RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258148.11

MDM2-201, Transcript of MDM2 proto-oncogene, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene MDM2, Length 1,361 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2-201ENST00000258148 LILRB3O75022 631 aa9.8□□□□□ -0.84
MDM2-201ENST00000258148 SLC34A2O95436 690 aa9.8□□□□□ -0.84
MDM2-201ENST00000258148 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa9.8□□□□□ -0.84
MDM2-201ENST00000258148 RFX1P22670 979 aa9.8□□□□□ -0.84
MDM2-201ENST00000258148 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
MDM2-201ENST00000258148 CCDC27Q2M243 656 aa9.8□□□□□ -0.84
MDM2-201ENST00000258148 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
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MDM2-201ENST00000258148 IER5LQ5T953 404 aa9.79□□□□□ -0.84
MDM2-201ENST00000258148 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP9.79□□□□□ -0.84
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MDM2-201ENST00000258148 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa9.77□□□□□ -0.84
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MDM2-201ENST00000258148 WASHC4Q2M389 1173 aa9.73□□□□□ -0.85
MDM2-201ENST00000258148 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa9.73□□□□□ -0.85
MDM2-201ENST00000258148 UNCXA6NJT0 531 aa9.72□□□□□ -0.85
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MDM2-201ENST00000258148 NDUFV2P19404 249 aa9.72□□□□□ -0.85
MDM2-201ENST00000258148 UCN2Q96RP3 112 aa9.72□□□□□ -0.85
MDM2-201ENST00000258148 ALG2Q9H553 416 aa9.72□□□□□ -0.85
MDM2-201ENST00000258148 VRTNQ9H8Y1 702 aa9.72□□□□□ -0.85
MDM2-201ENST00000258148 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
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MDM2-201ENST00000258148 CABLES1Q8TDN4 633 aa9.71□□□□□ -0.86
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MDM2-201ENST00000258148 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
MDM2-201ENST00000258148 IGSF5Q9NSI5 407 aa9.7□□□□□ -0.86
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MDM2-201ENST00000258148 VAC14Q08AM6 782 aa9.69□□□□□ -0.86
MDM2-201ENST00000258148 NUTM1Q86Y26 1132 aa9.69□□□□□ -0.86
MDM2-201ENST00000258148 RCCD1A6NED2 376 aa9.68□□□□□ -0.86
MDM2-201ENST00000258148 PRSS12P56730 875 aa9.68□□□□□ -0.86
MDM2-201ENST00000258148 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
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MDM2-201ENST00000258148 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
MDM2-201ENST00000258148 SULF1Q8IWU6 871 aa9.64□□□□□ -0.87
MDM2-201ENST00000258148 PRR7Q8TB68 274 aa9.63□□□□□ -0.87
MDM2-201ENST00000258148 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
MDM2-201ENST00000258148 DDX11L8A8MPP1 907 aa9.63□□□□□ -0.87
MDM2-201ENST00000258148 CDCA8Q53HL2 280 aa9.63□□□□□ -0.87
MDM2-201ENST00000258148 POTEHQ6S545 545 aa9.63□□□□□ -0.87
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MDM2-201ENST00000258148 CTDSPL2Q05D32 466 aa9.62□□□□□ -0.87
MDM2-201ENST00000258148 ZDHHC16Q969W1 377 aa9.62□□□□□ -0.87
MDM2-201ENST00000258148 C3orf80F5H4A9 247 aa9.61□□□□□ -0.87
MDM2-201ENST00000258148 ADAM33Q9BZ11 813 aa9.61□□□□□ -0.87
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MDM2-201ENST00000258148 USP35Q9P2H5 1018 aa9.6□□□□□ -0.87
MDM2-201ENST00000258148 HOXA2O43364 376 aa9.58□□□□□ -0.88
MDM2-201ENST00000258148 KDM4AO75164 1064 aa9.58□□□□□ -0.88
MDM2-201ENST00000258148 SOX11P35716 441 aa9.58□□□□□ -0.88
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MDM2-201ENST00000258148 TMEM134Q9H6X4 195 aa9.58□□□□□ -0.88
MDM2-201ENST00000258148 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
MDM2-201ENST00000258148 PCDHGC3Q9UN70 934 aa9.58□□□□□ -0.88
MDM2-201ENST00000258148 DNAJB2P25686 324 aa9.57□□□□□ -0.88
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MDM2-201ENST00000258148 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
MDM2-201ENST00000258148 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa9.57□□□□□ -0.88
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MDM2-201ENST00000258148 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
MDM2-201ENST00000258148 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
MDM2-201ENST00000258148 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa9.55□□□□□ -0.88
MDM2-201ENST00000258148 TSKSQ9UJT2 592 aa9.55□□□□□ -0.88
MDM2-201ENST00000258148 MYT1LQ9UL68 1186 aa9.55□□□□□ -0.88
MDM2-201ENST00000258148 POTEFA5A3E0 1075 aa9.54□□□□□ -0.88
MDM2-201ENST00000258148 CLCN6P51797 869 aa9.54□□□□□ -0.88
MDM2-201ENST00000258148 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
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