RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470089.5

FBXO18-208, Transcript of F-box DNA helicase 1, human

TSL 5

Gene FBXO18, Length 979 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FBXO18-208	ENST00000470089	CLTCL1	P53675	1640 aa		43.78	■■■■■ 4.6
FBXO18-208	ENST00000470089	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		43.76	■■■■■ 4.6
FBXO18-208	ENST00000470089	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	43.76	■■■■■ 4.6
FBXO18-208	ENST00000470089	BCAN	Q96GW7	911 aa		43.75	■■■■■ 4.59
FBXO18-208	ENST00000470089	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	43.74	■■■■■ 4.59
FBXO18-208	ENST00000470089	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		43.74	■■■■■ 4.59
FBXO18-208	ENST00000470089	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	43.72	■■■■■ 4.59
FBXO18-208	ENST00000470089	FOXD1	Q16676	465 aa		43.69	■■■■■ 4.58
FBXO18-208	ENST00000470089	PLEKHG1	Q9ULL1	1385 aa		43.68	■■■■■ 4.58
FBXO18-208	ENST00000470089	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	43.68	■■■■■ 4.58
FBXO18-208	ENST00000470089	KIF1B	O60333	1816 aa		43.66	■■■■■ 4.58
FBXO18-208	ENST00000470089	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		43.65	■■■■■ 4.58
FBXO18-208	ENST00000470089	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		43.64	■■■■■ 4.58
FBXO18-208	ENST00000470089	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		43.63	■■■■■ 4.58
FBXO18-208	ENST00000470089	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	43.63	■■■■■ 4.57
FBXO18-208	ENST00000470089	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		43.63	■■■■■ 4.57
FBXO18-208	ENST00000470089	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	43.52	■■■■■ 4.56
FBXO18-208	ENST00000470089	KCNA6	P17658	529 aa		43.52	■■■■■ 4.56
FBXO18-208	ENST00000470089	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	43.5	■■■■■ 4.55
FBXO18-208	ENST00000470089	ADAMTS13	Q76LX8	1427 aa		43.5	■■■■■ 4.55
FBXO18-208	ENST00000470089	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		43.49	■■■■■ 4.55
FBXO18-208	ENST00000470089	NWD1	Q149M9	1564 aa		43.48	■■■■■ 4.55
FBXO18-208	ENST00000470089	TBX22	Q9Y458	520 aa		43.47	■■■■■ 4.55
FBXO18-208	ENST00000470089	CHD2	O14647	1828 aa	Known RBP	43.47	■■■■■ 4.55
FBXO18-208	ENST00000470089	DIP2A	Q14689	1571 aa		43.45	■■■■■ 4.55
FBXO18-208	ENST00000470089	TOM1	O60784	492 aa		43.43	■■■■■ 4.54
FBXO18-208	ENST00000470089	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		43.42	■■■■■ 4.54
FBXO18-208	ENST00000470089	NRXN3	Q9Y4C0	1643 aa		43.42	■■■■■ 4.54
FBXO18-208	ENST00000470089	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	43.42	■■■■■ 4.54
FBXO18-208	ENST00000470089	PIP4K2B	P78356	416 aa		43.41	■■■■■ 4.54
FBXO18-208	ENST00000470089	NKTR	P30414	1462 aa	Known RBP	43.39	■■■■■ 4.54
FBXO18-208	ENST00000470089	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	43.39	■■■■■ 4.54
FBXO18-208	ENST00000470089	RBM33	Q96EV2	1170 aa	Known RBP	43.39	■■■■■ 4.54
FBXO18-208	ENST00000470089	ALK	Q9UM73	1620 aa		43.39	■■■■■ 4.54
FBXO18-208	ENST00000470089	SETBP1	Q9Y6X0	1596 aa		43.38	■■■■■ 4.54
FBXO18-208	ENST00000470089	TMEM94	Q12767	1356 aa		43.38	■■■■■ 4.53
FBXO18-208	ENST00000470089	PPL	O60437	1756 aa		43.32	■■■■■ 4.53
FBXO18-208	ENST00000470089	PIK3R4	Q99570	1358 aa		43.29	■■■■■ 4.52
FBXO18-208	ENST00000470089	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		43.28	■■■■■ 4.52
FBXO18-208	ENST00000470089	HRC	P23327	699 aa		43.27	■■■■■ 4.52
FBXO18-208	ENST00000470089	RGL3	Q3MIN7	710 aa		43.27	■■■■■ 4.52
FBXO18-208	ENST00000470089	PTPRU	Q92729	1446 aa		43.26	■■■■■ 4.52
FBXO18-208	ENST00000470089	VGF	O15240	615 aa	Predicted RBP	43.26	■■■■■ 4.52
FBXO18-208	ENST00000470089	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		43.25	■■■■■ 4.51
FBXO18-208	ENST00000470089	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		43.22	■■■■■ 4.51
FBXO18-208	ENST00000470089	MET	P08581	1390 aa		43.21	■■■■■ 4.51
FBXO18-208	ENST00000470089	IFT172	Q9UG01	1749 aa		43.17	■■■■■ 4.5
FBXO18-208	ENST00000470089	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	43.17	■■■■■ 4.5
