RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000305031.4

CHSY3-201, Transcript of chondroitin sulfate synthase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CHSY3, Length 3,850 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHSY3-201ENST00000305031 PDE3BQ13370 1112 aa20.57■□□□□ 0.88
CHSY3-201ENST00000305031 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa20.57■□□□□ 0.88
CHSY3-201ENST00000305031 PZPP20742 1482 aa20.57■□□□□ 0.88
CHSY3-201ENST00000305031 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
CHSY3-201ENST00000305031 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
CHSY3-201ENST00000305031 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
CHSY3-201ENST00000305031 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP20.55■□□□□ 0.88
CHSY3-201ENST00000305031 ITPRIPQ8IWB1 547 aa20.55■□□□□ 0.88
CHSY3-201ENST00000305031 USP35Q9P2H5 1018 aa20.55■□□□□ 0.88
CHSY3-201ENST00000305031 PPP2R1AP30153 589 aa20.55■□□□□ 0.88
CHSY3-201ENST00000305031 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
CHSY3-201ENST00000305031 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
CHSY3-201ENST00000305031 C14orf37Q86TY3 774 aa20.53■□□□□ 0.88
CHSY3-201ENST00000305031 CABP2Q9NPB3 220 aa20.53■□□□□ 0.88
CHSY3-201ENST00000305031 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
CHSY3-201ENST00000305031 CEP170Q5SW79 1584 aa20.51■□□□□ 0.87
CHSY3-201ENST00000305031 DISP3Q9P2K9 1392 aa20.5■□□□□ 0.87
CHSY3-201ENST00000305031 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
CHSY3-201ENST00000305031 NUP160Q12769 1436 aa20.5■□□□□ 0.87
CHSY3-201ENST00000305031 MS4A1P11836 297 aa20.5■□□□□ 0.87
CHSY3-201ENST00000305031 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
CHSY3-201ENST00000305031 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
CHSY3-201ENST00000305031 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa20.49■□□□□ 0.87
CHSY3-201ENST00000305031 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
CHSY3-201ENST00000305031 FAM69CQ0P6D2 419 aa20.48■□□□□ 0.87
CHSY3-201ENST00000305031 ERBINQ96RT1 1412 aa20.48■□□□□ 0.87
CHSY3-201ENST00000305031 SYCP2Q9BX26 1530 aa20.48■□□□□ 0.87
CHSY3-201ENST00000305031 GGNBP2Q9H3C7 697 aa20.47■□□□□ 0.87
CHSY3-201ENST00000305031 HSCBQ8IWL3 235 aa20.47■□□□□ 0.87
CHSY3-201ENST00000305031 VGFO15240 615 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
CHSY3-201ENST00000305031 SMC4Q9NTJ3 1288 aa20.47■□□□□ 0.87
CHSY3-201ENST00000305031 TEX14Q8IWB6 1497 aa20.46■□□□□ 0.87
CHSY3-201ENST00000305031 PLCB2Q00722 1185 aa20.46■□□□□ 0.87
CHSY3-201ENST00000305031 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
CHSY3-201ENST00000305031 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa20.45■□□□□ 0.86
CHSY3-201ENST00000305031 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa20.44■□□□□ 0.86
CHSY3-201ENST00000305031 MTHFSP49914 203 aa20.44■□□□□ 0.86
CHSY3-201ENST00000305031 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
CHSY3-201ENST00000305031 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
CHSY3-201ENST00000305031 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
CHSY3-201ENST00000305031 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
CHSY3-201ENST00000305031 MYH16Q9H6N6 1097 aa20.42■□□□□ 0.86
CHSY3-201ENST00000305031 TESK2Q96S53 571 aa20.41■□□□□ 0.86
CHSY3-201ENST00000305031 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
CHSY3-201ENST00000305031 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
CHSY3-201ENST00000305031 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.86
CHSY3-201ENST00000305031 CGNL1Q0VF96 1302 aa20.38■□□□□ 0.85
