RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000431155.1

GRAMD4-204, Transcript of GRAM domain containing 4, humanhuman

TSL 3

Gene GRAMD4, Length 311 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD4-204ENST00000431155 SLC26A8Q96RN1 970 aa45.56■■■■■ 4.88
GRAMD4-204ENST00000431155 BCANQ96GW7 911 aa45.55■■■■■ 4.88
GRAMD4-204ENST00000431155 HDGFP51858 240 aaKnown RBP45.54■■■■■ 4.88
GRAMD4-204ENST00000431155 UBAP1LF5GYI3 381 aa45.52■■■■■ 4.88
GRAMD4-204ENST00000431155 TRPM2O94759 1503 aa45.52■■■■■ 4.88
GRAMD4-204ENST00000431155 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP45.51■■■■■ 4.88
GRAMD4-204ENST00000431155 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP45.49■■■■■ 4.87
GRAMD4-204ENST00000431155 CLTCL1P53675 1640 aa45.48■■■■■ 4.87
GRAMD4-204ENST00000431155 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa45.48■■■■■ 4.87
GRAMD4-204ENST00000431155 LRRC7Q96NW7 1537 aa45.47■■■■■ 4.87
GRAMD4-204ENST00000431155 SETD5Q9C0A6 1442 aa45.45■■■■■ 4.87
GRAMD4-204ENST00000431155 FOXD1Q16676 465 aa45.41■■■■■ 4.86
GRAMD4-204ENST00000431155 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP45.4■■■■■ 4.86
GRAMD4-204ENST00000431155 MPHOSPH9Q99550 1183 aa45.36■■■■■ 4.85
GRAMD4-204ENST00000431155 KCNA6P17658 529 aa45.35■■■■■ 4.85
GRAMD4-204ENST00000431155 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa45.32■■■■■ 4.84
GRAMD4-204ENST00000431155 TOM1O60784 492 aa45.3■■■■■ 4.84
GRAMD4-204ENST00000431155 KIF1BO60333 1816 aa45.3■■■■■ 4.84
GRAMD4-204ENST00000431155 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa45.28■■■■■ 4.84
GRAMD4-204ENST00000431155 TBX22Q9Y458 520 aa45.28■■■■■ 4.84
GRAMD4-204ENST00000431155 PIP4K2BP78356 416 aa45.26■■■■■ 4.84
GRAMD4-204ENST00000431155 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP45.26■■■■■ 4.84
GRAMD4-204ENST00000431155 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP45.26■■■■■ 4.84
GRAMD4-204ENST00000431155 NWD1Q149M9 1564 aa45.25■■■■■ 4.83
GRAMD4-204ENST00000431155 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa45.22■■■■■ 4.83
GRAMD4-204ENST00000431155 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP45.22■■■■■ 4.83
GRAMD4-204ENST00000431155 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP45.21■■■■■ 4.83
GRAMD4-204ENST00000431155 ALKQ9UM73 1620 aa45.21■■■■■ 4.83
GRAMD4-204ENST00000431155 DIP2AQ14689 1571 aa45.2■■■■■ 4.83
GRAMD4-204ENST00000431155 TMEM94Q12767 1356 aa45.2■■■■■ 4.83
GRAMD4-204ENST00000431155 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP45.19■■■■■ 4.82
GRAMD4-204ENST00000431155 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP45.18■■■■■ 4.82
GRAMD4-204ENST00000431155 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP45.17■■■■■ 4.82
GRAMD4-204ENST00000431155 CCDC144AA2RUR9 1427 aa45.15■■■■■ 4.82
GRAMD4-204ENST00000431155 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa45.14■■■■■ 4.82
GRAMD4-204ENST00000431155 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa45.13■■■■■ 4.82
GRAMD4-204ENST00000431155 PIK3R4Q99570 1358 aa45.08■■■■■ 4.81
GRAMD4-204ENST00000431155 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa45.05■■■■■ 4.8
GRAMD4-204ENST00000431155 PTPRUQ92729 1446 aa45.03■■■■■ 4.8
GRAMD4-204ENST00000431155 VGFO15240 615 aaPredicted RBP45.02■■■■■ 4.8
GRAMD4-204ENST00000431155 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa45.01■■■■■ 4.8
GRAMD4-204ENST00000431155 HSPA1LP34931 641 aa44.99■■■■■ 4.79
GRAMD4-204ENST00000431155 RGL3Q3MIN7 710 aa44.99■■■■■ 4.79
GRAMD4-204ENST00000431155 METP08581 1390 aa44.98■■■■■ 4.79
GRAMD4-204ENST00000431155 PPLO60437 1756 aa44.98■■■■■ 4.79
GRAMD4-204ENST00000431155 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa44.98■■■■■ 4.79
GRAMD4-204ENST00000431155 HRCP23327 699 aa44.97■■■■■ 4.79
GRAMD4-204ENST00000431155 MSH6P52701 1360 aa44.94■■■■■ 4.78
GRAMD4-204ENST00000431155 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP44.89■■■■■ 4.78
