RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000273261.7

LRIG1-201, Transcript of leucine rich repeats and immunoglobulin like domains 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRIG1, Length 5,273 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1-201ENST00000273261 ROCK1Q13464 1354 aa25.26■■□□□ 1.63
LRIG1-201ENST00000273261 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
LRIG1-201ENST00000273261 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa25.25■■□□□ 1.63
LRIG1-201ENST00000273261 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
LRIG1-201ENST00000273261 RIPK4P57078 832 aa25.24■■□□□ 1.63
LRIG1-201ENST00000273261 WASHC2AQ641Q2 1341 aa25.24■■□□□ 1.63
LRIG1-201ENST00000273261 COG6Q9Y2V7 657 aa25.24■■□□□ 1.63
LRIG1-201ENST00000273261 CCDC34Q96HJ3 373 aa25.24■■□□□ 1.63
LRIG1-201ENST00000273261 KIF3AQ9Y496 699 aa25.24■■□□□ 1.63
LRIG1-201ENST00000273261 ANKRD45Q5TZF3 282 aa25.23■■□□□ 1.63
LRIG1-201ENST00000273261 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
LRIG1-201ENST00000273261 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
LRIG1-201ENST00000273261 KIF16BQ96L93 1317 aa25.21■■□□□ 1.63
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LRIG1-201ENST00000273261 AFAP1Q8N556 730 aa25.21■■□□□ 1.63
LRIG1-201ENST00000273261 CHMP4CQ96CF2 233 aa25.21■■□□□ 1.63
LRIG1-201ENST00000273261 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
LRIG1-201ENST00000273261 KIAA2012Q0VF49 1180 aa25.21■■□□□ 1.63
LRIG1-201ENST00000273261 USP35Q9P2H5 1018 aa25.21■■□□□ 1.63
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LRIG1-201ENST00000273261 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa25.2■■□□□ 1.62
LRIG1-201ENST00000273261 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.19■■□□□ 1.62
LRIG1-201ENST00000273261 SCAPERQ9BY12 1400 aa25.18■■□□□ 1.62
LRIG1-201ENST00000273261 NEXNQ0ZGT2 675 aa25.18■■□□□ 1.62
LRIG1-201ENST00000273261 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
LRIG1-201ENST00000273261 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
LRIG1-201ENST00000273261 DDX11L8A8MPP1 907 aa25.17■■□□□ 1.62
LRIG1-201ENST00000273261 TPM4P67936 248 aa25.17■■□□□ 1.62
LRIG1-201ENST00000273261 TTC5Q8N0Z6 440 aa25.16■■□□□ 1.62
LRIG1-201ENST00000273261 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.16■■□□□ 1.62
LRIG1-201ENST00000273261 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa25.14■■□□□ 1.62
LRIG1-201ENST00000273261 PSME1Q06323 249 aa25.14■■□□□ 1.62
LRIG1-201ENST00000273261 PHF14O94880 888 aa25.14■■□□□ 1.62
LRIG1-201ENST00000273261 DAPK1P53355 1430 aa25.13■■□□□ 1.61
LRIG1-201ENST00000273261 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
LRIG1-201ENST00000273261 REC8O95072 547 aa25.12■■□□□ 1.61
LRIG1-201ENST00000273261 DDX58O95786 925 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
LRIG1-201ENST00000273261 RILPL2Q969X0 211 aa25.11■■□□□ 1.61
LRIG1-201ENST00000273261 RUFY2Q8WXA3 655 aa25.1■■□□□ 1.61
LRIG1-201ENST00000273261 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
LRIG1-201ENST00000273261 CFAP70Q5T0N1 1121 aa25.1■■□□□ 1.61
LRIG1-201ENST00000273261 EVA1CP58658 441 aa25.09■■□□□ 1.61
LRIG1-201ENST00000273261 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
LRIG1-201ENST00000273261 CABP2Q9NPB3 220 aa25.08■■□□□ 1.61
LRIG1-201ENST00000273261 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa25.08■■□□□ 1.61
