RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373212.5

SH3BGRL-201, Transcript of SH3 domain binding glutamate rich protein like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BGRL, Length 1,923 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRL-201ENST00000373212 IFNL1Q8IU54 200 aa10.12□□□□□ -0.79
SH3BGRL-201ENST00000373212 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
SH3BGRL-201ENST00000373212 FHOD3Q2V2M9 1422 aa10.12□□□□□ -0.79
SH3BGRL-201ENST00000373212 EFCAB5A4FU69 1503 aa10.11□□□□□ -0.79
SH3BGRL-201ENST00000373212 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa10.11□□□□□ -0.79
SH3BGRL-201ENST00000373212 GPR37O15354 613 aa10.11□□□□□ -0.79
SH3BGRL-201ENST00000373212 MS4A4AQ96JQ5 239 aa10.1□□□□□ -0.79
SH3BGRL-201ENST00000373212 CCDC61Q9Y6R9 512 aa10.1□□□□□ -0.79
SH3BGRL-201ENST00000373212 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
SH3BGRL-201ENST00000373212 TRAIPQ9BWF2 469 aa10.09□□□□□ -0.79
SH3BGRL-201ENST00000373212 MAP2K5Q13163 448 aa10.09□□□□□ -0.79
SH3BGRL-201ENST00000373212 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa10.08□□□□□ -0.8
SH3BGRL-201ENST00000373212 NUTM2FA1L443 756 aa10.08□□□□□ -0.8
SH3BGRL-201ENST00000373212 IRF6O14896 467 aa10.08□□□□□ -0.8
SH3BGRL-201ENST00000373212 AMHR2Q16671 573 aa10.08□□□□□ -0.8
SH3BGRL-201ENST00000373212 CHADLQ6NUI6 762 aa10.08□□□□□ -0.8
SH3BGRL-201ENST00000373212 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
SH3BGRL-201ENST00000373212 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
SH3BGRL-201ENST00000373212 GOPCQ9HD26 462 aa10.08□□□□□ -0.8
SH3BGRL-201ENST00000373212 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa10.07□□□□□ -0.8
SH3BGRL-201ENST00000373212 KIF27Q86VH2 1401 aa10.07□□□□□ -0.8
SH3BGRL-201ENST00000373212 TOM1O60784 492 aa10.07□□□□□ -0.8
SH3BGRL-201ENST00000373212 MAGI2Q86UL8 1455 aa10.07□□□□□ -0.8
SH3BGRL-201ENST00000373212 MCM6Q14566 821 aa10.06□□□□□ -0.8
SH3BGRL-201ENST00000373212 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa10.06□□□□□ -0.8
SH3BGRL-201ENST00000373212 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
SH3BGRL-201ENST00000373212 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
SH3BGRL-201ENST00000373212 PDIA6Q15084 440 aa10.04□□□□□ -0.8
SH3BGRL-201ENST00000373212 EMILIN3Q9NT22 766 aa10.04□□□□□ -0.8
SH3BGRL-201ENST00000373212 SERPINA10Q9UK55 444 aa10.04□□□□□ -0.8
SH3BGRL-201ENST00000373212 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
SH3BGRL-201ENST00000373212 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
SH3BGRL-201ENST00000373212 POTEAQ6S8J7 498 aa10.03□□□□□ -0.8
SH3BGRL-201ENST00000373212 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
SH3BGRL-201ENST00000373212 HECW1Q76N89 1606 aa10.03□□□□□ -0.8
SH3BGRL-201ENST00000373212 C3P01024 1663 aa10.03□□□□□ -0.8
SH3BGRL-201ENST00000373212 TMCO4Q5TGY1 634 aa10.03□□□□□ -0.8
SH3BGRL-201ENST00000373212 MTMR7Q9Y216 660 aa10.03□□□□□ -0.8
SH3BGRL-201ENST00000373212 ATP10BO94823 1461 aa10.03□□□□□ -0.8
SH3BGRL-201ENST00000373212 GRXCR2A6NFK2 248 aa10.02□□□□□ -0.81
SH3BGRL-201ENST00000373212 C9orf84Q5VXU9 1444 aa10.02□□□□□ -0.81
SH3BGRL-201ENST00000373212 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa10.02□□□□□ -0.81
SH3BGRL-201ENST00000373212 MAP3K13O43283 966 aa10.01□□□□□ -0.81
SH3BGRL-201ENST00000373212 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
SH3BGRL-201ENST00000373212 ATP10AO60312 1499 aa10.01□□□□□ -0.81
SH3BGRL-201ENST00000373212 ALKQ9UM73 1620 aa10.01□□□□□ -0.81
SH3BGRL-201ENST00000373212 PITPNM1O00562 1244 aa10.01□□□□□ -0.81
SH3BGRL-201ENST00000373212 RGS22Q8NE09 1264 aa10.01□□□□□ -0.81
SH3BGRL-201ENST00000373212 POM121Q96HA1 1249 aa10.01□□□□□ -0.81