GRAMD4-204ENST00000431155 C14orf37Q86TY3 774 aa44.88■■■■■ 4.78
GRAMD4-204ENST00000431155 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa44.86■■■■■ 4.77
GRAMD4-204ENST00000431155 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa44.83■■■■■ 4.77
GRAMD4-204ENST00000431155 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP44.81■■■■■ 4.76
GRAMD4-204ENST00000431155 IFT172Q9UG01 1749 aa44.81■■■■■ 4.76
GRAMD4-204ENST00000431155 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa44.81■■■■■ 4.76
GRAMD4-204ENST00000431155 FAM135BQ49AJ0 1406 aa44.77■■■■■ 4.76
GRAMD4-204ENST00000431155 C19orf44Q9H6X5 657 aa44.75■■■■■ 4.75
GRAMD4-204ENST00000431155 SLAIN2Q9P270 581 aa44.74■■■■■ 4.75
GRAMD4-204ENST00000431155 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP44.72■■■■■ 4.75
GRAMD4-204ENST00000431155 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa44.71■■■■■ 4.75
GRAMD4-204ENST00000431155 ATF3P18847 181 aa44.68■■■■■ 4.74
GRAMD4-204ENST00000431155 DISP3Q9P2K9 1392 aa44.67■■■■■ 4.74
GRAMD4-204ENST00000431155 CADPS2Q86UW7 1296 aa44.66■■■■■ 4.74
GRAMD4-204ENST00000431155 PIK3C2GO75747 1445 aa44.64■■■■■ 4.74
GRAMD4-204ENST00000431155 ROBO2Q9HCK4 1378 aa44.62■■■■■ 4.73
GRAMD4-204ENST00000431155 PTCH1Q13635 1447 aa44.61■■■■■ 4.73
GRAMD4-204ENST00000431155 MYOM2P54296 1465 aa44.58■■■■■ 4.73
GRAMD4-204ENST00000431155 DCCP43146 1447 aa44.57■■■■■ 4.72
GRAMD4-204ENST00000431155 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa44.57■■■■■ 4.72
GRAMD4-204ENST00000431155 PRAG1Q86YV5 1406 aa44.56■■■■■ 4.72
GRAMD4-204ENST00000431155 NRXN1Q9ULB1 1477 aa44.54■■■■■ 4.72
GRAMD4-204ENST00000431155 TMEM132EQ6IEE7 984 aa44.54■■■■■ 4.72
GRAMD4-204ENST00000431155 NALCNQ8IZF0 1738 aa44.54■■■■■ 4.72
GRAMD4-204ENST00000431155 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa44.53■■■■■ 4.72
GRAMD4-204ENST00000431155 STK26Q9P289 416 aa44.51■■■■■ 4.72
GRAMD4-204ENST00000431155 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP44.48■■■■■ 4.71
GRAMD4-204ENST00000431155 CFAP70Q5T0N1 1121 aa44.47■■■■■ 4.71
GRAMD4-204ENST00000431155 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP44.46■■■■■ 4.71
GRAMD4-204ENST00000431155 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP44.46■■■■■ 4.71
GRAMD4-204ENST00000431155 MST1RQ04912 1400 aa44.45■■■■■ 4.71
GRAMD4-204ENST00000431155 DCAF11Q8TEB1 546 aa44.45■■■■■ 4.71
GRAMD4-204ENST00000431155 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa44.45■■■■■ 4.71
GRAMD4-204ENST00000431155 PHLPP1O60346 1717 aa44.43■■■■■ 4.7
GRAMD4-204ENST00000431155 TECPR2O15040 1411 aa44.41■■■■■ 4.7
GRAMD4-204ENST00000431155 BRINP3Q76B58 766 aa44.41■■■■■ 4.7
GRAMD4-204ENST00000431155 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP44.41■■■■■ 4.7
GRAMD4-204ENST00000431155 ABCC11Q96J66 1382 aa44.4■■■■■ 4.7
GRAMD4-204ENST00000431155 LAMC1P11047 1609 aa44.39■■■■■ 4.7
GRAMD4-204ENST00000431155 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP44.38■■■■■ 4.69
GRAMD4-204ENST00000431155 WAPLQ7Z5K2 1190 aa44.37■■■■■ 4.69
GRAMD4-204ENST00000431155 KNDC1Q76NI1 1749 aa44.36■■■■■ 4.69
GRAMD4-204ENST00000431155 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP44.32■■■■■ 4.68
GRAMD4-204ENST00000431155 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP44.32■■■■■ 4.68
GRAMD4-204ENST00000431155 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa44.31■■■■■ 4.68
GRAMD4-204ENST00000431155 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP44.29■■■■■ 4.68
GRAMD4-204ENST00000431155 STAC3Q96MF2 364 aa44.29■■■■■ 4.68
GRAMD4-204ENST00000431155 C1orf167Q5SNV9 1468 aa44.28■■■■■ 4.68
GRAMD4-204ENST00000431155 ILDR2Q71H61 639 aa44.27■■■■■ 4.68
GRAMD4-204ENST00000431155 ADGRB1O14514 1584 aa44.22■■■■■ 4.67
GRAMD4-204ENST00000431155 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa44.22■■■■■ 4.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41 ms