LRIG1-201ENST00000273261 GGNBP2Q9H3C7 697 aa25.08■■□□□ 1.61
LRIG1-201ENST00000273261 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.6
LRIG1-201ENST00000273261 TMEM132EQ6IEE7 984 aa25.07■■□□□ 1.6
LRIG1-201ENST00000273261 FANCIQ9NVI1 1328 aa25.07■■□□□ 1.6
LRIG1-201ENST00000273261 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25.07■■□□□ 1.6
LRIG1-201ENST00000273261 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
LRIG1-201ENST00000273261 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa25.06■■□□□ 1.6
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LRIG1-201ENST00000273261 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
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LRIG1-201ENST00000273261 ADAMTS8Q9UP79 889 aa25.04■■□□□ 1.6
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LRIG1-201ENST00000273261 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
LRIG1-201ENST00000273261 MTHFSP49914 203 aa25.03■■□□□ 1.6
LRIG1-201ENST00000273261 IQGAP2Q13576 1575 aa25.03■■□□□ 1.6
LRIG1-201ENST00000273261 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa25.01■■□□□ 1.59
LRIG1-201ENST00000273261 TOMM22Q9NS69 142 aa25■■□□□ 1.59
LRIG1-201ENST00000273261 MAP3K1Q13233 1512 aa25■■□□□ 1.59
LRIG1-201ENST00000273261 G3V3G9 751 aa24.99■■□□□ 1.59
LRIG1-201ENST00000273261 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
LRIG1-201ENST00000273261 DCAF8Q5TAQ9 597 aa24.99■■□□□ 1.59
LRIG1-201ENST00000273261 HMOX1P09601 288 aa24.99■■□□□ 1.59
LRIG1-201ENST00000273261 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
LRIG1-201ENST00000273261 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa24.99■■□□□ 1.59
LRIG1-201ENST00000273261 NBPF8Q3BBV2 869 aa24.99■■□□□ 1.59
LRIG1-201ENST00000273261 NBPF1Q3BBV0 1214 aa24.98■■□□□ 1.59
LRIG1-201ENST00000273261 TCP11L2Q8N4U5 519 aa24.98■■□□□ 1.59
LRIG1-201ENST00000273261 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa24.97■■□□□ 1.59
LRIG1-201ENST00000273261 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
LRIG1-201ENST00000273261 ATF3P18847 181 aa24.97■■□□□ 1.59
LRIG1-201ENST00000273261 BICRAQ9NZM4 1560 aa24.97■■□□□ 1.59
LRIG1-201ENST00000273261 H3BQV1 296 aa24.96■■□□□ 1.59
LRIG1-201ENST00000273261 IFFO2Q5TF58 517 aa24.96■■□□□ 1.59
LRIG1-201ENST00000273261 NAIPQ13075 1403 aa24.96■■□□□ 1.59
LRIG1-201ENST00000273261 FAM184AQ8NB25 1140 aa24.96■■□□□ 1.59
LRIG1-201ENST00000273261 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP24.95■■□□□ 1.58
LRIG1-201ENST00000273261 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
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LRIG1-201ENST00000273261 NLRP6P59044 892 aa24.94■■□□□ 1.58
LRIG1-201ENST00000273261 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
LRIG1-201ENST00000273261 ERBINQ96RT1 1412 aa24.93■■□□□ 1.58
LRIG1-201ENST00000273261 GPRASP1Q5JY77 1395 aa24.93■■□□□ 1.58
LRIG1-201ENST00000273261 CLSTN1O94985 981 aa24.93■■□□□ 1.58
LRIG1-201ENST00000273261 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
LRIG1-201ENST00000273261 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
LRIG1-201ENST00000273261 RNF20Q5VTR2 975 aa24.92■■□□□ 1.58
LRIG1-201ENST00000273261 RASSF8Q8NHQ8 419 aa24.92■■□□□ 1.58
LRIG1-201ENST00000273261 PRAM1Q96QH2 718 aa24.92■■□□□ 1.58
LRIG1-201ENST00000273261 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
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