SH3BGRL-201ENST00000373212 CFAP74Q9C0B2 1584 aa10.01□□□□□ -0.81
SH3BGRL-201ENST00000373212 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa10□□□□□ -0.81
SH3BGRL-201ENST00000373212 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
SH3BGRL-201ENST00000373212 RETREG2Q8NC44 543 aa9.99□□□□□ -0.81
SH3BGRL-201ENST00000373212 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
SH3BGRL-201ENST00000373212 GNPATO15228 680 aa9.99□□□□□ -0.81
SH3BGRL-201ENST00000373212 MS4A1P11836 297 aa9.99□□□□□ -0.81
SH3BGRL-201ENST00000373212 FECHP22830 423 aa9.99□□□□□ -0.81
SH3BGRL-201ENST00000373212 GOLGA2Q08379 1002 aa9.99□□□□□ -0.81
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SH3BGRL-201ENST00000373212 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
SH3BGRL-201ENST00000373212 CPS1P31327 1500 aa9.98□□□□□ -0.81
SH3BGRL-201ENST00000373212 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
SH3BGRL-201ENST00000373212 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
SH3BGRL-201ENST00000373212 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP9.97□□□□□ -0.81
SH3BGRL-201ENST00000373212 PTPRKQ15262 1439 aa9.97□□□□□ -0.81
SH3BGRL-201ENST00000373212 RBM25P49756 843 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
SH3BGRL-201ENST00000373212 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
SH3BGRL-201ENST00000373212 GOLGA3Q08378 1498 aa9.97□□□□□ -0.81
SH3BGRL-201ENST00000373212 PLA2R1Q13018 1463 aa9.96□□□□□ -0.81
SH3BGRL-201ENST00000373212 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.81
SH3BGRL-201ENST00000373212 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
SH3BGRL-201ENST00000373212 ZNF428Q96B54 188 aa9.95□□□□□ -0.82
SH3BGRL-201ENST00000373212 DSG2Q14126 1118 aa9.94□□□□□ -0.82
SH3BGRL-201ENST00000373212 HIC1Q14526 733 aa9.94□□□□□ -0.82
SH3BGRL-201ENST00000373212 KIF12Q96FN5 646 aa9.94□□□□□ -0.82
SH3BGRL-201ENST00000373212 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa9.93□□□□□ -0.82
SH3BGRL-201ENST00000373212 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
SH3BGRL-201ENST00000373212 IRF5Q13568 498 aa9.92□□□□□ -0.82
SH3BGRL-201ENST00000373212 SHANK2Q9UPX8 1470 aa9.92□□□□□ -0.82
SH3BGRL-201ENST00000373212 IGSF3O75054 1194 aa9.92□□□□□ -0.82
SH3BGRL-201ENST00000373212 FCHSD2O94868 740 aa9.92□□□□□ -0.82
SH3BGRL-201ENST00000373212 SH3D19Q5HYK7 790 aa9.92□□□□□ -0.82
SH3BGRL-201ENST00000373212 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
SH3BGRL-201ENST00000373212 NPATQ14207 1427 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BGRL-201ENST00000373212 FBXW7Q969H0 707 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BGRL-201ENST00000373212 SCAPERQ9BY12 1400 aa9.9□□□□□ -0.82
SH3BGRL-201ENST00000373212 PLSCR2Q9NRY7 297 aa9.9□□□□□ -0.82
SH3BGRL-201ENST00000373212 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
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SH3BGRL-201ENST00000373212 REREQ9P2R6 1566 aa9.88□□□□□ -0.83
SH3BGRL-201ENST00000373212 MYO3AQ8NEV4 1616 aa9.88□□□□□ -0.83
SH3BGRL-201ENST00000373212 AGLP35573 1532 aa9.88□□□□□ -0.83
SH3BGRL-201ENST00000373212 OSBPP22059 807 aa9.88□□□□□ -0.83
SH3BGRL-201ENST00000373212 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP9.87□□□□□ -0.83
SH3BGRL-201ENST00000373212 CNTLNQ9NXG0 1405 aa9.87□□□□□ -0.83
SH3BGRL-201ENST00000373212 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa9.87□□□□□ -0.83
SH3BGRL-201ENST00000373212 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
SH3BGRL-201ENST00000373212 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
SH3BGRL-201ENST00000373212 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
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