FBXO18-208	ENST00000470089	SETD1A	O15047	1707 aa	Known RBP	43.14	■■■■■ 4.5
FBXO18-208	ENST00000470089	MSH6	P52701	1360 aa		43.14	■■■■■ 4.5
FBXO18-208	ENST00000470089	HSPA1L	P34931	641 aa		43.13	■■■■■ 4.49
FBXO18-208	ENST00000470089	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		43.11	■■■■■ 4.49
FBXO18-208	ENST00000470089	ADGRF5	Q8IZF2	1346 aa		43.1	■■■■■ 4.49
FBXO18-208	ENST00000470089	C14orf37	Q86TY3	774 aa		43.09	■■■■■ 4.49
FBXO18-208	ENST00000470089	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		43.05	■■■■■ 4.48
FBXO18-208	ENST00000470089	SIPA1L2	Q9P2F8	1722 aa	Predicted RBP	43	■■■■■ 4.47
FBXO18-208	ENST00000470089	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		42.95	■■■■■ 4.47
FBXO18-208	ENST00000470089	C19orf44	Q9H6X5	657 aa		42.94	■■■■■ 4.46
FBXO18-208	ENST00000470089	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		42.94	■■■■■ 4.46
FBXO18-208	ENST00000470089	PIK3C2G	O75747	1445 aa		42.92	■■■■■ 4.46
FBXO18-208	ENST00000470089	SLAIN2	Q9P270	581 aa		42.92	■■■■■ 4.46
FBXO18-208	ENST00000470089	ATF3	P18847	181 aa		42.89	■■■■■ 4.46
FBXO18-208	ENST00000470089	MYOM2	P54296	1465 aa		42.87	■■■■■ 4.45
FBXO18-208	ENST00000470089	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		42.87	■■■■■ 4.45
FBXO18-208	ENST00000470089	CADPS2	Q86UW7	1296 aa		42.86	■■■■■ 4.45
FBXO18-208	ENST00000470089	PTCH1	Q13635	1447 aa		42.86	■■■■■ 4.45
FBXO18-208	ENST00000470089	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		42.85	■■■■■ 4.45
FBXO18-208	ENST00000470089	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		42.83	■■■■■ 4.45
FBXO18-208	ENST00000470089	NRXN1	Q9ULB1	1477 aa		42.83	■■■■■ 4.45
FBXO18-208	ENST00000470089	ADGRL3	Q9HAR2	1447 aa		42.81	■■■■■ 4.44
FBXO18-208	ENST00000470089	TMEM132E	Q6IEE7	984 aa		42.81	■■■■■ 4.44
FBXO18-208	ENST00000470089	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		42.8	■■■■■ 4.44
FBXO18-208	ENST00000470089	STK26	Q9P289	416 aa		42.79	■■■■■ 4.44
FBXO18-208	ENST00000470089	DCC	P43146	1447 aa		42.79	■■■■■ 4.44
FBXO18-208	ENST00000470089	KDM2A	Q9Y2K7	1162 aa		42.77	■■■■■ 4.44
FBXO18-208	ENST00000470089	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		42.77	■■■■■ 4.44
FBXO18-208	ENST00000470089	CFAP70	Q5T0N1	1121 aa		42.75	■■■■■ 4.43
FBXO18-208	ENST00000470089	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		42.75	■■■■■ 4.43
FBXO18-208	ENST00000470089	C14orf93	Q9H972	538 aa	Known RBP	42.75	■■■■■ 4.43
FBXO18-208	ENST00000470089	LAMC1	P11047	1609 aa		42.74	■■■■■ 4.43
FBXO18-208	ENST00000470089	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	42.73	■■■■■ 4.43
FBXO18-208	ENST00000470089	LRPPRC	P42704	1394 aa	Known RBP	42.73	■■■■■ 4.43
FBXO18-208	ENST00000470089	KNDC1	Q76NI1	1749 aa		42.71	■■■■■ 4.43
FBXO18-208	ENST00000470089	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	42.7	■■■■■ 4.43
FBXO18-208	ENST00000470089	PHLPP1	O60346	1717 aa		42.7	■■■■■ 4.43
FBXO18-208	ENST00000470089	MST1R	Q04912	1400 aa		42.69	■■■■■ 4.42
FBXO18-208	ENST00000470089	YTHDC2	Q9H6S0	1430 aa	Known RBP	42.69	■■■■■ 4.42
FBXO18-208	ENST00000470089	TECPR2	O15040	1411 aa		42.68	■■■■■ 4.42
FBXO18-208	ENST00000470089	ABCC11	Q96J66	1382 aa		42.65	■■■■■ 4.42
FBXO18-208	ENST00000470089	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	42.65	■■■■■ 4.42
FBXO18-208	ENST00000470089	WAPL	Q7Z5K2	1190 aa		42.64	■■■■■ 4.42
FBXO18-208	ENST00000470089	BRINP3	Q76B58	766 aa		42.62	■■■■■ 4.41
FBXO18-208	ENST00000470089	PLEKHH1	Q9ULM0	1364 aa		42.59	■■■■■ 4.41
FBXO18-208	ENST00000470089	STAC3	Q96MF2	364 aa		42.57	■■■■■ 4.41
FBXO18-208	ENST00000470089	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	42.56	■■■■■ 4.4
FBXO18-208	ENST00000470089	AHDC1	Q5TGY3	1603 aa	Predicted RBP	42.55	■■■■■ 4.4
FBXO18-208	ENST00000470089	ADGRB1	O14514	1584 aa		42.53	■■■■■ 4.4
FBXO18-208	ENST00000470089	C1orf167	Q5SNV9	1468 aa		42.53	■■■■■ 4.4
FBXO18-208	ENST00000470089	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		42.51	■■■■■ 4.4
FBXO18-208	ENST00000470089	CDC42BPG	Q6DT37	1551 aa		42.51	■■■■■ 4.4

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