RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311101.9

PARL-201, Transcript of presenilin associated rhomboid like, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PARL, Length 1,240 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARL-201ENST00000311101 TRPM2O94759 1503 aa29.73■■■□□ 2.35
PARL-201ENST00000311101 CLTCL1P53675 1640 aa29.71■■■□□ 2.35
PARL-201ENST00000311101 DISP3Q9P2K9 1392 aa29.69■■■□□ 2.34
PARL-201ENST00000311101 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP29.69■■■□□ 2.34
PARL-201ENST00000311101 FOXD1Q16676 465 aa29.68■■■□□ 2.34
PARL-201ENST00000311101 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP29.67■■■□□ 2.34
PARL-201ENST00000311101 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP29.67■■■□□ 2.34
PARL-201ENST00000311101 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa29.66■■■□□ 2.34
PARL-201ENST00000311101 SLC26A8Q96RN1 970 aa29.66■■■□□ 2.34
PARL-201ENST00000311101 MPHOSPH9Q99550 1183 aa29.66■■■□□ 2.34
PARL-201ENST00000311101 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa29.65■■■□□ 2.34
PARL-201ENST00000311101 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP29.65■■■□□ 2.34
PARL-201ENST00000311101 HDGFP51858 240 aaKnown RBP29.65■■■□□ 2.34
PARL-201ENST00000311101 PIP4K2BP78356 416 aa29.65■■■□□ 2.34
PARL-201ENST00000311101 LRRC7Q96NW7 1537 aa29.64■■■□□ 2.34
PARL-201ENST00000311101 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP29.63■■■□□ 2.33
PARL-201ENST00000311101 BCANQ96GW7 911 aa29.62■■■□□ 2.33
PARL-201ENST00000311101 ALKQ9UM73 1620 aa29.62■■■□□ 2.33
PARL-201ENST00000311101 TOM1O60784 492 aa29.61■■■□□ 2.33
PARL-201ENST00000311101 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP29.58■■■□□ 2.33
PARL-201ENST00000311101 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP29.58■■■□□ 2.33
PARL-201ENST00000311101 KIF1BO60333 1816 aa29.55■■■□□ 2.32
PARL-201ENST00000311101 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP29.55■■■□□ 2.32
PARL-201ENST00000311101 HSPA1LP34931 641 aa29.54■■■□□ 2.32
PARL-201ENST00000311101 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa29.54■■■□□ 2.32
PARL-201ENST00000311101 KCNA6P17658 529 aa29.53■■■□□ 2.32
PARL-201ENST00000311101 ILDR2Q71H61 639 aa29.53■■■□□ 2.32
PARL-201ENST00000311101 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa29.52■■■□□ 2.32
PARL-201ENST00000311101 TBX22Q9Y458 520 aa29.51■■■□□ 2.31
PARL-201ENST00000311101 NWD1Q149M9 1564 aa29.48■■■□□ 2.31
PARL-201ENST00000311101 CCDC144AA2RUR9 1427 aa29.48■■■□□ 2.31
PARL-201ENST00000311101 HRCP23327 699 aa29.46■■■□□ 2.31
PARL-201ENST00000311101 DIP2AQ14689 1571 aa29.46■■■□□ 2.31
PARL-201ENST00000311101 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa29.45■■■□□ 2.31
PARL-201ENST00000311101 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa29.44■■■□□ 2.3
PARL-201ENST00000311101 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP29.43■■■□□ 2.3
PARL-201ENST00000311101 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP29.42■■■□□ 2.3
PARL-201ENST00000311101 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP29.42■■■□□ 2.3
PARL-201ENST00000311101 TMEM94Q12767 1356 aa29.41■■■□□ 2.3
PARL-201ENST00000311101 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP29.41■■■□□ 2.3
PARL-201ENST00000311101 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa29.4■■■□□ 2.3
PARL-201ENST00000311101 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa29.4■■■□□ 2.3
PARL-201ENST00000311101 PIK3R4Q99570 1358 aa29.39■■■□□ 2.29
PARL-201ENST00000311101 PTPRUQ92729 1446 aa29.37■■■□□ 2.29
PARL-201ENST00000311101 VGFO15240 615 aaPredicted RBP29.37■■■□□ 2.29
PARL-201ENST00000311101 RGL3Q3MIN7 710 aa29.37■■■□□ 2.29
PARL-201ENST00000311101 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP29.37■■■□□ 2.29
PARL-201ENST00000311101 PPLO60437 1756 aa29.36■■■□□ 2.29
