RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444916.5

SH3BP4-205, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene SH3BP4, Length 570 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-205ENST00000444916 STAG3Q9UJ98 1225 aa21.35■■□□□ 1.01
SH3BP4-205ENST00000444916 TMEM2Q9UHN6 1383 aa21.34■■□□□ 1.01
SH3BP4-205ENST00000444916 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
SH3BP4-205ENST00000444916 TXNDC2Q86VQ3 553 aa21.32■■□□□ 1
SH3BP4-205ENST00000444916 MYO5BQ9ULV0 1848 aa21.29■■□□□ 1
SH3BP4-205ENST00000444916 EID1Q9Y6B2 187 aa21.29■■□□□ 1
SH3BP4-205ENST00000444916 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa21.29■■□□□ 1
SH3BP4-205ENST00000444916 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa21.29■■□□□ 1
SH3BP4-205ENST00000444916 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP21.23■□□□□ 0.99
SH3BP4-205ENST00000444916 ZFYVE9O95405 1425 aa21.22■□□□□ 0.99
SH3BP4-205ENST00000444916 POTEAQ6S8J7 498 aa21.22■□□□□ 0.99
SH3BP4-205ENST00000444916 TRIM52Q96A61 297 aa21.22■□□□□ 0.99
SH3BP4-205ENST00000444916 TMEM94Q12767 1356 aa21.22■□□□□ 0.99
SH3BP4-205ENST00000444916 FAM135BQ49AJ0 1406 aa21.21■□□□□ 0.99
SH3BP4-205ENST00000444916 TRPM2O94759 1503 aa21.19■□□□□ 0.98
SH3BP4-205ENST00000444916 CHGAP10645 457 aaKnown RBP21.19■□□□□ 0.98
SH3BP4-205ENST00000444916 RIMS2Q9UQ26 1411 aa21.19■□□□□ 0.98
SH3BP4-205ENST00000444916 SLC26A8Q96RN1 970 aa21.18■□□□□ 0.98
SH3BP4-205ENST00000444916 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa21.16■□□□□ 0.98
SH3BP4-205ENST00000444916 CLTCL1P53675 1640 aa21.16■□□□□ 0.98
SH3BP4-205ENST00000444916 HDGFP51858 240 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
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SH3BP4-205ENST00000444916 KCNA6P17658 529 aa21.15■□□□□ 0.98
SH3BP4-205ENST00000444916 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa21.14■□□□□ 0.98
SH3BP4-205ENST00000444916 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP21.14■□□□□ 0.97
SH3BP4-205ENST00000444916 SETD5Q9C0A6 1442 aa21.13■□□□□ 0.97
SH3BP4-205ENST00000444916 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP21.13■□□□□ 0.97
SH3BP4-205ENST00000444916 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP21.13■□□□□ 0.97
SH3BP4-205ENST00000444916 KIF1BO60333 1816 aa21.11■□□□□ 0.97
SH3BP4-205ENST00000444916 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP21.11■□□□□ 0.97
SH3BP4-205ENST00000444916 BCANQ96GW7 911 aa21.09■□□□□ 0.97
SH3BP4-205ENST00000444916 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
SH3BP4-205ENST00000444916 NWD1Q149M9 1564 aa21.07■□□□□ 0.96
SH3BP4-205ENST00000444916 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP21.07■□□□□ 0.96
SH3BP4-205ENST00000444916 DIP2AQ14689 1571 aa21.06■□□□□ 0.96
SH3BP4-205ENST00000444916 MPHOSPH9Q99550 1183 aa21.06■□□□□ 0.96
SH3BP4-205ENST00000444916 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa21.06■□□□□ 0.96
SH3BP4-205ENST00000444916 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa21.04■□□□□ 0.96
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SH3BP4-205ENST00000444916 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP21.04■□□□□ 0.96
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SH3BP4-205ENST00000444916 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP21.04■□□□□ 0.96
SH3BP4-205ENST00000444916 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP21.04■□□□□ 0.96
SH3BP4-205ENST00000444916 PHLPP1O60346 1717 aa21.04■□□□□ 0.96
SH3BP4-205ENST00000444916 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa21.04■□□□□ 0.96
SH3BP4-205ENST00000444916 MSH6P52701 1360 aa21.03■□□□□ 0.96
SH3BP4-205ENST00000444916 TBX22Q9Y458 520 aa21.02■□□□□ 0.96
