RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400183.6

USP25-204, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP25, Length 5,341 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-204ENST00000400183 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
USP25-204ENST00000400183 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
USP25-204ENST00000400183 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa22.72■■□□□ 1.23
USP25-204ENST00000400183 EVA1CP58658 441 aa22.72■■□□□ 1.23
USP25-204ENST00000400183 WIZO95785 1651 aa22.71■■□□□ 1.23
USP25-204ENST00000400183 PES1O00541 588 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
USP25-204ENST00000400183 SLC4A3P48751 1232 aa22.71■■□□□ 1.23
USP25-204ENST00000400183 BECN2A8MW95 431 aa22.71■■□□□ 1.23
USP25-204ENST00000400183 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
USP25-204ENST00000400183 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
USP25-204ENST00000400183 PDE4CQ08493 712 aa22.7■■□□□ 1.22
USP25-204ENST00000400183 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
USP25-204ENST00000400183 VSIG10Q8N0Z9 540 aa22.7■■□□□ 1.22
USP25-204ENST00000400183 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
USP25-204ENST00000400183 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
USP25-204ENST00000400183 RIPK4P57078 832 aa22.67■■□□□ 1.22
USP25-204ENST00000400183 MCTP1Q6DN14 999 aa22.66■■□□□ 1.22
USP25-204ENST00000400183 DDX58O95786 925 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
USP25-204ENST00000400183 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
USP25-204ENST00000400183 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
USP25-204ENST00000400183 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
USP25-204ENST00000400183 ROCK1Q13464 1354 aa22.65■■□□□ 1.22
USP25-204ENST00000400183 TPM1P09493 284 aa22.65■■□□□ 1.22
USP25-204ENST00000400183 AMOTL1Q8IY63 956 aa22.64■■□□□ 1.22
USP25-204ENST00000400183 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
USP25-204ENST00000400183 TRIM29Q14134 588 aa22.63■■□□□ 1.21
USP25-204ENST00000400183 PRM3Q9NNZ6 103 aa22.63■■□□□ 1.21
USP25-204ENST00000400183 TPM2P07951 284 aa22.63■■□□□ 1.21
USP25-204ENST00000400183 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa22.63■■□□□ 1.21
USP25-204ENST00000400183 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
USP25-204ENST00000400183 RUNDC1Q96C34 613 aa22.62■■□□□ 1.21
USP25-204ENST00000400183 STAC3Q96MF2 364 aa22.61■■□□□ 1.21
USP25-204ENST00000400183 CPLX1O14810 134 aa22.61■■□□□ 1.21
USP25-204ENST00000400183 RNF20Q5VTR2 975 aa22.61■■□□□ 1.21
USP25-204ENST00000400183 MYOM3Q5VTT5 1437 aa22.61■■□□□ 1.21
USP25-204ENST00000400183 ANO2Q9NQ90 1003 aa22.6■■□□□ 1.21
USP25-204ENST00000400183 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP22.6■■□□□ 1.21
USP25-204ENST00000400183 PSME1Q06323 249 aa22.6■■□□□ 1.21
USP25-204ENST00000400183 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.6■■□□□ 1.21
USP25-204ENST00000400183 NECTIN2Q92692 538 aa22.59■■□□□ 1.21
USP25-204ENST00000400183 APPP05067 770 aa22.59■■□□□ 1.21
USP25-204ENST00000400183 GNAI1P63096 354 aa22.59■■□□□ 1.21
USP25-204ENST00000400183 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP22.58■■□□□ 1.21
USP25-204ENST00000400183 TRDNQ13061 729 aa22.58■■□□□ 1.21
USP25-204ENST00000400183 CYB5RLQ6IPT4 315 aa22.57■■□□□ 1.2
USP25-204ENST00000400183 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa22.57■■□□□ 1.2
USP25-204ENST00000400183 CHMP5Q9NZZ3 219 aa22.56■■□□□ 1.2
USP25-204ENST00000400183 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
