RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317991.9

GRAMD1A-201, Transcript of GRAM domain containing 1A, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene GRAMD1A, Length 2,695 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD1A-201ENST00000317991 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa28.91■■■□□ 2.22
GRAMD1A-201ENST00000317991 MYO5CQ9NQX4 1742 aa28.91■■■□□ 2.22
GRAMD1A-201ENST00000317991 ERCC6L2Q5T890 1561 aa28.9■■■□□ 2.22
GRAMD1A-201ENST00000317991 APAF1O14727 1248 aa28.89■■■□□ 2.22
GRAMD1A-201ENST00000317991 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP28.89■■■□□ 2.22
GRAMD1A-201ENST00000317991 USP19O94966 1318 aa28.89■■■□□ 2.21
GRAMD1A-201ENST00000317991 SEC24BO95487 1268 aa28.88■■■□□ 2.21
GRAMD1A-201ENST00000317991 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP28.87■■■□□ 2.21
GRAMD1A-201ENST00000317991 DMRT2Q9Y5R5 561 aa28.87■■■□□ 2.21
GRAMD1A-201ENST00000317991 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa28.83■■■□□ 2.21
GRAMD1A-201ENST00000317991 POGKQ9P215 609 aa28.83■■■□□ 2.21
GRAMD1A-201ENST00000317991 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP28.82■■■□□ 2.2
GRAMD1A-201ENST00000317991 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP28.82■■■□□ 2.2
GRAMD1A-201ENST00000317991 RSPH4AQ5TD94 716 aa28.81■■■□□ 2.2
GRAMD1A-201ENST00000317991 SHROOM2Q13796 1616 aa28.8■■■□□ 2.2
GRAMD1A-201ENST00000317991 CLASP1Q7Z460 1538 aa28.8■■■□□ 2.2
GRAMD1A-201ENST00000317991 SYCP2Q9BX26 1530 aa28.8■■■□□ 2.2
GRAMD1A-201ENST00000317991 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP28.79■■■□□ 2.2
GRAMD1A-201ENST00000317991 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP28.79■■■□□ 2.2
GRAMD1A-201ENST00000317991 UNC13BO14795 1591 aa28.79■■■□□ 2.2
GRAMD1A-201ENST00000317991 PANK1Q8TE04 598 aa28.77■■■□□ 2.2
GRAMD1A-201ENST00000317991 COG6Q9Y2V7 657 aa28.76■■■□□ 2.19
GRAMD1A-201ENST00000317991 PIK3C2GO75747 1445 aa28.74■■■□□ 2.19
GRAMD1A-201ENST00000317991 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa28.73■■■□□ 2.19
GRAMD1A-201ENST00000317991 E9PSI1 815 aa28.73■■■□□ 2.19
GRAMD1A-201ENST00000317991 FAM43AQ8N2R8 423 aa28.73■■■□□ 2.19
GRAMD1A-201ENST00000317991 PREX2Q70Z35 1606 aa28.73■■■□□ 2.19
GRAMD1A-201ENST00000317991 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP28.73■■■□□ 2.19
GRAMD1A-201ENST00000317991 IQGAP3Q86VI3 1631 aa28.72■■■□□ 2.19
GRAMD1A-201ENST00000317991 CLUAP1Q96AJ1 413 aa28.71■■■□□ 2.19
GRAMD1A-201ENST00000317991 CANXP27824 592 aaKnown RBP28.69■■■□□ 2.18
GRAMD1A-201ENST00000317991 ARHGAP5Q13017 1502 aa28.68■■■□□ 2.18
GRAMD1A-201ENST00000317991 CDCA8Q53HL2 280 aa28.68■■■□□ 2.18
GRAMD1A-201ENST00000317991 ATP10AO60312 1499 aa28.68■■■□□ 2.18
GRAMD1A-201ENST00000317991 CGNL1Q0VF96 1302 aa28.67■■■□□ 2.18
GRAMD1A-201ENST00000317991 PDE3AQ14432 1141 aa28.66■■■□□ 2.18
GRAMD1A-201ENST00000317991 SYNMO15061 1565 aa28.65■■■□□ 2.18
GRAMD1A-201ENST00000317991 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP28.65■■■□□ 2.18
GRAMD1A-201ENST00000317991 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP28.65■■■□□ 2.18
GRAMD1A-201ENST00000317991 BECN1Q14457 450 aa28.65■■■□□ 2.18
GRAMD1A-201ENST00000317991 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa28.63■■■□□ 2.17
GRAMD1A-201ENST00000317991 IQGAP1P46940 1657 aa28.63■■■□□ 2.17
GRAMD1A-201ENST00000317991 OSCARQ8IYS5 282 aa28.63■■■□□ 2.17
GRAMD1A-201ENST00000317991 ABCC2Q92887 1545 aa28.63■■■□□ 2.17
GRAMD1A-201ENST00000317991 ARXQ96QS3 562 aa28.63■■■□□ 2.17
GRAMD1A-201ENST00000317991 NLRP1Q9C000 1473 aa28.62■■■□□ 2.17
GRAMD1A-201ENST00000317991 NEUROD2Q15784 382 aa28.62■■■□□ 2.17
GRAMD1A-201ENST00000317991 MADDQ8WXG6 1647 aa28.62■■■□□ 2.17
GRAMD1A-201ENST00000317991 TNNQ9UQP3 1299 aa28.62■■■□□ 2.17
GRAMD1A-201ENST00000317991 MAST1Q9Y2H9 1570 aa28.61■■■□□ 2.17
GRAMD1A-201ENST00000317991 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP28.61■■■□□ 2.17
