RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000288607.2

PSMG3-202, Transcript of proteasome assembly chaperone 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PSMG3, Length 1,391 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMG3-202ENST00000288607 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP36.39■■■■□ 3.42
PSMG3-202ENST00000288607 SLC26A8Q96RN1 970 aa36.39■■■■□ 3.42
PSMG3-202ENST00000288607 CLTCL1P53675 1640 aa36.38■■■■□ 3.42
PSMG3-202ENST00000288607 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP36.38■■■■□ 3.41
PSMG3-202ENST00000288607 BCANQ96GW7 911 aa36.38■■■■□ 3.41
PSMG3-202ENST00000288607 SETD5Q9C0A6 1442 aa36.37■■■■□ 3.41
PSMG3-202ENST00000288607 HDGFP51858 240 aaKnown RBP36.35■■■■□ 3.41
PSMG3-202ENST00000288607 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa36.33■■■■□ 3.41
PSMG3-202ENST00000288607 FOXD1Q16676 465 aa36.32■■■■□ 3.4
PSMG3-202ENST00000288607 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP36.32■■■■□ 3.4
PSMG3-202ENST00000288607 UBAP1LF5GYI3 381 aa36.31■■■■□ 3.4
PSMG3-202ENST00000288607 LRRC7Q96NW7 1537 aa36.29■■■■□ 3.4
PSMG3-202ENST00000288607 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP36.28■■■■□ 3.4
PSMG3-202ENST00000288607 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa36.28■■■■□ 3.4
PSMG3-202ENST00000288607 MPHOSPH9Q99550 1183 aa36.27■■■■□ 3.4
PSMG3-202ENST00000288607 KIF1BO60333 1816 aa36.23■■■■□ 3.39
PSMG3-202ENST00000288607 KCNA6P17658 529 aa36.2■■■■□ 3.39
PSMG3-202ENST00000288607 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa36.18■■■■□ 3.38
PSMG3-202ENST00000288607 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa36.16■■■■□ 3.38
PSMG3-202ENST00000288607 NWD1Q149M9 1564 aa36.15■■■■□ 3.38
PSMG3-202ENST00000288607 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP36.15■■■■□ 3.38
PSMG3-202ENST00000288607 TBX22Q9Y458 520 aa36.15■■■■□ 3.38
PSMG3-202ENST00000288607 TOM1O60784 492 aa36.13■■■■□ 3.37
PSMG3-202ENST00000288607 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP36.12■■■■□ 3.37
PSMG3-202ENST00000288607 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP36.12■■■■□ 3.37
PSMG3-202ENST00000288607 DIP2AQ14689 1571 aa36.11■■■■□ 3.37
PSMG3-202ENST00000288607 PIP4K2BP78356 416 aa36.11■■■■□ 3.37
PSMG3-202ENST00000288607 CCDC144AA2RUR9 1427 aa36.1■■■■□ 3.37
PSMG3-202ENST00000288607 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP36.1■■■■□ 3.37
PSMG3-202ENST00000288607 ALKQ9UM73 1620 aa36.09■■■■□ 3.37
PSMG3-202ENST00000288607 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP36.09■■■■□ 3.37
PSMG3-202ENST00000288607 TMEM94Q12767 1356 aa36.09■■■■□ 3.37
PSMG3-202ENST00000288607 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa36.09■■■■□ 3.37
PSMG3-202ENST00000288607 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP36.09■■■■□ 3.37
PSMG3-202ENST00000288607 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP36.08■■■■□ 3.37
PSMG3-202ENST00000288607 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa36.06■■■■□ 3.36
PSMG3-202ENST00000288607 PIK3R4Q99570 1358 aa36■■■■□ 3.35
PSMG3-202ENST00000288607 PTPRUQ92729 1446 aa35.98■■■■□ 3.35
PSMG3-202ENST00000288607 RGL3Q3MIN7 710 aa35.98■■■■□ 3.35
PSMG3-202ENST00000288607 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa35.98■■■■□ 3.35
PSMG3-202ENST00000288607 PPLO60437 1756 aa35.97■■■■□ 3.35
PSMG3-202ENST00000288607 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa35.97■■■■□ 3.35
PSMG3-202ENST00000288607 VGFO15240 615 aaPredicted RBP35.96■■■■□ 3.35
PSMG3-202ENST00000288607 HRCP23327 699 aa35.95■■■■□ 3.35
PSMG3-202ENST00000288607 METP08581 1390 aa35.94■■■■□ 3.34
PSMG3-202ENST00000288607 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa35.94■■■■□ 3.34
PSMG3-202ENST00000288607 HSPA1LP34931 641 aa35.89■■■■□ 3.34
PSMG3-202ENST00000288607 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP35.87■■■■□ 3.33
