RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000252487.9

TOMM40-201, Transcript of translocase of outer mitochondrial membrane 40, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TOMM40, Length 1,707 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOMM40-201ENST00000252487 PRAG1Q86YV5 1406 aa37.35■■■■□ 3.57
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TOMM40-201ENST00000252487 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa37.33■■■■□ 3.57
TOMM40-201ENST00000252487 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa37.33■■■■□ 3.57
TOMM40-201ENST00000252487 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa37.33■■■■□ 3.57
TOMM40-201ENST00000252487 MYOM2P54296 1465 aa37.33■■■■□ 3.57
TOMM40-201ENST00000252487 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP37.31■■■■□ 3.56
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TOMM40-201ENST00000252487 ZFYVE9O95405 1425 aa37.27■■■■□ 3.56
TOMM40-201ENST00000252487 TMEM2Q9UHN6 1383 aa37.26■■■■□ 3.55
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TOMM40-201ENST00000252487 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa37.23■■■■□ 3.55
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TOMM40-201ENST00000252487 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP37.2■■■■□ 3.55
TOMM40-201ENST00000252487 STAC3Q96MF2 364 aa37.19■■■■□ 3.54
TOMM40-201ENST00000252487 RALGAPBQ86X10 1494 aa37.18■■■■□ 3.54
TOMM40-201ENST00000252487 SLIT1O75093 1534 aa37.18■■■■□ 3.54
TOMM40-201ENST00000252487 PIK3C2GO75747 1445 aa37.18■■■■□ 3.54
TOMM40-201ENST00000252487 ARHGAP23Q9P227 1491 aa37.18■■■■□ 3.54
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TOMM40-201ENST00000252487 NBPF1Q3BBV0 1214 aa37.15■■■■□ 3.54
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TOMM40-201ENST00000252487 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa36.99■■■■□ 3.51
TOMM40-201ENST00000252487 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa36.99■■■■□ 3.51
TOMM40-201ENST00000252487 TMEM132EQ6IEE7 984 aa36.98■■■■□ 3.51
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TOMM40-201ENST00000252487 ANKLE2Q86XL3 938 aa36.96■■■■□ 3.51
TOMM40-201ENST00000252487 ADGRB1O14514 1584 aa36.96■■■■□ 3.51
TOMM40-201ENST00000252487 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP36.95■■■■□ 3.51
TOMM40-201ENST00000252487 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa36.93■■■■□ 3.5
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TOMM40-201ENST00000252487 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa36.76■■■■□ 3.48
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TOMM40-201ENST00000252487 ABCC11Q96J66 1382 aa36.62■■■■□ 3.45
TOMM40-201ENST00000252487 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP36.62■■■■□ 3.45
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TOMM40-201ENST00000252487 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP36.6■■■■□ 3.45
TOMM40-201ENST00000252487 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP36.59■■■■□ 3.45
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TOMM40-201ENST00000252487 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa36.59■■■■□ 3.45
TOMM40-201ENST00000252487 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP36.59■■■■□ 3.45
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TOMM40-201ENST00000252487 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP36.59■■■■□ 3.45
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TOMM40-201ENST00000252487 CPS1P31327 1500 aa36.58■■■■□ 3.45
TOMM40-201ENST00000252487 TECPR2O15040 1411 aa36.58■■■■□ 3.45
TOMM40-201ENST00000252487 WAPLQ7Z5K2 1190 aa36.57■■■■□ 3.45
TOMM40-201ENST00000252487 ROBO2Q9HCK4 1378 aa36.57■■■■□ 3.45
TOMM40-201ENST00000252487 PIK3R4Q99570 1358 aa36.55■■■■□ 3.44
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TOMM40-201ENST00000252487 KCNA6P17658 529 aa36.53■■■■□ 3.44
TOMM40-201ENST00000252487 DISP3Q9P2K9 1392 aa36.51■■■■□ 3.44
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TOMM40-201ENST00000252487 FAM135BQ49AJ0 1406 aa36.47■■■■□ 3.43
TOMM40-201ENST00000252487 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP36.47■■■■□ 3.43
TOMM40-201ENST00000252487 PTCH1Q13635 1447 aa36.46■■■■□ 3.43
TOMM40-201ENST00000252487 KIF7Q2M1P5 1343 aa36.46■■■■□ 3.43
TOMM40-201ENST00000252487 NWD1Q149M9 1564 aa36.46■■■■□ 3.43
TOMM40-201ENST00000252487 POLR3GLQ9BT43 218 aa36.45■■■■□ 3.43
TOMM40-201ENST00000252487 STRCP1A6NGW2 1772 aa36.45■■■■□ 3.43
TOMM40-201ENST00000252487 CCDC7Q96M83 1385 aa36.43■■■■□ 3.42
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