RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320580.8

PACS1-201, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACS1, Length 4,392 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-201ENST00000320580 CCDC39Q9UFE4 941 aa20.59■□□□□ 0.89
PACS1-201ENST00000320580 CBX1P83916 185 aa20.58■□□□□ 0.89
PACS1-201ENST00000320580 SMC4Q9NTJ3 1288 aa20.58■□□□□ 0.89
PACS1-201ENST00000320580 CHGAP10645 457 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.88
PACS1-201ENST00000320580 IQGAP2Q13576 1575 aa20.58■□□□□ 0.88
PACS1-201ENST00000320580 MPNDQ8N594 471 aa20.57■□□□□ 0.88
PACS1-201ENST00000320580 HFM1A2PYH4 1435 aa20.57■□□□□ 0.88
PACS1-201ENST00000320580 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
PACS1-201ENST00000320580 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
PACS1-201ENST00000320580 EFCAB5A4FU69 1503 aa20.57■□□□□ 0.88
PACS1-201ENST00000320580 PLPPR3Q6T4P5 718 aa20.55■□□□□ 0.88
PACS1-201ENST00000320580 NUP155O75694 1391 aa20.55■□□□□ 0.88
PACS1-201ENST00000320580 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
PACS1-201ENST00000320580 FYCO1Q9BQS8 1478 aa20.55■□□□□ 0.88
PACS1-201ENST00000320580 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
PACS1-201ENST00000320580 WDR62O43379 1518 aa20.53■□□□□ 0.88
PACS1-201ENST00000320580 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
PACS1-201ENST00000320580 TIAM1Q13009 1591 aa20.53■□□□□ 0.88
PACS1-201ENST00000320580 APBB1O00213 710 aa20.53■□□□□ 0.88
PACS1-201ENST00000320580 MAP3K1Q13233 1512 aa20.53■□□□□ 0.88
PACS1-201ENST00000320580 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
PACS1-201ENST00000320580 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.87
PACS1-201ENST00000320580 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
PACS1-201ENST00000320580 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
PACS1-201ENST00000320580 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
PACS1-201ENST00000320580 MORC1Q86VD1 984 aa20.5■□□□□ 0.87
PACS1-201ENST00000320580 NCOA2Q15596 1464 aa20.5■□□□□ 0.87
PACS1-201ENST00000320580 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
PACS1-201ENST00000320580 PLB1Q6P1J6 1458 aa20.49■□□□□ 0.87
PACS1-201ENST00000320580 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
PACS1-201ENST00000320580 PHF14O94880 888 aa20.49■□□□□ 0.87
PACS1-201ENST00000320580 ANKRD45Q5TZF3 282 aa20.49■□□□□ 0.87
PACS1-201ENST00000320580 LNPKQ9C0E8 428 aa20.49■□□□□ 0.87
PACS1-201ENST00000320580 NUCB2P80303 420 aa20.48■□□□□ 0.87
PACS1-201ENST00000320580 NAIPQ13075 1403 aa20.48■□□□□ 0.87
PACS1-201ENST00000320580 MYOM3Q5VTT5 1437 aa20.48■□□□□ 0.87
PACS1-201ENST00000320580 PDE3AQ14432 1141 aa20.48■□□□□ 0.87
PACS1-201ENST00000320580 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa20.48■□□□□ 0.87
PACS1-201ENST00000320580 ST18O60284 1047 aa20.48■□□□□ 0.87
PACS1-201ENST00000320580 SEC24BO95487 1268 aa20.48■□□□□ 0.87
PACS1-201ENST00000320580 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
PACS1-201ENST00000320580 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
PACS1-201ENST00000320580 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
PACS1-201ENST00000320580 SASS6Q6UVJ0 657 aa20.47■□□□□ 0.87
PACS1-201ENST00000320580 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
PACS1-201ENST00000320580 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa20.47■□□□□ 0.87
PACS1-201ENST00000320580 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa20.46■□□□□ 0.87
PACS1-201ENST00000320580 OFD1O75665 1012 aa20.46■□□□□ 0.87
PACS1-201ENST00000320580 IGHDP01880 384 aa20.46■□□□□ 0.87