USP25-204ENST00000400183 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
USP25-204ENST00000400183 MSH5O43196 834 aa22.55■■□□□ 1.2
USP25-204ENST00000400183 TRIM34Q9BYJ4 488 aa22.55■■□□□ 1.2
USP25-204ENST00000400183 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.54■■□□□ 1.2
USP25-204ENST00000400183 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
USP25-204ENST00000400183 TSPYL4Q9UJ04 414 aa22.54■■□□□ 1.2
USP25-204ENST00000400183 VPS37DQ86XT2 251 aa22.54■■□□□ 1.2
USP25-204ENST00000400183 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
USP25-204ENST00000400183 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa22.53■■□□□ 1.2
USP25-204ENST00000400183 CCDC70Q6NSX1 233 aa22.52■■□□□ 1.2
USP25-204ENST00000400183 BICD2Q8TD16 824 aa22.52■■□□□ 1.2
USP25-204ENST00000400183 AAMPQ13685 434 aa22.52■■□□□ 1.2
USP25-204ENST00000400183 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
USP25-204ENST00000400183 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa22.52■■□□□ 1.2
USP25-204ENST00000400183 ERC2O15083 957 aa22.51■■□□□ 1.19
USP25-204ENST00000400183 RAD21O60216 631 aa22.51■■□□□ 1.19
USP25-204ENST00000400183 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
USP25-204ENST00000400183 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa22.51■■□□□ 1.19
USP25-204ENST00000400183 OSCARQ8IYS5 282 aa22.5■■□□□ 1.19
USP25-204ENST00000400183 CCDC7Q96M83 1385 aa22.5■■□□□ 1.19
USP25-204ENST00000400183 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
USP25-204ENST00000400183 SMC3Q9UQE7 1217 aa22.49■■□□□ 1.19
USP25-204ENST00000400183 KIF7Q2M1P5 1343 aa22.49■■□□□ 1.19
USP25-204ENST00000400183 NUCB2P80303 420 aa22.49■■□□□ 1.19
USP25-204ENST00000400183 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
USP25-204ENST00000400183 GPS2Q13227 327 aa22.49■■□□□ 1.19
USP25-204ENST00000400183 LNPKQ9C0E8 428 aa22.49■■□□□ 1.19
USP25-204ENST00000400183 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
USP25-204ENST00000400183 MIA2Q96PC5 1412 aa22.48■■□□□ 1.19
USP25-204ENST00000400183 NFXL1Q6ZNB6 911 aa22.48■■□□□ 1.19
USP25-204ENST00000400183 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
USP25-204ENST00000400183 ERICH2A1L162 156 aa22.48■■□□□ 1.19
USP25-204ENST00000400183 HMOX1P09601 288 aa22.48■■□□□ 1.19
USP25-204ENST00000400183 FGD6Q6ZV73 1430 aa22.46■■□□□ 1.19
USP25-204ENST00000400183 GGNBP2Q9H3C7 697 aa22.46■■□□□ 1.19
USP25-204ENST00000400183 ZNF592Q92610 1267 aa22.45■■□□□ 1.18
USP25-204ENST00000400183 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.44■■□□□ 1.18
USP25-204ENST00000400183 RIC3Q7Z5B4 369 aa22.44■■□□□ 1.18
USP25-204ENST00000400183 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP22.43■■□□□ 1.18
USP25-204ENST00000400183 C22orf23Q9BZE7 217 aa22.43■■□□□ 1.18
USP25-204ENST00000400183 IGF1RP08069 1367 aa22.43■■□□□ 1.18
USP25-204ENST00000400183 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
USP25-204ENST00000400183 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
USP25-204ENST00000400183 SMARCA4P51532 1647 aa22.42■■□□□ 1.18
USP25-204ENST00000400183 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa22.42■■□□□ 1.18
USP25-204ENST00000400183 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
USP25-204ENST00000400183 SASS6Q6UVJ0 657 aa22.41■■□□□ 1.18
USP25-204ENST00000400183 NEUROD6Q96NK8 337 aa22.41■■□□□ 1.18
USP25-204ENST00000400183 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa22.4■■□□□ 1.18
USP25-204ENST00000400183 CUX1P39880 1505 aa22.4■■□□□ 1.18
USP25-204ENST00000400183 CNTLNQ9NXG0 1405 aa22.4■■□□□ 1.18
USP25-204ENST00000400183 HOMER1Q86YM7 354 aa22.4■■□□□ 1.18
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