RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000450873.6

RABGEF1-205, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 2,281 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-205ENST00000450873 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
RABGEF1-205ENST00000450873 PCGF6Q9BYE7 350 aa15.64■□□□□ 0.09
RABGEF1-205ENST00000450873 SLC52A1Q9NWF4 448 aa15.64■□□□□ 0.09
RABGEF1-205ENST00000450873 EID1Q9Y6B2 187 aa15.64■□□□□ 0.09
RABGEF1-205ENST00000450873 SOCS7O14512 581 aa15.63■□□□□ 0.09
RABGEF1-205ENST00000450873 HSPA1LP34931 641 aa15.63■□□□□ 0.09
RABGEF1-205ENST00000450873 TMEM2Q9UHN6 1383 aa15.63■□□□□ 0.09
RABGEF1-205ENST00000450873 STAG3Q9UJ98 1225 aa15.61■□□□□ 0.09
RABGEF1-205ENST00000450873 IDI1Q13907 227 aa15.6■□□□□ 0.09
RABGEF1-205ENST00000450873 ADGRB3O60242 1522 aa15.59■□□□□ 0.09
RABGEF1-205ENST00000450873 FOXD1Q16676 465 aa15.59■□□□□ 0.09
RABGEF1-205ENST00000450873 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa15.58■□□□□ 0.08
RABGEF1-205ENST00000450873 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
RABGEF1-205ENST00000450873 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
RABGEF1-205ENST00000450873 TRPM2O94759 1503 aa15.56■□□□□ 0.08
RABGEF1-205ENST00000450873 CHGAP10645 457 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.08
RABGEF1-205ENST00000450873 KCNA6P17658 529 aa15.52■□□□□ 0.07
RABGEF1-205ENST00000450873 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa15.51■□□□□ 0.07
RABGEF1-205ENST00000450873 CCDC144AA2RUR9 1427 aa15.51■□□□□ 0.07
RABGEF1-205ENST00000450873 NWD1Q149M9 1564 aa15.51■□□□□ 0.07
RABGEF1-205ENST00000450873 CLTCL1P53675 1640 aa15.5■□□□□ 0.07
RABGEF1-205ENST00000450873 ZFYVE9O95405 1425 aa15.5■□□□□ 0.07
RABGEF1-205ENST00000450873 MYO5BQ9ULV0 1848 aa15.5■□□□□ 0.07
RABGEF1-205ENST00000450873 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa15.5■□□□□ 0.07
RABGEF1-205ENST00000450873 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
RABGEF1-205ENST00000450873 TMEM94Q12767 1356 aa15.49■□□□□ 0.07
RABGEF1-205ENST00000450873 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
RABGEF1-205ENST00000450873 SLC26A8Q96RN1 970 aa15.48■□□□□ 0.07
RABGEF1-205ENST00000450873 HDGFP51858 240 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
RABGEF1-205ENST00000450873 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa15.48■□□□□ 0.07
RABGEF1-205ENST00000450873 RIMS2Q9UQ26 1411 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGEF1-205ENST00000450873 FAM135BQ49AJ0 1406 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGEF1-205ENST00000450873 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
RABGEF1-205ENST00000450873 KIF1BO60333 1816 aa15.46■□□□□ 0.07
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.06
RABGEF1-205ENST00000450873 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
RABGEF1-205ENST00000450873 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP15.45■□□□□ 0.06
RABGEF1-205ENST00000450873 BCANQ96GW7 911 aa15.45■□□□□ 0.06
RABGEF1-205ENST00000450873 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP15.43■□□□□ 0.06
RABGEF1-205ENST00000450873 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa15.43■□□□□ 0.06
RABGEF1-205ENST00000450873 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP15.43■□□□□ 0.06
RABGEF1-205ENST00000450873 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP15.43■□□□□ 0.06
RABGEF1-205ENST00000450873 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa15.42■□□□□ 0.06
RABGEF1-205ENST00000450873 TBX22Q9Y458 520 aa15.42■□□□□ 0.06
RABGEF1-205ENST00000450873 DIP2AQ14689 1571 aa15.41■□□□□ 0.06
RABGEF1-205ENST00000450873 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa15.41■□□□□ 0.06
RABGEF1-205ENST00000450873 RGL3Q3MIN7 710 aa15.41■□□□□ 0.06
RABGEF1-205ENST00000450873 MSH6P52701 1360 aa15.4■□□□□ 0.06
RABGEF1-205ENST00000450873 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa15.39■□□□□ 0.05