PARL-201ENST00000311101 METP08581 1390 aa29.35■■■□□ 2.29
PARL-201ENST00000311101 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa29.32■■■□□ 2.28
PARL-201ENST00000311101 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa29.32■■■□□ 2.28
PARL-201ENST00000311101 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa29.28■■■□□ 2.28
PARL-201ENST00000311101 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP29.27■■■□□ 2.28
PARL-201ENST00000311101 IFT172Q9UG01 1749 aa29.26■■■□□ 2.27
PARL-201ENST00000311101 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP29.25■■■□□ 2.27
PARL-201ENST00000311101 SOCS7O14512 581 aa29.23■■■□□ 2.27
PARL-201ENST00000311101 MSH6P52701 1360 aa29.23■■■□□ 2.27
PARL-201ENST00000311101 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa29.22■■■□□ 2.27
PARL-201ENST00000311101 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa29.22■■■□□ 2.27
PARL-201ENST00000311101 FAM135BQ49AJ0 1406 aa29.19■■■□□ 2.26
PARL-201ENST00000311101 C14orf37Q86TY3 774 aa29.18■■■□□ 2.26
PARL-201ENST00000311101 PIK3C2GO75747 1445 aa29.16■■■□□ 2.26
PARL-201ENST00000311101 MYOM2P54296 1465 aa29.13■■■□□ 2.25
PARL-201ENST00000311101 C19orf44Q9H6X5 657 aa29.13■■■□□ 2.25
PARL-201ENST00000311101 NRXN1Q9ULB1 1477 aa29.12■■■□□ 2.25
PARL-201ENST00000311101 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP29.12■■■□□ 2.25
PARL-201ENST00000311101 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP29.11■■■□□ 2.25
PARL-201ENST00000311101 ROBO2Q9HCK4 1378 aa29.11■■■□□ 2.25
PARL-201ENST00000311101 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP29.1■■■□□ 2.25
PARL-201ENST00000311101 SLAIN2Q9P270 581 aa29.1■■■□□ 2.25
PARL-201ENST00000311101 PTCH1Q13635 1447 aa29.1■■■□□ 2.25
PARL-201ENST00000311101 PRAG1Q86YV5 1406 aa29.09■■■□□ 2.25
PARL-201ENST00000311101 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa29.09■■■□□ 2.25
PARL-201ENST00000311101 ATF3P18847 181 aa29.06■■■□□ 2.24
PARL-201ENST00000311101 TMEM132EQ6IEE7 984 aa29.06■■■□□ 2.24
PARL-201ENST00000311101 CADPS2Q86UW7 1296 aa29.06■■■□□ 2.24
PARL-201ENST00000311101 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP29.05■■■□□ 2.24
PARL-201ENST00000311101 PHLPP1O60346 1717 aa29.05■■■□□ 2.24
PARL-201ENST00000311101 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa29.04■■■□□ 2.24
PARL-201ENST00000311101 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP29.04■■■□□ 2.24
PARL-201ENST00000311101 CFAP70Q5T0N1 1121 aa29.04■■■□□ 2.24
PARL-201ENST00000311101 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa29.04■■■□□ 2.24
PARL-201ENST00000311101 DCCP43146 1447 aa29.03■■■□□ 2.24
PARL-201ENST00000311101 DCAF11Q8TEB1 546 aa29.03■■■□□ 2.24
PARL-201ENST00000311101 STK26Q9P289 416 aa29.03■■■□□ 2.24
PARL-201ENST00000311101 NALCNQ8IZF0 1738 aa29.03■■■□□ 2.24
PARL-201ENST00000311101 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP29.01■■■□□ 2.24
PARL-201ENST00000311101 TECPR2O15040 1411 aa28.99■■■□□ 2.23
PARL-201ENST00000311101 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP28.98■■■□□ 2.23
PARL-201ENST00000311101 ABCC11Q96J66 1382 aa28.98■■■□□ 2.23
PARL-201ENST00000311101 LAMC1P11047 1609 aa28.98■■■□□ 2.23
PARL-201ENST00000311101 MST1RQ04912 1400 aa28.96■■■□□ 2.23
PARL-201ENST00000311101 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP28.94■■■□□ 2.22
PARL-201ENST00000311101 KNDC1Q76NI1 1749 aa28.94■■■□□ 2.22
PARL-201ENST00000311101 WAPLQ7Z5K2 1190 aa28.94■■■□□ 2.22
PARL-201ENST00000311101 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa28.93■■■□□ 2.22
PARL-201ENST00000311101 STAC3Q96MF2 364 aa28.93■■■□□ 2.22
PARL-201ENST00000311101 BRINP3Q76B58 766 aa28.91■■■□□ 2.22
PARL-201ENST00000311101 SIN3AQ96ST3 1273 aa28.91■■■□□ 2.22
PARL-201ENST00000311101 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP28.91■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.5 ms