RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373779.7

PTPRU-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 5,579 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-202ENST00000373779 UNC13AQ9UPW8 1703 aa21.7■■□□□ 1.06
PTPRU-202ENST00000373779 VGFO15240 615 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
PTPRU-202ENST00000373779 CHMP5Q9NZZ3 219 aa21.69■■□□□ 1.06
PTPRU-202ENST00000373779 ARHGAP5Q13017 1502 aa21.68■■□□□ 1.06
PTPRU-202ENST00000373779 ST18O60284 1047 aa21.68■■□□□ 1.06
PTPRU-202ENST00000373779 STK31Q9BXU1 1019 aa21.68■■□□□ 1.06
PTPRU-202ENST00000373779 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
PTPRU-202ENST00000373779 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa21.67■■□□□ 1.06
PTPRU-202ENST00000373779 SYNJ2O15056 1496 aa21.67■■□□□ 1.06
PTPRU-202ENST00000373779 LMOD2Q6P5Q4 547 aa21.66■■□□□ 1.06
PTPRU-202ENST00000373779 ERBINQ96RT1 1412 aa21.65■■□□□ 1.06
PTPRU-202ENST00000373779 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
PTPRU-202ENST00000373779 KIAA2012Q0VF49 1180 aa21.65■■□□□ 1.06
PTPRU-202ENST00000373779 IQGAP2Q13576 1575 aa21.64■■□□□ 1.06
PTPRU-202ENST00000373779 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa21.64■■□□□ 1.06
PTPRU-202ENST00000373779 SLC4A10Q6U841 1118 aa21.64■■□□□ 1.06
PTPRU-202ENST00000373779 ABCC5O15440 1437 aa21.64■■□□□ 1.05
PTPRU-202ENST00000373779 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
PTPRU-202ENST00000373779 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
PTPRU-202ENST00000373779 RIPK4P57078 832 aa21.62■■□□□ 1.05
PTPRU-202ENST00000373779 MRC2Q9UBG0 1479 aa21.62■■□□□ 1.05
PTPRU-202ENST00000373779 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
PTPRU-202ENST00000373779 C22orf23Q9BZE7 217 aa21.62■■□□□ 1.05
PTPRU-202ENST00000373779 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
PTPRU-202ENST00000373779 IFT140Q96RY7 1462 aa21.61■■□□□ 1.05
PTPRU-202ENST00000373779 DRC7Q8IY82 874 aa21.61■■□□□ 1.05
PTPRU-202ENST00000373779 PDE3AQ14432 1141 aa21.61■■□□□ 1.05
PTPRU-202ENST00000373779 KIF16BQ96L93 1317 aa21.6■■□□□ 1.05
PTPRU-202ENST00000373779 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
PTPRU-202ENST00000373779 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRU-202ENST00000373779 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
PTPRU-202ENST00000373779 TCP11L2Q8N4U5 519 aa21.58■■□□□ 1.05
PTPRU-202ENST00000373779 BCAR3O75815 825 aa21.58■■□□□ 1.05
PTPRU-202ENST00000373779 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
PTPRU-202ENST00000373779 NRDCO43847 1150 aa21.58■■□□□ 1.04
PTPRU-202ENST00000373779 SCAPERQ9BY12 1400 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRU-202ENST00000373779 CFAP70Q5T0N1 1121 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRU-202ENST00000373779 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.56■■□□□ 1.04
PTPRU-202ENST00000373779 PTPRKQ15262 1439 aa21.56■■□□□ 1.04
PTPRU-202ENST00000373779 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa21.56■■□□□ 1.04
PTPRU-202ENST00000373779 MTHFSP49914 203 aa21.55■■□□□ 1.04
PTPRU-202ENST00000373779 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
PTPRU-202ENST00000373779 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
PTPRU-202ENST00000373779 LNPKQ9C0E8 428 aa21.54■■□□□ 1.04
PTPRU-202ENST00000373779 BRPF3Q9ULD4 1205 aa21.54■■□□□ 1.04
PTPRU-202ENST00000373779 A0A0G2JS52 829 aa21.54■■□□□ 1.04
PTPRU-202ENST00000373779 IL27Q8NEV9 243 aa21.54■■□□□ 1.04
PTPRU-202ENST00000373779 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa21.54■■□□□ 1.04
PTPRU-202ENST00000373779 NINLQ9Y2I6 1382 aa21.54■■□□□ 1.04
PTPRU-202ENST00000373779 COG3Q96JB2 828 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPRU-202ENST00000373779 PHF14O94880 888 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPRU-202ENST00000373779 CHMP4AQ9BY43 222 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPRU-202ENST00000373779 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