CHSY3-201ENST00000305031 EVC2Q86UK5 1308 aa20.38■□□□□ 0.85
CHSY3-201ENST00000305031 GOLGA6L22H0YM25 854 aa20.38■□□□□ 0.85
CHSY3-201ENST00000305031 VSIG10Q8N0Z9 540 aa20.38■□□□□ 0.85
CHSY3-201ENST00000305031 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
CHSY3-201ENST00000305031 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
CHSY3-201ENST00000305031 FAM135AQ9P2D6 1515 aa20.37■□□□□ 0.85
CHSY3-201ENST00000305031 PTMAP06454 111 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
CHSY3-201ENST00000305031 TERF2IPQ9NYB0 399 aa20.36■□□□□ 0.85
CHSY3-201ENST00000305031 TAOK2Q9UL54 1235 aa20.36■□□□□ 0.85
CHSY3-201ENST00000305031 TRHP20396 242 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
CHSY3-201ENST00000305031 TCP11L2Q8N4U5 519 aa20.35■□□□□ 0.85
CHSY3-201ENST00000305031 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa20.34■□□□□ 0.85
CHSY3-201ENST00000305031 ITSN2Q9NZM3 1697 aa20.34■□□□□ 0.85
CHSY3-201ENST00000305031 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
CHSY3-201ENST00000305031 PRAG1Q86YV5 1406 aa20.34■□□□□ 0.85
CHSY3-201ENST00000305031 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa20.34■□□□□ 0.85
CHSY3-201ENST00000305031 LNPKQ9C0E8 428 aa20.33■□□□□ 0.85
CHSY3-201ENST00000305031 PLCH2O75038 1416 aa20.33■□□□□ 0.85
CHSY3-201ENST00000305031 E9PSI1 815 aa20.33■□□□□ 0.85
CHSY3-201ENST00000305031 ADGRL1O94910 1474 aa20.33■□□□□ 0.85
CHSY3-201ENST00000305031 LMOD2Q6P5Q4 547 aa20.32■□□□□ 0.84
CHSY3-201ENST00000305031 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
CHSY3-201ENST00000305031 FANCAO15360 1455 aa20.32■□□□□ 0.84
CHSY3-201ENST00000305031 RALGAPBQ86X10 1494 aa20.32■□□□□ 0.84
CHSY3-201ENST00000305031 PRAM1Q96QH2 718 aa20.31■□□□□ 0.84
CHSY3-201ENST00000305031 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
CHSY3-201ENST00000305031 STAC3Q96MF2 364 aa20.3■□□□□ 0.84
CHSY3-201ENST00000305031 HMOX1P09601 288 aa20.29■□□□□ 0.84
CHSY3-201ENST00000305031 GCC2Q8IWJ2 1684 aa20.29■□□□□ 0.84
CHSY3-201ENST00000305031 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa20.28■□□□□ 0.84
CHSY3-201ENST00000305031 IDI1Q13907 227 aa20.28■□□□□ 0.84
CHSY3-201ENST00000305031 MBD5Q9P267 1494 aa20.27■□□□□ 0.84
CHSY3-201ENST00000305031 CD109Q6YHK3 1445 aa20.27■□□□□ 0.84
CHSY3-201ENST00000305031 ANKRD45Q5TZF3 282 aa20.27■□□□□ 0.84
CHSY3-201ENST00000305031 ADGRL2O95490 1459 aa20.27■□□□□ 0.84
CHSY3-201ENST00000305031 ABCC10Q5T3U5 1492 aa20.26■□□□□ 0.83
CHSY3-201ENST00000305031 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa20.26■□□□□ 0.83
CHSY3-201ENST00000305031 C1orf115Q9H7X2 142 aa20.26■□□□□ 0.83
CHSY3-201ENST00000305031 TNNQ9UQP3 1299 aa20.26■□□□□ 0.83
CHSY3-201ENST00000305031 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
CHSY3-201ENST00000305031 RUNDC1Q96C34 613 aa20.25■□□□□ 0.83
CHSY3-201ENST00000305031 FBLN1P23142 703 aa20.25■□□□□ 0.83
CHSY3-201ENST00000305031 IGHDP01880 384 aa20.24■□□□□ 0.83
CHSY3-201ENST00000305031 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
CHSY3-201ENST00000305031 RIPK4P57078 832 aa20.23■□□□□ 0.83
CHSY3-201ENST00000305031 MSNP26038 577 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
CHSY3-201ENST00000305031 CABP1Q9NZU7 370 aa20.23■□□□□ 0.83
CHSY3-201ENST00000305031 A2MP01023 1474 aa20.22■□□□□ 0.83
CHSY3-201ENST00000305031 MPNDQ8N594 471 aa20.22■□□□□ 0.83
CHSY3-201ENST00000305031 NOS1P29475 1434 aa20.21■□□□□ 0.83
CHSY3-201ENST00000305031 SEC24BO95487 1268 aa20.21■□□□□ 0.83
CHSY3-201ENST00000305031 WAPLQ7Z5K2 1190 aa20.21■□□□□ 0.83
CHSY3-201ENST00000305031 TXNDC2Q86VQ3 553 aa20.21■□□□□ 0.83
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