PACS1-201ENST00000320580 TBC1D32Q96NH3 1257 aa20.46■□□□□ 0.87
PACS1-201ENST00000320580 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
PACS1-201ENST00000320580 DYNC1I1O14576 645 aa20.45■□□□□ 0.86
PACS1-201ENST00000320580 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
PACS1-201ENST00000320580 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP20.45■□□□□ 0.86
PACS1-201ENST00000320580 CFAP44Q96MT7 982 aa20.45■□□□□ 0.86
PACS1-201ENST00000320580 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
PACS1-201ENST00000320580 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa20.44■□□□□ 0.86
PACS1-201ENST00000320580 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
PACS1-201ENST00000320580 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa20.44■□□□□ 0.86
PACS1-201ENST00000320580 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
PACS1-201ENST00000320580 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa20.43■□□□□ 0.86
PACS1-201ENST00000320580 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
PACS1-201ENST00000320580 ZNF592Q92610 1267 aa20.41■□□□□ 0.86
PACS1-201ENST00000320580 ADAMTS12P58397 1594 aa20.41■□□□□ 0.86
PACS1-201ENST00000320580 CCDC66A2RUB6 948 aa20.41■□□□□ 0.86
PACS1-201ENST00000320580 MCCP23508 829 aa20.41■□□□□ 0.86
PACS1-201ENST00000320580 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
PACS1-201ENST00000320580 KIF3AQ9Y496 699 aa20.4■□□□□ 0.86
PACS1-201ENST00000320580 PDCL2Q8N4E4 241 aa20.4■□□□□ 0.86
PACS1-201ENST00000320580 DUSP27Q5VZP5 1158 aa20.38■□□□□ 0.85
PACS1-201ENST00000320580 SPDYE4A6NLX3 237 aa20.38■□□□□ 0.85
PACS1-201ENST00000320580 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP20.38■□□□□ 0.85
PACS1-201ENST00000320580 SLFN5Q08AF3 891 aa20.37■□□□□ 0.85
PACS1-201ENST00000320580 AAMPQ13685 434 aa20.37■□□□□ 0.85
PACS1-201ENST00000320580 KIF16BQ96L93 1317 aa20.37■□□□□ 0.85
PACS1-201ENST00000320580 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa20.37■□□□□ 0.85
PACS1-201ENST00000320580 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
PACS1-201ENST00000320580 PPP2R1AP30153 589 aa20.37■□□□□ 0.85
PACS1-201ENST00000320580 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
PACS1-201ENST00000320580 DDX19BQ9UMR2 479 aa20.37■□□□□ 0.85
PACS1-201ENST00000320580 MIA2Q96PC5 1412 aa20.37■□□□□ 0.85
PACS1-201ENST00000320580 SSFA2P28290 1259 aa20.36■□□□□ 0.85
PACS1-201ENST00000320580 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
PACS1-201ENST00000320580 TRHP20396 242 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
PACS1-201ENST00000320580 TAF3Q5VWG9 929 aa20.34■□□□□ 0.85
PACS1-201ENST00000320580 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa20.34■□□□□ 0.85
PACS1-201ENST00000320580 NRDCO43847 1150 aa20.34■□□□□ 0.85
PACS1-201ENST00000320580 TSPY26PQ9H489 355 aa20.34■□□□□ 0.85
PACS1-201ENST00000320580 IGSF3O75054 1194 aa20.33■□□□□ 0.85
PACS1-201ENST00000320580 KDM2BQ8NHM5 1336 aa20.33■□□□□ 0.85
PACS1-201ENST00000320580 PBRM1Q86U86 1689 aa20.33■□□□□ 0.85
PACS1-201ENST00000320580 SYCE3A1L190 88 aa20.33■□□□□ 0.84
PACS1-201ENST00000320580 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
PACS1-201ENST00000320580 FGD1P98174 961 aa20.32■□□□□ 0.84
PACS1-201ENST00000320580 GGT6Q6P531 493 aa20.32■□□□□ 0.84
PACS1-201ENST00000320580 IFT57Q9NWB7 429 aa20.31■□□□□ 0.84
PACS1-201ENST00000320580 HECW1Q76N89 1606 aa20.31■□□□□ 0.84
PACS1-201ENST00000320580 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa20.31■□□□□ 0.84
PACS1-201ENST00000320580 PLCD3Q8N3E9 789 aa20.31■□□□□ 0.84
PACS1-201ENST00000320580 MBD3O95983 291 aa20.3■□□□□ 0.84
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