SH3BP4-205ENST00000444916 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa21.02■□□□□ 0.95
SH3BP4-205ENST00000444916 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa21■□□□□ 0.95
SH3BP4-205ENST00000444916 CCDC144AA2RUR9 1427 aa21■□□□□ 0.95
SH3BP4-205ENST00000444916 PIK3R4Q99570 1358 aa20.98■□□□□ 0.95
SH3BP4-205ENST00000444916 JCADQ9P266 1359 aa20.98■□□□□ 0.95
SH3BP4-205ENST00000444916 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP20.96■□□□□ 0.95
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SH3BP4-205ENST00000444916 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa20.92■□□□□ 0.94
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SH3BP4-205ENST00000444916 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
SH3BP4-205ENST00000444916 PTPRUQ92729 1446 aa20.9■□□□□ 0.94
SH3BP4-205ENST00000444916 C14orf37Q86TY3 774 aa20.89■□□□□ 0.93
SH3BP4-205ENST00000444916 IFT172Q9UG01 1749 aa20.89■□□□□ 0.93
SH3BP4-205ENST00000444916 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa20.87■□□□□ 0.93
SH3BP4-205ENST00000444916 METP08581 1390 aa20.87■□□□□ 0.93
SH3BP4-205ENST00000444916 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
SH3BP4-205ENST00000444916 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP20.87■□□□□ 0.93
SH3BP4-205ENST00000444916 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa20.87■□□□□ 0.93
SH3BP4-205ENST00000444916 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
SH3BP4-205ENST00000444916 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa20.86■□□□□ 0.93
SH3BP4-205ENST00000444916 RGL3Q3MIN7 710 aa20.85■□□□□ 0.93
SH3BP4-205ENST00000444916 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa20.85■□□□□ 0.93
SH3BP4-205ENST00000444916 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
SH3BP4-205ENST00000444916 ATF3P18847 181 aa20.82■□□□□ 0.92
SH3BP4-205ENST00000444916 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
SH3BP4-205ENST00000444916 C19orf44Q9H6X5 657 aa20.82■□□□□ 0.92
SH3BP4-205ENST00000444916 SHPRHQ149N8 1683 aa20.82■□□□□ 0.92
SH3BP4-205ENST00000444916 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
SH3BP4-205ENST00000444916 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
SH3BP4-205ENST00000444916 CADPS2Q86UW7 1296 aa20.81■□□□□ 0.92
SH3BP4-205ENST00000444916 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
SH3BP4-205ENST00000444916 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa20.8■□□□□ 0.92
SH3BP4-205ENST00000444916 BRINP3Q76B58 766 aa20.79■□□□□ 0.92
SH3BP4-205ENST00000444916 PRAG1Q86YV5 1406 aa20.78■□□□□ 0.92
SH3BP4-205ENST00000444916 PIK3C2GO75747 1445 aa20.77■□□□□ 0.91
SH3BP4-205ENST00000444916 PTCH1Q13635 1447 aa20.77■□□□□ 0.91
SH3BP4-205ENST00000444916 MYOM2P54296 1465 aa20.76■□□□□ 0.91
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SH3BP4-205ENST00000444916 DCCP43146 1447 aa20.75■□□□□ 0.91
SH3BP4-205ENST00000444916 NRXN1Q9ULB1 1477 aa20.74■□□□□ 0.91
SH3BP4-205ENST00000444916 AFF2P51816 1311 aa20.73■□□□□ 0.91
SH3BP4-205ENST00000444916 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa20.73■□□□□ 0.91
SH3BP4-205ENST00000444916 NALCNQ8IZF0 1738 aa20.73■□□□□ 0.91
SH3BP4-205ENST00000444916 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa20.72■□□□□ 0.91
SH3BP4-205ENST00000444916 ROBO2Q9HCK4 1378 aa20.72■□□□□ 0.91
SH3BP4-205ENST00000444916 LAMC1P11047 1609 aa20.71■□□□□ 0.91
SH3BP4-205ENST00000444916 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP20.71■□□□□ 0.91
SH3BP4-205ENST00000444916 MST1RQ04912 1400 aa20.7■□□□□ 0.9
SH3BP4-205ENST00000444916 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP20.69■□□□□ 0.9
SH3BP4-205ENST00000444916 KNDC1Q76NI1 1749 aa20.68■□□□□ 0.9
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