RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262805.16

PDE4C-201, Transcript of phosphodiesterase 4C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4C, Length 2,472 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4C-201ENST00000262805 TET3O43151 1660 aa22.16■■□□□ 1.14
PDE4C-201ENST00000262805 MYOM1P52179 1685 aa22.16■■□□□ 1.14
PDE4C-201ENST00000262805 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP22.16■■□□□ 1.14
PDE4C-201ENST00000262805 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa22.16■■□□□ 1.14
PDE4C-201ENST00000262805 SKAP1Q86WV1 359 aa22.15■■□□□ 1.14
PDE4C-201ENST00000262805 CRBNQ96SW2 442 aa22.15■■□□□ 1.14
PDE4C-201ENST00000262805 SYNMO15061 1565 aa22.15■■□□□ 1.14
PDE4C-201ENST00000262805 SCAPERQ9BY12 1400 aa22.14■■□□□ 1.14
PDE4C-201ENST00000262805 UGGT1Q9NYU2 1555 aa22.14■■□□□ 1.13
PDE4C-201ENST00000262805 ATP7AQ04656 1500 aa22.14■■□□□ 1.13
PDE4C-201ENST00000262805 C20orf194Q5TEA3 1177 aa22.14■■□□□ 1.13
PDE4C-201ENST00000262805 ARAP3Q8WWN8 1544 aa22.13■■□□□ 1.13
PDE4C-201ENST00000262805 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
PDE4C-201ENST00000262805 KIF3BO15066 747 aa22.13■■□□□ 1.13
PDE4C-201ENST00000262805 NBR1Q14596 966 aa22.13■■□□□ 1.13
PDE4C-201ENST00000262805 FANCAO15360 1455 aa22.12■■□□□ 1.13
PDE4C-201ENST00000262805 VWDEQ8N2E2 1590 aa22.12■■□□□ 1.13
PDE4C-201ENST00000262805 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa22.1■■□□□ 1.13
PDE4C-201ENST00000262805 ABCA9Q8IUA7 1624 aa22.1■■□□□ 1.13
PDE4C-201ENST00000262805 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
PDE4C-201ENST00000262805 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP22.09■■□□□ 1.13
PDE4C-201ENST00000262805 MYT1LQ9UL68 1186 aa22.09■■□□□ 1.13
PDE4C-201ENST00000262805 CFAP70Q5T0N1 1121 aa22.09■■□□□ 1.13
PDE4C-201ENST00000262805 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
PDE4C-201ENST00000262805 PDE4AP27815 886 aa22.08■■□□□ 1.13
PDE4C-201ENST00000262805 MROH1Q8NDA8 1641 aa22.08■■□□□ 1.13
PDE4C-201ENST00000262805 DUSP27Q5VZP5 1158 aa22.07■■□□□ 1.12
PDE4C-201ENST00000262805 KANK1Q14678 1352 aa22.07■■□□□ 1.12
PDE4C-201ENST00000262805 CDCA8Q53HL2 280 aa22.07■■□□□ 1.12
PDE4C-201ENST00000262805 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa22.06■■□□□ 1.12
PDE4C-201ENST00000262805 ZNF521Q96K83 1311 aa22.06■■□□□ 1.12
PDE4C-201ENST00000262805 ABCA6Q8N139 1617 aa22.06■■□□□ 1.12
PDE4C-201ENST00000262805 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
PDE4C-201ENST00000262805 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
PDE4C-201ENST00000262805 CCDC146Q8IYE0 955 aa22.05■■□□□ 1.12
PDE4C-201ENST00000262805 ADGRL1O94910 1474 aa22.05■■□□□ 1.12
PDE4C-201ENST00000262805 STAC3Q96MF2 364 aa22.04■■□□□ 1.12
PDE4C-201ENST00000262805 BACH2Q9BYV9 841 aa22.04■■□□□ 1.12
PDE4C-201ENST00000262805 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa22.04■■□□□ 1.12
PDE4C-201ENST00000262805 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa22.03■■□□□ 1.12
PDE4C-201ENST00000262805 PIK3C2GO75747 1445 aa22.03■■□□□ 1.12
PDE4C-201ENST00000262805 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
PDE4C-201ENST00000262805 ERVK-7P63135 1459 aa22.02■■□□□ 1.12
PDE4C-201ENST00000262805 ASXL2Q76L83 1435 aa22.02■■□□□ 1.12
PDE4C-201ENST00000262805 MROH2AA6NES4 1674 aa22.02■■□□□ 1.12
PDE4C-201ENST00000262805 DEKP35659 375 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
PDE4C-201ENST00000262805 GOLGA2Q08379 1002 aa22■■□□□ 1.11
PDE4C-201ENST00000262805 CARD14Q9BXL6 1004 aa22■■□□□ 1.11
PDE4C-201ENST00000262805 MS4A1P11836 297 aa22■■□□□ 1.11
PDE4C-201ENST00000262805 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
