RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482936.5

RTEL1-TNFRSF6B-202, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P5 TSL 2 BASIC

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 4,931 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HMMRO75330 724 aa20.74■□□□□ 0.91
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CHMP3Q9Y3E7 222 aa20.74■□□□□ 0.91
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PTPN23Q9H3S7 1636 aa20.74■□□□□ 0.91
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FAM161AQ3B820 660 aa20.74■□□□□ 0.91
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ANKRD45Q5TZF3 282 aa20.74■□□□□ 0.91
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP20.73■□□□□ 0.91
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP20.73■□□□□ 0.91
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 EVC2Q86UK5 1308 aa20.73■□□□□ 0.91
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ARHGEF11O15085 1522 aa20.72■□□□□ 0.91
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DRC7Q8IY82 874 aa20.71■□□□□ 0.91
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CDCA7LQ96GN5 454 aa20.7■□□□□ 0.9
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP20.65■□□□□ 0.9
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa20.63■□□□□ 0.89
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CCDC184Q52MB2 194 aa20.62■□□□□ 0.89
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CHMP4AQ9BY43 222 aa20.59■□□□□ 0.89
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TAF7LQ5H9L4 462 aa20.58■□□□□ 0.89
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HDAC5Q9UQL6 1122 aa20.53■□□□□ 0.88
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 USP35Q9P2H5 1018 aa20.52■□□□□ 0.88
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PTMSP20962 102 aa20.52■□□□□ 0.87
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GSE1Q14687 1217 aa20.52■□□□□ 0.87
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RAPGEF3O95398 923 aa20.5■□□□□ 0.87
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ATP10BO94823 1461 aa20.49■□□□□ 0.87
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KIAA0556O60303 1618 aa20.49■□□□□ 0.87
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa20.49■□□□□ 0.87
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PPP2R1AP30153 589 aa20.49■□□□□ 0.87
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa20.49■□□□□ 0.87
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP20.48■□□□□ 0.87
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NUTM2GQ5VZR2 741 aa20.48■□□□□ 0.87
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TOMM22Q9NS69 142 aa20.47■□□□□ 0.87
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KIF16BQ96L93 1317 aa20.47■□□□□ 0.87
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PTPRKQ15262 1439 aa20.46■□□□□ 0.87
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C1orf141Q5JVX7 400 aa20.46■□□□□ 0.87
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CD109Q6YHK3 1445 aa20.46■□□□□ 0.87
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CFAP43Q8NDM7 1665 aa20.45■□□□□ 0.87
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