■■□ 3.15
CTDSP1-211ENST00000492545 MYOM2P54296 1465 aa34.7■■■■□ 3.15
CTDSP1-211ENST00000492545 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP34.68■■■■□ 3.14
CTDSP1-211ENST00000492545 NRXN1Q9ULB1 1477 aa34.68■■■■□ 3.14
CTDSP1-211ENST00000492545 STK26Q9P289 416 aa34.67■■■■□ 3.14
CTDSP1-211ENST00000492545 NALCNQ8IZF0 1738 aa34.67■■■■□ 3.14
CTDSP1-211ENST00000492545 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa34.66■■■■□ 3.14
CTDSP1-211ENST00000492545 TMEM132EQ6IEE7 984 aa34.66■■■■□ 3.14
CTDSP1-211ENST00000492545 SIRT1Q96EB6 747 aa34.66■■■■□ 3.14
CTDSP1-211ENST00000492545 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa34.65■■■■□ 3.14
CTDSP1-211ENST00000492545 C1orf167Q5SNV9 1468 aa34.63■■■■□ 3.13
CTDSP1-211ENST00000492545 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP34.61■■■■□ 3.13
CTDSP1-211ENST00000492545 CFAP70Q5T0N1 1121 aa34.6■■■■□ 3.13
CTDSP1-211ENST00000492545 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP34.6■■■■□ 3.13
CTDSP1-211ENST00000492545 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP34.6■■■■□ 3.13
CTDSP1-211ENST00000492545 WAPLQ7Z5K2 1190 aa34.58■■■■□ 3.13
CTDSP1-211ENST00000492545 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP34.58■■■■□ 3.13
CTDSP1-211ENST00000492545 DCAF11Q8TEB1 546 aa34.55■■■■□ 3.12
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