RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488380.5

NISCH-212, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 3,168 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-212ENST00000488380 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP17.65■□□□□ 0.42
NISCH-212ENST00000488380 TMF1P82094 1093 aa17.65■□□□□ 0.42
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NISCH-212ENST00000488380 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP17.63■□□□□ 0.41
NISCH-212ENST00000488380 MADDQ8WXG6 1647 aa17.62■□□□□ 0.41
NISCH-212ENST00000488380 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP17.62■□□□□ 0.41
NISCH-212ENST00000488380 CLTCL1P53675 1640 aa17.62■□□□□ 0.41
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NISCH-212ENST00000488380 WDR7Q9Y4E6 1490 aa17.6■□□□□ 0.41
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NISCH-212ENST00000488380 UGGT1Q9NYU2 1555 aa17.59■□□□□ 0.41
NISCH-212ENST00000488380 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa17.58■□□□□ 0.4
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NISCH-212ENST00000488380 CEP152O94986 1710 aa17.57■□□□□ 0.4
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NISCH-212ENST00000488380 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP17.55■□□□□ 0.4
NISCH-212ENST00000488380 ADGRL1O94910 1474 aa17.55■□□□□ 0.4
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NISCH-212ENST00000488380 ARAP3Q8WWN8 1544 aa17.54■□□□□ 0.4
NISCH-212ENST00000488380 ARXQ96QS3 562 aa17.53■□□□□ 0.4
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NISCH-212ENST00000488380 ADAMTS8Q9UP79 889 aa17.53■□□□□ 0.4
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NISCH-212ENST00000488380 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP17.52■□□□□ 0.39
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NISCH-212ENST00000488380 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa17.5■□□□□ 0.39
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NISCH-212ENST00000488380 VWDEQ8N2E2 1590 aa17.5■□□□□ 0.39
NISCH-212ENST00000488380 C20orf194Q5TEA3 1177 aa17.49■□□□□ 0.39
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NISCH-212ENST00000488380 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa17.44■□□□□ 0.38
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NISCH-212ENST00000488380 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP17.41■□□□□ 0.38
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NISCH-212ENST00000488380 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa17.41■□□□□ 0.38
NISCH-212ENST00000488380 CDCA8Q53HL2 280 aa17.4■□□□□ 0.38
NISCH-212ENST00000488380 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP17.4■□□□□ 0.38
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NISCH-212ENST00000488380 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP17.4■□□□□ 0.38
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NISCH-212ENST00000488380 STAC3Q96MF2 364 aa17.38■□□□□ 0.37
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NISCH-212ENST00000488380 INSRP06213 1382 aa17.37■□□□□ 0.37
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NISCH-212ENST00000488380 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP17.36■□□□□ 0.37
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NISCH-212ENST00000488380 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP17.36■□□□□ 0.37
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NISCH-212ENST00000488380 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa17.36■□□□□ 0.37
NISCH-212ENST00000488380 DUSP27Q5VZP5 1158 aa17.36■□□□□ 0.37
NISCH-212ENST00000488380 TMEM132EQ6IEE7 984 aa17.35■□□□□ 0.37
NISCH-212ENST00000488380 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP17.35■□□□□ 0.37
NISCH-212ENST00000488380 KDM2BQ8NHM5 1336 aa17.35■□□□□ 0.37
NISCH-212ENST00000488380 ZNF521Q96K83 1311 aa17.34■□□□□ 0.37
NISCH-212ENST00000488380 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa17.34■□□□□ 0.37
NISCH-212ENST00000488380 NPATQ14207 1427 aa17.34■□□□□ 0.37
NISCH-212ENST00000488380 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP17.33■□□□□ 0.37
NISCH-212ENST00000488380 PIK3C2GO75747 1445 aa17.33■□□□□ 0.36
NISCH-212ENST00000488380 CD109Q6YHK3 1445 aa17.33■□□□□ 0.36
NISCH-212ENST00000488380 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP17.33■□□□□ 0.36
NISCH-212ENST00000488380 APAF1O14727 1248 aa17.32■□□□□ 0.36
NISCH-212ENST00000488380 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP17.32■□□□□ 0.36
NISCH-212ENST00000488380 RAPGEF3O95398 923 aa17.32■□□□□ 0.36
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