RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429504.6

CERS1-201, Transcript of ceramide synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CERS1, Length 2,094 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CERS1-201ENST00000429504 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa37.33■■■■□ 3.57
CERS1-201ENST00000429504 PANK3Q9H999 370 aa37.32■■■■□ 3.56
CERS1-201ENST00000429504 MROH2AA6NES4 1674 aa37.3■■■■□ 3.56
CERS1-201ENST00000429504 SYNMO15061 1565 aa37.29■■■■□ 3.56
CERS1-201ENST00000429504 ABCA6Q8N139 1617 aa37.29■■■■□ 3.56
CERS1-201ENST00000429504 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP37.29■■■■□ 3.56
CERS1-201ENST00000429504 PPP4R2Q9NY27 417 aa37.29■■■■□ 3.56
CERS1-201ENST00000429504 NEO1Q92859 1461 aa37.27■■■■□ 3.56
CERS1-201ENST00000429504 CDCA8Q53HL2 280 aa37.25■■■■□ 3.55
CERS1-201ENST00000429504 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa37.25■■■■□ 3.55
CERS1-201ENST00000429504 ADGRB3O60242 1522 aa37.23■■■■□ 3.55
CERS1-201ENST00000429504 INSRP06213 1382 aa37.22■■■■□ 3.55
CERS1-201ENST00000429504 NRXN1Q9ULB1 1477 aa37.22■■■■□ 3.55
CERS1-201ENST00000429504 RNF123Q5XPI4 1314 aa37.21■■■■□ 3.55
CERS1-201ENST00000429504 MYOM1P52179 1685 aa37.2■■■■□ 3.55
CERS1-201ENST00000429504 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP37.18■■■■□ 3.54
CERS1-201ENST00000429504 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP37.18■■■■□ 3.54
CERS1-201ENST00000429504 NPATQ14207 1427 aa37.17■■■■□ 3.54
CERS1-201ENST00000429504 ABCC3O15438 1527 aa37.13■■■■□ 3.53
CERS1-201ENST00000429504 SLC24A1O60721 1099 aa37.13■■■■□ 3.53
CERS1-201ENST00000429504 PPLO60437 1756 aa37.13■■■■□ 3.53
CERS1-201ENST00000429504 MYO3AQ8NEV4 1616 aa37.13■■■■□ 3.53
CERS1-201ENST00000429504 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa37.13■■■■□ 3.53
CERS1-201ENST00000429504 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP37.12■■■■□ 3.53
CERS1-201ENST00000429504 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa37.1■■■■□ 3.53
CERS1-201ENST00000429504 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa37.09■■■■□ 3.53
CERS1-201ENST00000429504 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP37.09■■■■□ 3.53
CERS1-201ENST00000429504 RICTORQ6R327 1708 aa37.09■■■■□ 3.53
CERS1-201ENST00000429504 CFAP70Q5T0N1 1121 aa37.08■■■■□ 3.53
CERS1-201ENST00000429504 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa37.08■■■■□ 3.53
CERS1-201ENST00000429504 KNSTRNQ9Y448 316 aa37.08■■■■□ 3.53
CERS1-201ENST00000429504 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa37.06■■■■□ 3.52
CERS1-201ENST00000429504 GGT6Q6P531 493 aa37.04■■■■□ 3.52
CERS1-201ENST00000429504 NOS1P29475 1434 aa37.04■■■■□ 3.52
CERS1-201ENST00000429504 PDE3BQ13370 1112 aa37.03■■■■□ 3.52
CERS1-201ENST00000429504 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa37.03■■■■□ 3.52
CERS1-201ENST00000429504 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP37.03■■■■□ 3.52
CERS1-201ENST00000429504 ERVK-7P63135 1459 aa37.02■■■■□ 3.52
CERS1-201ENST00000429504 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa37.02■■■■□ 3.52
CERS1-201ENST00000429504 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP37.01■■■■□ 3.52
CERS1-201ENST00000429504 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa37■■■■□ 3.51
CERS1-201ENST00000429504 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP37■■■■□ 3.51
CERS1-201ENST00000429504 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa36.99■■■■□ 3.51
CERS1-201ENST00000429504 PIK3C2GO75747 1445 aa36.99■■■■□ 3.51
CERS1-201ENST00000429504 PIK3C2BO00750 1634 aa36.99■■■■□ 3.51
CERS1-201ENST00000429504 RAPGEF3O95398 923 aa36.97■■■■□ 3.51
CERS1-201ENST00000429504 GLI2P10070 1586 aa36.96■■■■□ 3.51