PSMG3-202ENST00000288607 MSH6P52701 1360 aa35.87■■■■□ 3.33
PSMG3-202ENST00000288607 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa35.84■■■■□ 3.33
PSMG3-202ENST00000288607 C14orf37Q86TY3 774 aa35.84■■■■□ 3.33
PSMG3-202ENST00000288607 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP35.84■■■■□ 3.33
PSMG3-202ENST00000288607 IFT172Q9UG01 1749 aa35.84■■■■□ 3.33
PSMG3-202ENST00000288607 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa35.84■■■■□ 3.33
PSMG3-202ENST00000288607 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa35.8■■■■□ 3.32
PSMG3-202ENST00000288607 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP35.73■■■■□ 3.31
PSMG3-202ENST00000288607 FAM135BQ49AJ0 1406 aa35.72■■■■□ 3.31
PSMG3-202ENST00000288607 C19orf44Q9H6X5 657 aa35.71■■■■□ 3.31
PSMG3-202ENST00000288607 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa35.7■■■■□ 3.31
PSMG3-202ENST00000288607 PIK3C2GO75747 1445 aa35.69■■■■□ 3.3
PSMG3-202ENST00000288607 SLAIN2Q9P270 581 aa35.69■■■■□ 3.3
PSMG3-202ENST00000288607 ATF3P18847 181 aa35.65■■■■□ 3.3
PSMG3-202ENST00000288607 ROBO2Q9HCK4 1378 aa35.65■■■■□ 3.3
PSMG3-202ENST00000288607 MYOM2P54296 1465 aa35.64■■■■□ 3.3
PSMG3-202ENST00000288607 CADPS2Q86UW7 1296 aa35.64■■■■□ 3.3
PSMG3-202ENST00000288607 PTCH1Q13635 1447 aa35.64■■■■□ 3.3
PSMG3-202ENST00000288607 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa35.62■■■■□ 3.29
PSMG3-202ENST00000288607 NRXN1Q9ULB1 1477 aa35.61■■■■□ 3.29
PSMG3-202ENST00000288607 NALCNQ8IZF0 1738 aa35.61■■■■□ 3.29
PSMG3-202ENST00000288607 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa35.6■■■■□ 3.29
PSMG3-202ENST00000288607 TMEM132EQ6IEE7 984 aa35.6■■■■□ 3.29
PSMG3-202ENST00000288607 PRAG1Q86YV5 1406 aa35.59■■■■□ 3.29
PSMG3-202ENST00000288607 DISP3Q9P2K9 1392 aa35.59■■■■□ 3.29
PSMG3-202ENST00000288607 DCCP43146 1447 aa35.58■■■■□ 3.29
PSMG3-202ENST00000288607 STK26Q9P289 416 aa35.58■■■■□ 3.29
PSMG3-202ENST00000288607 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa35.55■■■■□ 3.28
PSMG3-202ENST00000288607 CFAP70Q5T0N1 1121 aa35.54■■■■□ 3.28
PSMG3-202ENST00000288607 DCAF11Q8TEB1 546 aa35.54■■■■□ 3.28
PSMG3-202ENST00000288607 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP35.54■■■■□ 3.28
PSMG3-202ENST00000288607 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP35.53■■■■□ 3.28
PSMG3-202ENST00000288607 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP35.5■■■■□ 3.27
PSMG3-202ENST00000288607 MST1RQ04912 1400 aa35.5■■■■□ 3.27
PSMG3-202ENST00000288607 LAMC1P11047 1609 aa35.5■■■■□ 3.27
PSMG3-202ENST00000288607 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP35.49■■■■□ 3.27
PSMG3-202ENST00000288607 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP35.49■■■■□ 3.27
PSMG3-202ENST00000288607 TECPR2O15040 1411 aa35.48■■■■□ 3.27
PSMG3-202ENST00000288607 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP35.48■■■■□ 3.27
PSMG3-202ENST00000288607 PHLPP1O60346 1717 aa35.48■■■■□ 3.27
PSMG3-202ENST00000288607 KNDC1Q76NI1 1749 aa35.47■■■■□ 3.27
PSMG3-202ENST00000288607 ABCC11Q96J66 1382 aa35.47■■■■□ 3.27
PSMG3-202ENST00000288607 WAPLQ7Z5K2 1190 aa35.46■■■■□ 3.27
PSMG3-202ENST00000288607 BRINP3Q76B58 766 aa35.45■■■■□ 3.27
PSMG3-202ENST00000288607 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa35.43■■■■□ 3.26
PSMG3-202ENST00000288607 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP35.38■■■■□ 3.25
PSMG3-202ENST00000288607 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP35.38■■■■□ 3.25
PSMG3-202ENST00000288607 C1orf167Q5SNV9 1468 aa35.37■■■■□ 3.25
PSMG3-202ENST00000288607 STAC3Q96MF2 364 aa35.37■■■■□ 3.25
PSMG3-202ENST00000288607 ADGRB1O14514 1584 aa35.36■■■■□ 3.25
PSMG3-202ENST00000288607 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa35.34■■■■□ 3.25
PSMG3-202ENST00000288607 SIN3AQ96ST3 1273 aa35.34■■■■□ 3.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.8 ms