RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460297.1

NME4-209, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 4, humanhuman

TSL 5

Gene NME4, Length 1,652 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4-209ENST00000460297 MYO3AQ8NEV4 1616 aa34.6■■■■□ 3.13
NME4-209ENST00000460297 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa34.56■■■■□ 3.12
NME4-209ENST00000460297 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP34.55■■■■□ 3.12
NME4-209ENST00000460297 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa34.54■■■■□ 3.12
NME4-209ENST00000460297 RALGAPBQ86X10 1494 aa34.54■■■■□ 3.12
NME4-209ENST00000460297 NRXN1Q9ULB1 1477 aa34.53■■■■□ 3.12
NME4-209ENST00000460297 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa34.53■■■■□ 3.12
NME4-209ENST00000460297 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP34.49■■■■□ 3.11
NME4-209ENST00000460297 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP34.47■■■■□ 3.11
NME4-209ENST00000460297 ZFYVE9O95405 1425 aa34.47■■■■□ 3.11
NME4-209ENST00000460297 RIMS2Q9UQ26 1411 aa34.46■■■■□ 3.11
NME4-209ENST00000460297 VGFO15240 615 aaPredicted RBP34.46■■■■□ 3.11
NME4-209ENST00000460297 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP34.45■■■■□ 3.11
NME4-209ENST00000460297 PIK3C2GO75747 1445 aa34.44■■■■□ 3.1
NME4-209ENST00000460297 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa34.43■■■■□ 3.1
NME4-209ENST00000460297 TMEM2Q9UHN6 1383 aa34.42■■■■□ 3.1
NME4-209ENST00000460297 NBPF1Q3BBV0 1214 aa34.42■■■■□ 3.1
NME4-209ENST00000460297 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP34.4■■■■□ 3.1
NME4-209ENST00000460297 GPRASP1Q5JY77 1395 aa34.37■■■■□ 3.09
NME4-209ENST00000460297 SLIT1O75093 1534 aa34.37■■■■□ 3.09
NME4-209ENST00000460297 CFAP70Q5T0N1 1121 aa34.36■■■■□ 3.09
NME4-209ENST00000460297 ARHGAP23Q9P227 1491 aa34.35■■■■□ 3.09
NME4-209ENST00000460297 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP34.35■■■■□ 3.09
NME4-209ENST00000460297 CARD11Q9BXL7 1154 aa34.35■■■■□ 3.09
NME4-209ENST00000460297 LAMC1P11047 1609 aa34.34■■■■□ 3.09
NME4-209ENST00000460297 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP34.34■■■■□ 3.09
NME4-209ENST00000460297 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP34.32■■■■□ 3.08
NME4-209ENST00000460297 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP34.31■■■■□ 3.08
NME4-209ENST00000460297 HDGFP51858 240 aaKnown RBP34.3■■■■□ 3.08
NME4-209ENST00000460297 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP34.3■■■■□ 3.08
NME4-209ENST00000460297 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP34.29■■■■□ 3.08
NME4-209ENST00000460297 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP34.29■■■■□ 3.08
NME4-209ENST00000460297 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP34.28■■■■□ 3.08
NME4-209ENST00000460297 LTKP29376 864 aa34.28■■■■□ 3.08
NME4-209ENST00000460297 USP47Q96K76 1375 aa34.27■■■■□ 3.08
NME4-209ENST00000460297 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa34.27■■■■□ 3.08
NME4-209ENST00000460297 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa34.26■■■■□ 3.07
NME4-209ENST00000460297 TXNDC2Q86VQ3 553 aa34.25■■■■□ 3.07
NME4-209ENST00000460297 ADGRB1O14514 1584 aa34.24■■■■□ 3.07
NME4-209ENST00000460297 ALKQ9UM73 1620 aa34.24■■■■□ 3.07
NME4-209ENST00000460297 IQGAP1P46940 1657 aa34.23■■■■□ 3.07
NME4-209ENST00000460297 EID1Q9Y6B2 187 aa34.22■■■■□ 3.07
NME4-209ENST00000460297 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP34.21■■■■□ 3.07
NME4-209ENST00000460297 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa34.19■■■■□ 3.06
NME4-209ENST00000460297 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP34.19■■■■□ 3.06
NME4-209ENST00000460297 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa34.19■■■■□ 3.06
NME4-209ENST00000460297 TMEM132EQ6IEE7 984 aa34.18■■■■□ 3.06