PTPRU-202ENST00000373779 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
PTPRU-202ENST00000373779 TAOK2Q9UL54 1235 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPRU-202ENST00000373779 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa21.52■■□□□ 1.04
PTPRU-202ENST00000373779 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPRU-202ENST00000373779 AFAP1Q8N556 730 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPRU-202ENST00000373779 GPATCH3Q96I76 525 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPRU-202ENST00000373779 GGNBP2Q9H3C7 697 aa21.49■■□□□ 1.03
PTPRU-202ENST00000373779 REC8O95072 547 aa21.49■■□□□ 1.03
PTPRU-202ENST00000373779 TMEM132EQ6IEE7 984 aa21.49■■□□□ 1.03
PTPRU-202ENST00000373779 ARID3AQ99856 593 aa21.49■■□□□ 1.03
PTPRU-202ENST00000373779 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
PTPRU-202ENST00000373779 CABP2Q9NPB3 220 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRU-202ENST00000373779 CFAP43Q8NDM7 1665 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRU-202ENST00000373779 AMPHP49418 695 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRU-202ENST00000373779 SLFN5Q08AF3 891 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRU-202ENST00000373779 RILPL2Q969X0 211 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRU-202ENST00000373779 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
PTPRU-202ENST00000373779 GNAI1P63096 354 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRU-202ENST00000373779 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPRU-202ENST00000373779 UGGT2Q9NYU1 1516 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPRU-202ENST00000373779 MRE11P49959 708 aa21.45■■□□□ 1.02
PTPRU-202ENST00000373779 HDAC5Q9UQL6 1122 aa21.45■■□□□ 1.02
PTPRU-202ENST00000373779 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
PTPRU-202ENST00000373779 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
PTPRU-202ENST00000373779 CCDC141Q6ZP82 1450 aa21.44■■□□□ 1.02
PTPRU-202ENST00000373779 ARHGEF11O15085 1522 aa21.43■■□□□ 1.02
PTPRU-202ENST00000373779 TRAK2O60296 914 aa21.43■■□□□ 1.02
PTPRU-202ENST00000373779 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
PTPRU-202ENST00000373779 WDR63Q8IWG1 891 aa21.43■■□□□ 1.02
PTPRU-202ENST00000373779 NUTM2FA1L443 756 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRU-202ENST00000373779 C20orf194Q5TEA3 1177 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRU-202ENST00000373779 NUCB2P80303 420 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRU-202ENST00000373779 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
PTPRU-202ENST00000373779 CDC45O75419 566 aa21.41■■□□□ 1.02
PTPRU-202ENST00000373779 HMOX1P09601 288 aa21.41■■□□□ 1.02
PTPRU-202ENST00000373779 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa21.41■■□□□ 1.02
PTPRU-202ENST00000373779 SKAP1Q86WV1 359 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRU-202ENST00000373779 PLB1Q6P1J6 1458 aa21.39■■□□□ 1.02
PTPRU-202ENST00000373779 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
PTPRU-202ENST00000373779 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
PTPRU-202ENST00000373779 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
PTPRU-202ENST00000373779 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
PTPRU-202ENST00000373779 KIF14Q15058 1648 aa21.38■■□□□ 1.01
PTPRU-202ENST00000373779 MVPQ14764 893 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
PTPRU-202ENST00000373779 MCTP1Q6DN14 999 aa21.37■■□□□ 1.01
PTPRU-202ENST00000373779 FAM43AQ8N2R8 423 aa21.37■■□□□ 1.01
PTPRU-202ENST00000373779 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.5 ms