RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368226.8

PTPRK-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRK, Length 6,087 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-207ENST00000368226 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
PTPRK-207ENST00000368226 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
PTPRK-207ENST00000368226 AFAP1Q8N556 730 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRK-207ENST00000368226 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
PTPRK-207ENST00000368226 H3BQV1 296 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRK-207ENST00000368226 ATF3P18847 181 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRK-207ENST00000368226 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
PTPRK-207ENST00000368226 IFFO2Q5TF58 517 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRK-207ENST00000368226 ZNF428Q96B54 188 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRK-207ENST00000368226 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
PTPRK-207ENST00000368226 PES1O00541 588 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
PTPRK-207ENST00000368226 APPP05067 770 aa15.93■□□□□ 0.14
PTPRK-207ENST00000368226 TPM4P67936 248 aa15.93■□□□□ 0.14
PTPRK-207ENST00000368226 NLRP2Q9NX02 1062 aa15.93■□□□□ 0.14
PTPRK-207ENST00000368226 TSPYL4Q9UJ04 414 aa15.92■□□□□ 0.14
PTPRK-207ENST00000368226 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa15.92■□□□□ 0.14
PTPRK-207ENST00000368226 MCTP1Q6DN14 999 aa15.91■□□□□ 0.14
PTPRK-207ENST00000368226 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
PTPRK-207ENST00000368226 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa15.91■□□□□ 0.14
PTPRK-207ENST00000368226 PRM3Q9NNZ6 103 aa15.91■□□□□ 0.14
PTPRK-207ENST00000368226 VPS37DQ86XT2 251 aa15.91■□□□□ 0.14
PTPRK-207ENST00000368226 FAM184AQ8NB25 1140 aa15.91■□□□□ 0.14
PTPRK-207ENST00000368226 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
PTPRK-207ENST00000368226 FOSBP53539 338 aa15.9■□□□□ 0.14
PTPRK-207ENST00000368226 FAM177BA6PVY3 158 aa15.9■□□□□ 0.14
PTPRK-207ENST00000368226 WWC1Q8IX03 1113 aa15.9■□□□□ 0.14
PTPRK-207ENST00000368226 MYOM3Q5VTT5 1437 aa15.9■□□□□ 0.14
PTPRK-207ENST00000368226 ARHGAP5Q13017 1502 aa15.89■□□□□ 0.13
PTPRK-207ENST00000368226 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
PTPRK-207ENST00000368226 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
PTPRK-207ENST00000368226 PTMSP20962 102 aa15.89■□□□□ 0.13
PTPRK-207ENST00000368226 ANO2Q9NQ90 1003 aa15.88■□□□□ 0.13
PTPRK-207ENST00000368226 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa15.88■□□□□ 0.13
PTPRK-207ENST00000368226 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP15.88■□□□□ 0.13
PTPRK-207ENST00000368226 TRIM34Q9BYJ4 488 aa15.88■□□□□ 0.13
PTPRK-207ENST00000368226 FGD6Q6ZV73 1430 aa15.88■□□□□ 0.13
PTPRK-207ENST00000368226 NLRP6P59044 892 aa15.88■□□□□ 0.13
PTPRK-207ENST00000368226 ESCO1Q5FWF5 840 aa15.87■□□□□ 0.13
PTPRK-207ENST00000368226 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
PTPRK-207ENST00000368226 FYB1O15117 783 aa15.87■□□□□ 0.13
PTPRK-207ENST00000368226 PDE4AP27815 886 aa15.87■□□□□ 0.13
PTPRK-207ENST00000368226 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
PTPRK-207ENST00000368226 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa15.86■□□□□ 0.13
PTPRK-207ENST00000368226 CFAP70Q5T0N1 1121 aa15.86■□□□□ 0.13
PTPRK-207ENST00000368226 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
PTPRK-207ENST00000368226 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
PTPRK-207ENST00000368226 KIF7Q2M1P5 1343 aa15.86■□□□□ 0.13
PTPRK-207ENST00000368226 CCDC34Q96HJ3 373 aa15.86■□□□□ 0.13