CERS1-201ENST00000429504 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa36.95■■■■□ 3.51
CERS1-201ENST00000429504 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa36.94■■■■□ 3.5
CERS1-201ENST00000429504 PPP2R1AP30153 589 aa36.92■■■■□ 3.5
CERS1-201ENST00000429504 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa36.91■■■■□ 3.5
CERS1-201ENST00000429504 CHGAP10645 457 aaKnown RBP36.9■■■■□ 3.5
CERS1-201ENST00000429504 ADGRB1O14514 1584 aa36.9■■■■□ 3.5
CERS1-201ENST00000429504 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP36.87■■■■□ 3.49
CERS1-201ENST00000429504 QRICH2Q9H0J4 1663 aa36.86■■■■□ 3.49
CERS1-201ENST00000429504 DIP2BQ9P265 1576 aa36.85■■■■□ 3.49
CERS1-201ENST00000429504 FAM69CQ0P6D2 419 aa36.84■■■■□ 3.49
CERS1-201ENST00000429504 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP36.84■■■■□ 3.49
CERS1-201ENST00000429504 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP36.81■■■■□ 3.48
CERS1-201ENST00000429504 RCAN3Q9UKA8 241 aa36.81■■■■□ 3.48
CERS1-201ENST00000429504 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa36.8■■■■□ 3.48
CERS1-201ENST00000429504 YEATS2Q9ULM3 1422 aa36.8■■■■□ 3.48
CERS1-201ENST00000429504 RRP1P56182 461 aaKnown RBP36.79■■■■□ 3.48
CERS1-201ENST00000429504 ADAMTS8Q9UP79 889 aa36.79■■■■□ 3.48
CERS1-201ENST00000429504 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP36.76■■■■□ 3.47
CERS1-201ENST00000429504 CDCA7LQ96GN5 454 aa36.72■■■■□ 3.47
CERS1-201ENST00000429504 CCDC136Q96JN2 1154 aa36.72■■■■□ 3.47
CERS1-201ENST00000429504 PREX1Q8TCU6 1659 aa36.72■■■■□ 3.47
CERS1-201ENST00000429504 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP36.71■■■■□ 3.47
CERS1-201ENST00000429504 TRAK1Q9UPV9 953 aa36.7■■■■□ 3.47
CERS1-201ENST00000429504 VGFO15240 615 aaPredicted RBP36.7■■■■□ 3.46
CERS1-201ENST00000429504 CARD14Q9BXL6 1004 aa36.7■■■■□ 3.46
CERS1-201ENST00000429504 MYT1Q01538 1121 aa36.68■■■■□ 3.46
CERS1-201ENST00000429504 ZFYVE9O95405 1425 aa36.68■■■■□ 3.46
CERS1-201ENST00000429504 SLC52A1Q9NWF4 448 aa36.66■■■■□ 3.46
CERS1-201ENST00000429504 MYO5BQ9ULV0 1848 aa36.66■■■■□ 3.46
CERS1-201ENST00000429504 USP32Q8NFA0 1604 aa36.64■■■■□ 3.46
CERS1-201ENST00000429504 TMEM132EQ6IEE7 984 aa36.63■■■■□ 3.45
CERS1-201ENST00000429504 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa36.62■■■■□ 3.45
CERS1-201ENST00000429504 IDI1Q13907 227 aa36.61■■■■□ 3.45
CERS1-201ENST00000429504 FANCIQ9NVI1 1328 aa36.61■■■■□ 3.45
CERS1-201ENST00000429504 REREQ9P2R6 1566 aa36.6■■■■□ 3.45
CERS1-201ENST00000429504 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa36.6■■■■□ 3.45
CERS1-201ENST00000429504 ZNF521Q96K83 1311 aa36.59■■■■□ 3.45
CERS1-201ENST00000429504 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP36.58■■■■□ 3.45
CERS1-201ENST00000429504 NSD3Q9BZ95 1437 aa36.57■■■■□ 3.44
CERS1-201ENST00000429504 TSPOAP1O95153 1857 aa36.55■■■■□ 3.44
CERS1-201ENST00000429504 TULP4Q9NRJ4 1543 aa36.54■■■■□ 3.44
CERS1-201ENST00000429504 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP36.52■■■■□ 3.44
CERS1-201ENST00000429504 KIF13AQ9H1H9 1805 aa36.52■■■■□ 3.44
CERS1-201ENST00000429504 EXOC6Q8TAG9 804 aa36.51■■■■□ 3.44
CERS1-201ENST00000429504 AGLP35573 1532 aa36.51■■■■□ 3.44
CERS1-201ENST00000429504 EVC2Q86UK5 1308 aa36.5■■■■□ 3.43
CERS1-201ENST00000429504 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP36.5■■■■□ 3.43
CERS1-201ENST00000429504 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa36.49■■■■□ 3.43
CERS1-201ENST00000429504 GOLGA2Q08379 1002 aa36.47■■■■□ 3.43
CERS1-201ENST00000429504 DUSP27Q5VZP5 1158 aa36.46■■■■□ 3.43
CERS1-201ENST00000429504 SHPRHQ149N8 1683 aa36.44■■■■□ 3.42
CERS1-201ENST00000429504 NGEFQ8N5V2 710 aa36.44■■■■□ 3.42
CERS1-201ENST00000429504 ANP32EQ9BTT0 268 aa36.43■■■■□ 3.42
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