RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317868.8

ATG4C-201, Transcript of autophagy related 4C cysteine peptidase, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ATG4C, Length 2,938 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4C-201ENST00000317868 PPLO60437 1756 aa18.66■□□□□ 0.58
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ATG4C-201ENST00000317868 SLC24A1O60721 1099 aa18.43■□□□□ 0.54
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ATG4C-201ENST00000317868 CCDC136Q96JN2 1154 aa18.37■□□□□ 0.53
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ATG4C-201ENST00000317868 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa18.2■□□□□ 0.5
ATG4C-201ENST00000317868 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa18.2■□□□□ 0.5
ATG4C-201ENST00000317868 GOLGA2Q08379 1002 aa18.2■□□□□ 0.5
ATG4C-201ENST00000317868 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
ATG4C-201ENST00000317868 NGEFQ8N5V2 710 aa18.19■□□□□ 0.5
ATG4C-201ENST00000317868 TRAK1Q9UPV9 953 aa18.19■□□□□ 0.5
ATG4C-201ENST00000317868 PTPRMP28827 1452 aa18.19■□□□□ 0.5
ATG4C-201ENST00000317868 AGLP35573 1532 aa18.19■□□□□ 0.5
ATG4C-201ENST00000317868 PLIN1O60240 522 aa18.18■□□□□ 0.5
ATG4C-201ENST00000317868 CHGAP10645 457 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
ATG4C-201ENST00000317868 ADGRB2O60241 1585 aa18.18■□□□□ 0.5
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