PTPRK-207ENST00000368226 KDM4AO75164 1064 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRK-207ENST00000368226 FAM161AQ3B820 660 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRK-207ENST00000368226 RUNDC1Q96C34 613 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRK-207ENST00000368226 RIC3Q7Z5B4 369 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRK-207ENST00000368226 STRN4Q9NRL3 753 aa15.84■□□□□ 0.13
PTPRK-207ENST00000368226 DDX58O95786 925 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
PTPRK-207ENST00000368226 NEUROD6Q96NK8 337 aa15.84■□□□□ 0.13
PTPRK-207ENST00000368226 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP15.84■□□□□ 0.131e-7■■■■□ 21.6
PTPRK-207ENST00000368226 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
PTPRK-207ENST00000368226 ABTB2Q8N961 1025 aa15.84■□□□□ 0.13
PTPRK-207ENST00000368226 PANK1Q8TE04 598 aa15.84■□□□□ 0.13
PTPRK-207ENST00000368226 ZBED9Q6R2W3 1325 aa15.83■□□□□ 0.13
PTPRK-207ENST00000368226 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa15.83■□□□□ 0.12
PTPRK-207ENST00000368226 TXNDC2Q86VQ3 553 aa15.83■□□□□ 0.12
PTPRK-207ENST00000368226 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa15.83■□□□□ 0.12
PTPRK-207ENST00000368226 DDX19BQ9UMR2 479 aa15.83■□□□□ 0.12
PTPRK-207ENST00000368226 MTMR7Q9Y216 660 aa15.82■□□□□ 0.12
PTPRK-207ENST00000368226 LNPKQ9C0E8 428 aa15.82■□□□□ 0.12
PTPRK-207ENST00000368226 NESP48681 1621 aa15.82■□□□□ 0.12
PTPRK-207ENST00000368226 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP15.81■□□□□ 0.12
PTPRK-207ENST00000368226 AMOTL1Q8IY63 956 aa15.81■□□□□ 0.12
PTPRK-207ENST00000368226 KIF3AQ9Y496 699 aa15.81■□□□□ 0.12
PTPRK-207ENST00000368226 NCOA2Q15596 1464 aa15.81■□□□□ 0.12
PTPRK-207ENST00000368226 MTHFSP49914 203 aa15.8■□□□□ 0.12
PTPRK-207ENST00000368226 PRAM1Q96QH2 718 aa15.8■□□□□ 0.12
PTPRK-207ENST00000368226 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP15.8■□□□□ 0.12
PTPRK-207ENST00000368226 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP15.8■□□□□ 0.12
PTPRK-207ENST00000368226 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP15.8■□□□□ 0.12
PTPRK-207ENST00000368226 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP15.8■□□□□ 0.12
PTPRK-207ENST00000368226 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP15.8■□□□□ 0.12
PTPRK-207ENST00000368226 NFXL1Q6ZNB6 911 aa15.8■□□□□ 0.12
PTPRK-207ENST00000368226 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP15.8■□□□□ 0.12
PTPRK-207ENST00000368226 KIF21BO75037 1637 aa15.8■□□□□ 0.12
PTPRK-207ENST00000368226 CCDC27Q2M243 656 aa15.79■□□□□ 0.12
PTPRK-207ENST00000368226 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP15.79■□□□□ 0.12
PTPRK-207ENST00000368226 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa15.79■□□□□ 0.12
PTPRK-207ENST00000368226 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP15.79■□□□□ 0.12
PTPRK-207ENST00000368226 CCDC7Q96M83 1385 aa15.79■□□□□ 0.12
PTPRK-207ENST00000368226 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP15.79■□□□□ 0.12
PTPRK-207ENST00000368226 CUX1P39880 1505 aa15.79■□□□□ 0.12
PTPRK-207ENST00000368226 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
PTPRK-207ENST00000368226 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa15.78■□□□□ 0.12
PTPRK-207ENST00000368226 ADAMTS8Q9UP79 889 aa15.78■□□□□ 0.12
PTPRK-207ENST00000368226 GNAI1P63096 354 aa15.78■□□□□ 0.12
PTPRK-207ENST00000368226 NBPF1Q3BBV0 1214 aa15.78■□□□□ 0.12
PTPRK-207ENST00000368226 CPLX1O14810 134 aa15.77■□□□□ 0.12
PTPRK-207ENST00000368226 RUFY2Q8WXA3 655 aa15.77■□□□□ 0.12
PTPRK-207ENST00000368226 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP15.77■□□□□ 0.11
PTPRK-207ENST00000368226 WASHC4Q2M389 1173 aa15.77■□□□□ 0.11
PTPRK-207ENST00000368226 TRIM29Q14134 588 aa15.76■□□□□ 0.11
PTPRK-207ENST00000368226 MIA2Q96PC5 1412 aa15.76■□□□□ 0.11
PTPRK-207ENST00000368226 PHF14O94880 888 aa15.76■□□□□ 0.11
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