RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369862.1

AMIGO1-201, Transcript of adhesion molecule with Ig like domain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene AMIGO1, Length 2,229 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMIGO1-201ENST00000369862 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa32.01■■■□□ 2.72
AMIGO1-201ENST00000369862 LMTK2Q8IWU2 1503 aa32.01■■■□□ 2.71
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AMIGO1-201ENST00000369862 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa31.98■■■□□ 2.71
AMIGO1-201ENST00000369862 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa31.98■■■□□ 2.71
AMIGO1-201ENST00000369862 BCL11AQ9H165 835 aa31.98■■■□□ 2.71
AMIGO1-201ENST00000369862 MROH2AA6NES4 1674 aa31.97■■■□□ 2.71
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AMIGO1-201ENST00000369862 GGT6Q6P531 493 aa31.84■■■□□ 2.69
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AMIGO1-201ENST00000369862 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP31.81■■■□□ 2.68
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AMIGO1-201ENST00000369862 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP31.81■■■□□ 2.68
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AMIGO1-201ENST00000369862 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP31.79■■■□□ 2.68
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AMIGO1-201ENST00000369862 PPP2R1AP30153 589 aa31.74■■■□□ 2.67
AMIGO1-201ENST00000369862 MYO3AQ8NEV4 1616 aa31.72■■■□□ 2.67
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AMIGO1-201ENST00000369862 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa31.72■■■□□ 2.67
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AMIGO1-201ENST00000369862 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa31.71■■■□□ 2.67
AMIGO1-201ENST00000369862 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa31.7■■■□□ 2.67
AMIGO1-201ENST00000369862 PIK3C2GO75747 1445 aa31.69■■■□□ 2.66
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AMIGO1-201ENST00000369862 SLC24A1O60721 1099 aa31.66■■■□□ 2.66
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AMIGO1-201ENST00000369862 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP31.55■■■□□ 2.64
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AMIGO1-201ENST00000369862 TMEM132EQ6IEE7 984 aa31.55■■■□□ 2.64
AMIGO1-201ENST00000369862 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa31.53■■■□□ 2.64
AMIGO1-201ENST00000369862 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP31.53■■■□□ 2.64
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AMIGO1-201ENST00000369862 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa31.52■■■□□ 2.64
AMIGO1-201ENST00000369862 GLI2P10070 1586 aa31.52■■■□□ 2.64
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AMIGO1-201ENST00000369862 VGFO15240 615 aaPredicted RBP31.43■■■□□ 2.62
AMIGO1-201ENST00000369862 MS4A1P11836 297 aa31.43■■■□□ 2.62
AMIGO1-201ENST00000369862 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP31.41■■■□□ 2.62
AMIGO1-201ENST00000369862 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa31.4■■■□□ 2.62
AMIGO1-201ENST00000369862 NSD3Q9BZ95 1437 aa31.4■■■□□ 2.62
AMIGO1-201ENST00000369862 MYO5BQ9ULV0 1848 aa31.39■■■□□ 2.62
AMIGO1-201ENST00000369862 PREX1Q8TCU6 1659 aa31.39■■■□□ 2.62
AMIGO1-201ENST00000369862 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa31.39■■■□□ 2.62
AMIGO1-201ENST00000369862 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa31.39■■■□□ 2.62
AMIGO1-201ENST00000369862 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa31.39■■■□□ 2.62
AMIGO1-201ENST00000369862 PLIN1O60240 522 aa31.38■■■□□ 2.61
AMIGO1-201ENST00000369862 CCDC146Q8IYE0 955 aa31.37■■■□□ 2.61
AMIGO1-201ENST00000369862 SLC52A1Q9NWF4 448 aa31.37■■■□□ 2.61
AMIGO1-201ENST00000369862 PDE4AP27815 886 aa31.36■■■□□ 2.61
AMIGO1-201ENST00000369862 DUSP27Q5VZP5 1158 aa31.36■■■□□ 2.61
AMIGO1-201ENST00000369862 DIP2BQ9P265 1576 aa31.36■■■□□ 2.61
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