PDE4C-201ENST00000262805 KIF1BO60333 1816 aa21.99■■□□□ 1.11
PDE4C-201ENST00000262805 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa21.99■■□□□ 1.11
PDE4C-201ENST00000262805 MYOM2P54296 1465 aa21.98■■□□□ 1.11
PDE4C-201ENST00000262805 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
PDE4C-201ENST00000262805 IFT172Q9UG01 1749 aa21.98■■□□□ 1.11
PDE4C-201ENST00000262805 EFCAB6Q5THR3 1501 aa21.97■■□□□ 1.11
PDE4C-201ENST00000262805 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa21.97■■□□□ 1.11
PDE4C-201ENST00000262805 NEURL4Q96JN8 1562 aa21.97■■□□□ 1.11
PDE4C-201ENST00000262805 SLFN5Q08AF3 891 aa21.97■■□□□ 1.11
PDE4C-201ENST00000262805 APAF1O14727 1248 aa21.96■■□□□ 1.11
PDE4C-201ENST00000262805 KDM2BQ8NHM5 1336 aa21.96■■□□□ 1.11
PDE4C-201ENST00000262805 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
PDE4C-201ENST00000262805 DMRT2Q9Y5R5 561 aa21.94■■□□□ 1.1
PDE4C-201ENST00000262805 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
PDE4C-201ENST00000262805 NOS1P29475 1434 aa21.91■■□□□ 1.1
PDE4C-201ENST00000262805 NRXN1Q9ULB1 1477 aa21.9■■□□□ 1.1
PDE4C-201ENST00000262805 CHGAP10645 457 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
PDE4C-201ENST00000262805 MYO3AQ8NEV4 1616 aa21.88■■□□□ 1.09
PDE4C-201ENST00000262805 BCAR3O75815 825 aa21.88■■□□□ 1.09
PDE4C-201ENST00000262805 ADGRB3O60242 1522 aa21.87■■□□□ 1.09
PDE4C-201ENST00000262805 TRAK1Q9UPV9 953 aa21.86■■□□□ 1.09
PDE4C-201ENST00000262805 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
PDE4C-201ENST00000262805 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
PDE4C-201ENST00000262805 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
PDE4C-201ENST00000262805 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
PDE4C-201ENST00000262805 LMTK2Q8IWU2 1503 aa21.85■■□□□ 1.09
PDE4C-201ENST00000262805 NPATQ14207 1427 aa21.84■■□□□ 1.09
PDE4C-201ENST00000262805 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa21.83■■□□□ 1.09
PDE4C-201ENST00000262805 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
PDE4C-201ENST00000262805 TMEM132EQ6IEE7 984 aa21.83■■□□□ 1.09
PDE4C-201ENST00000262805 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
PDE4C-201ENST00000262805 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa21.83■■□□□ 1.08
PDE4C-201ENST00000262805 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa21.82■■□□□ 1.08
PDE4C-201ENST00000262805 NSD3Q9BZ95 1437 aa21.82■■□□□ 1.08
PDE4C-201ENST00000262805 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa21.82■■□□□ 1.08
PDE4C-201ENST00000262805 GGT6Q6P531 493 aa21.82■■□□□ 1.08
PDE4C-201ENST00000262805 PPLO60437 1756 aa21.81■■□□□ 1.08
PDE4C-201ENST00000262805 GLI2P10070 1586 aa21.81■■□□□ 1.08
PDE4C-201ENST00000262805 SLC24A1O60721 1099 aa21.81■■□□□ 1.08
PDE4C-201ENST00000262805 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
PDE4C-201ENST00000262805 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
PDE4C-201ENST00000262805 QRICH2Q9H0J4 1663 aa21.81■■□□□ 1.08
PDE4C-201ENST00000262805 DIP2BQ9P265 1576 aa21.8■■□□□ 1.08
PDE4C-201ENST00000262805 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa21.8■■□□□ 1.08
PDE4C-201ENST00000262805 E9PSI1 815 aa21.8■■□□□ 1.08
PDE4C-201ENST00000262805 SHPRHQ149N8 1683 aa21.8■■□□□ 1.08
PDE4C-201ENST00000262805 ADGRB1O14514 1584 aa21.79■■□□□ 1.08
PDE4C-201ENST00000262805 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
PDE4C-201ENST00000262805 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
PDE4C-201ENST00000262805 C8orf34Q49A92 452 aa21.77■■□□□ 1.08
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