NME4-209ENST00000460297 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa34.12■■■■□ 3.05
NME4-209ENST00000460297 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa34.12■■■■□ 3.05
NME4-209ENST00000460297 ANKLE2Q86XL3 938 aa34.1■■■■□ 3.05
NME4-209ENST00000460297 BCANQ96GW7 911 aa34.09■■■■□ 3.05
NME4-209ENST00000460297 MED14O60244 1454 aa34.08■■■■□ 3.05
NME4-209ENST00000460297 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP34.07■■■■□ 3.04
NME4-209ENST00000460297 LMTK3Q96Q04 1460 aa34.06■■■■□ 3.04
NME4-209ENST00000460297 METP08581 1390 aa34.05■■■■□ 3.04
NME4-209ENST00000460297 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP34.04■■■■□ 3.04
NME4-209ENST00000460297 TRAK1Q9UPV9 953 aa34.03■■■■□ 3.04
NME4-209ENST00000460297 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP34.02■■■■□ 3.04
NME4-209ENST00000460297 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP34.02■■■■□ 3.04
NME4-209ENST00000460297 SLC26A8Q96RN1 970 aa34.02■■■■□ 3.04
NME4-209ENST00000460297 DIP2AQ14689 1571 aa34■■■■□ 3.03
NME4-209ENST00000460297 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP33.99■■■■□ 3.03
NME4-209ENST00000460297 TESK2Q96S53 571 aa33.99■■■■□ 3.03
NME4-209ENST00000460297 STK26Q9P289 416 aa33.99■■■■□ 3.03
NME4-209ENST00000460297 HSPA2P54652 639 aa33.98■■■■□ 3.03
NME4-209ENST00000460297 TBX22Q9Y458 520 aa33.98■■■■□ 3.03
NME4-209ENST00000460297 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa33.97■■■■□ 3.03
NME4-209ENST00000460297 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP33.96■■■■□ 3.03
NME4-209ENST00000460297 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP33.94■■■■□ 3.02
NME4-209ENST00000460297 WASHC2AQ641Q2 1341 aa33.94■■■■□ 3.02
NME4-209ENST00000460297 ABCC11Q96J66 1382 aa33.92■■■■□ 3.02
NME4-209ENST00000460297 KNDC1Q76NI1 1749 aa33.91■■■■□ 3.02
NME4-209ENST00000460297 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP33.91■■■■□ 3.02
NME4-209ENST00000460297 QRICH2Q9H0J4 1663 aa33.91■■■■□ 3.02
NME4-209ENST00000460297 DLC1Q96QB1 1528 aa33.9■■■■□ 3.02
NME4-209ENST00000460297 PTPRUQ92729 1446 aa33.89■■■■□ 3.02
NME4-209ENST00000460297 CCDC7Q96M83 1385 aa33.89■■■■□ 3.02
NME4-209ENST00000460297 KIF7Q2M1P5 1343 aa33.88■■■■□ 3.01
NME4-209ENST00000460297 TECPR2O15040 1411 aa33.87■■■■□ 3.01
NME4-209ENST00000460297 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa33.86■■■■□ 3.01
NME4-209ENST00000460297 DISP3Q9P2K9 1392 aa33.85■■■■□ 3.01
NME4-209ENST00000460297 CPS1P31327 1500 aa33.85■■■■□ 3.01
NME4-209ENST00000460297 STRCQ7RTU9 1775 aa33.85■■■■□ 3.01
NME4-209ENST00000460297 PRAM1Q96QH2 718 aa33.84■■■■□ 3.01
NME4-209ENST00000460297 PIK3R4Q99570 1358 aa33.82■■■■□ 3.01
NME4-209ENST00000460297 TMF1P82094 1093 aa33.81■■■■□ 3
NME4-209ENST00000460297 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP33.81■■■■□ 3
NME4-209ENST00000460297 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP33.81■■■■□ 3
NME4-209ENST00000460297 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP33.8■■■■□ 34e-27■■■■■ 42.2
NME4-209ENST00000460297 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa33.8■■■■□ 3
NME4-209ENST00000460297 POGKQ9P215 609 aa33.79■■■■□ 3
NME4-209ENST00000460297 WAPLQ7Z5K2 1190 aa33.78■■■■□ 3
NME4-209ENST00000460297 SIRT1Q96EB6 747 aa33.78■■■■□ 3
NME4-209ENST00000460297 ROBO2Q9HCK4 1378 aa33.78■■■■□ 3
NME4-209ENST00000460297 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa33.78■■■■□ 3
NME4-209ENST00000460297 FAM135BQ49AJ0 1406 aa33.78■■■■□ 3
NME4-209ENST00000460297 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP33.77■■■■□ 3
NME4-209ENST00000460297 SLC24A1O60721 1099 aa33.75■■■□□ 2.99
NME4-209ENST00000460297 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP33.74■■■□□ 2.99
NME4-209ENST00000460297 POLR3GLQ9BT43 218 aa33.73■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.5 ms