RABGEF1-205ENST00000450873 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa15.38■□□□□ 0.05
RABGEF1-205ENST00000450873 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
RABGEF1-205ENST00000450873 VGFO15240 615 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
RABGEF1-205ENST00000450873 PIK3R4Q99570 1358 aa15.38■□□□□ 0.05
RABGEF1-205ENST00000450873 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
RABGEF1-205ENST00000450873 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa15.37■□□□□ 0.05
RABGEF1-205ENST00000450873 SIN3AQ96ST3 1273 aa15.36■□□□□ 0.05
RABGEF1-205ENST00000450873 NEUROD1Q13562 356 aa15.34■□□□□ 0.05
RABGEF1-205ENST00000450873 SLAIN2Q9P270 581 aa15.34■□□□□ 0.05
RABGEF1-205ENST00000450873 CLSPNQ9HAW4 1339 aa15.34■□□□□ 0.05
RABGEF1-205ENST00000450873 STAC3Q96MF2 364 aa15.34■□□□□ 0.05
RABGEF1-205ENST00000450873 PPLO60437 1756 aa15.33■□□□□ 0.04
RABGEF1-205ENST00000450873 PHLPP1O60346 1717 aa15.33■□□□□ 0.04
RABGEF1-205ENST00000450873 MYT1Q01538 1121 aa15.32■□□□□ 0.04
RABGEF1-205ENST00000450873 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP15.32■□□□□ 0.04
RABGEF1-205ENST00000450873 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP15.32■□□□□ 0.04
RABGEF1-205ENST00000450873 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa15.31■□□□□ 0.04
RABGEF1-205ENST00000450873 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa15.31■□□□□ 0.04
RABGEF1-205ENST00000450873 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP15.31■□□□□ 0.04
RABGEF1-205ENST00000450873 DCAF11Q8TEB1 546 aa15.31■□□□□ 0.04
RABGEF1-205ENST00000450873 IFT172Q9UG01 1749 aa15.3■□□□□ 0.04
RABGEF1-205ENST00000450873 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa15.29■□□□□ 0.04
RABGEF1-205ENST00000450873 PTPRUQ92729 1446 aa15.29■□□□□ 0.04
RABGEF1-205ENST00000450873 MYOM2P54296 1465 aa15.29■□□□□ 0.04
RABGEF1-205ENST00000450873 C14orf37Q86TY3 774 aa15.29■□□□□ 0.04
RABGEF1-205ENST00000450873 C19orf44Q9H6X5 657 aa15.29■□□□□ 0.04
RABGEF1-205ENST00000450873 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa15.29■□□□□ 0.04
RABGEF1-205ENST00000450873 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP15.29■□□□□ 0.04
RABGEF1-205ENST00000450873 JCADQ9P266 1359 aa15.28■□□□□ 0.04
RABGEF1-205ENST00000450873 CADPS2Q86UW7 1296 aa15.28■□□□□ 0.04
RABGEF1-205ENST00000450873 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa15.28■□□□□ 0.04
RABGEF1-205ENST00000450873 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP15.28■□□□□ 0.04
RABGEF1-205ENST00000450873 L3MBTL2Q969R5 705 aa15.27■□□□□ 0.04
RABGEF1-205ENST00000450873 ATF3P18847 181 aa15.27■□□□□ 0.03
RABGEF1-205ENST00000450873 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP15.26■□□□□ 0.03
RABGEF1-205ENST00000450873 NRXN1Q9ULB1 1477 aa15.26■□□□□ 0.03
RABGEF1-205ENST00000450873 DCCP43146 1447 aa15.25■□□□□ 0.03
RABGEF1-205ENST00000450873 TONSLQ96HA7 1378 aa15.25■□□□□ 0.03
RABGEF1-205ENST00000450873 PIK3C2GO75747 1445 aa15.25■□□□□ 0.03
RABGEF1-205ENST00000450873 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
RABGEF1-205ENST00000450873 POTEAQ6S8J7 498 aa15.23■□□□□ 0.03
RABGEF1-205ENST00000450873 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa15.22■□□□□ 0.03
RABGEF1-205ENST00000450873 METP08581 1390 aa15.22■□□□□ 0.03
RABGEF1-205ENST00000450873 SHPRHQ149N8 1683 aa15.22■□□□□ 0.03
RABGEF1-205ENST00000450873 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa15.21■□□□□ 0.03
RABGEF1-205ENST00000450873 CFAP70Q5T0N1 1121 aa15.2■□□□□ 0.02
RABGEF1-205ENST00000450873 BRINP3Q76B58 766 aa15.19■□□□□ 0.02
RABGEF1-205ENST00000450873 MST1RQ04912 1400 aa15.18■□□□□ 0.02
RABGEF1-205ENST00000450873 PRAG1Q86YV5 1406 aa15.18■□□□□ 0.02
RABGEF1-205ENST00000450873 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa15.18■□□□□ 0.02
RABGEF1-205ENST00000450873 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.5 ms