GRAMD1A-201ENST00000317991 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa28.61■■■□□ 2.17
GRAMD1A-201ENST00000317991 WWC1Q8IX03 1113 aa28.61■■■□□ 2.17
GRAMD1A-201ENST00000317991 ANTXR1Q9H6X2 564 aa28.61■■■□□ 2.17
GRAMD1A-201ENST00000317991 TTC37Q6PGP7 1564 aa28.61■■■□□ 2.17
GRAMD1A-201ENST00000317991 CARD14Q9BXL6 1004 aa28.6■■■□□ 2.17
GRAMD1A-201ENST00000317991 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP28.59■■■□□ 2.17
GRAMD1A-201ENST00000317991 RSPH6AQ9H0K4 717 aa28.59■■■□□ 2.17
GRAMD1A-201ENST00000317991 MYOM1P52179 1685 aa28.59■■■□□ 2.17
GRAMD1A-201ENST00000317991 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP28.58■■■□□ 2.17
GRAMD1A-201ENST00000317991 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa28.58■■■□□ 2.17
GRAMD1A-201ENST00000317991 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa28.58■■■□□ 2.17
GRAMD1A-201ENST00000317991 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa28.58■■■□□ 2.17
GRAMD1A-201ENST00000317991 RLBP1P12271 317 aa28.56■■■□□ 2.16
GRAMD1A-201ENST00000317991 BCL2L13Q9BXK5 485 aa28.56■■■□□ 2.16
GRAMD1A-201ENST00000317991 TBC1D2Q9BYX2 928 aa28.56■■■□□ 2.16
GRAMD1A-201ENST00000317991 DUOX2Q9NRD8 1548 aa28.55■■■□□ 2.16
GRAMD1A-201ENST00000317991 PLXNC1O60486 1568 aa28.55■■■□□ 2.16
GRAMD1A-201ENST00000317991 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP28.54■■■□□ 2.161e-10■■■■□ 24.8
GRAMD1A-201ENST00000317991 TBC1D32Q96NH3 1257 aa28.53■■■□□ 2.16
GRAMD1A-201ENST00000317991 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa28.53■■■□□ 2.16
GRAMD1A-201ENST00000317991 RARSP54136 660 aaKnown RBP28.51■■■□□ 2.15
GRAMD1A-201ENST00000317991 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP28.51■■■□□ 2.15
GRAMD1A-201ENST00000317991 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP28.49■■■□□ 2.15
GRAMD1A-201ENST00000317991 CFAP70Q5T0N1 1121 aa28.49■■■□□ 2.15
GRAMD1A-201ENST00000317991 SCAPERQ9BY12 1400 aa28.48■■■□□ 2.15
GRAMD1A-201ENST00000317991 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa28.48■■■□□ 2.15
GRAMD1A-201ENST00000317991 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP28.47■■■□□ 2.15
GRAMD1A-201ENST00000317991 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP28.47■■■□□ 2.15
GRAMD1A-201ENST00000317991 NINLQ9Y2I6 1382 aa28.47■■■□□ 2.15
GRAMD1A-201ENST00000317991 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP28.45■■■□□ 2.14
GRAMD1A-201ENST00000317991 NGEFQ8N5V2 710 aa28.45■■■□□ 2.14
GRAMD1A-201ENST00000317991 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP28.44■■■□□ 2.14
GRAMD1A-201ENST00000317991 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa28.44■■■□□ 2.14
GRAMD1A-201ENST00000317991 ERVK-7P63135 1459 aa28.43■■■□□ 2.14
GRAMD1A-201ENST00000317991 TCP11L2Q8N4U5 519 aa28.43■■■□□ 2.14
GRAMD1A-201ENST00000317991 PANK2Q9BZ23 570 aa28.42■■■□□ 2.14
GRAMD1A-201ENST00000317991 CEP152O94986 1710 aa28.41■■■□□ 2.14
GRAMD1A-201ENST00000317991 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP28.4■■■□□ 2.14
GRAMD1A-201ENST00000317991 CLTCL1P53675 1640 aa28.4■■■□□ 2.14
GRAMD1A-201ENST00000317991 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa28.39■■■□□ 2.14
GRAMD1A-201ENST00000317991 MCM4P33991 863 aa28.38■■■□□ 2.13
GRAMD1A-201ENST00000317991 TRPM2O94759 1503 aa28.38■■■□□ 2.13
GRAMD1A-201ENST00000317991 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa28.38■■■□□ 2.13
GRAMD1A-201ENST00000317991 RUNDC1Q96C34 613 aa28.37■■■□□ 2.13
GRAMD1A-201ENST00000317991 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa28.37■■■□□ 2.13
GRAMD1A-201ENST00000317991 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP28.36■■■□□ 2.13
GRAMD1A-201ENST00000317991 MORC1Q86VD1 984 aa28.36■■■□□ 2.13
GRAMD1A-201ENST00000317991 AFAP1Q8N556 730 aa28.36■■■□□ 2.13
GRAMD1A-201ENST00000317991 STAC3Q96MF2 364 aa28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 75.1 ms