RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
SPCS1-201ENST00000233025 MYO5BQ9ULV0 1848 aa26.49■■□□□ 1.83
SPCS1-201ENST00000233025 ADRA2BP18089 450 aa26.48■■□□□ 1.83
SPCS1-201ENST00000233025 ERBINQ96RT1 1412 aa26.48■■□□□ 1.83
SPCS1-201ENST00000233025 CROCC2H7BZ55 1655 aa26.47■■□□□ 1.83
SPCS1-201ENST00000233025 IDI1Q13907 227 aa26.47■■□□□ 1.83
SPCS1-201ENST00000233025 RGS12O14924 1447 aa26.46■■□□□ 1.83
SPCS1-201ENST00000233025 LMTK2Q8IWU2 1503 aa26.45■■□□□ 1.83
SPCS1-201ENST00000233025 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.82
SPCS1-201ENST00000233025 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa26.44■■□□□ 1.82
SPCS1-201ENST00000233025 KIF15Q9NS87 1388 aa26.42■■□□□ 1.82
SPCS1-201ENST00000233025 NOS1P29475 1434 aa26.41■■□□□ 1.82
SPCS1-201ENST00000233025 ZFYVE9O95405 1425 aa26.39■■□□□ 1.82
SPCS1-201ENST00000233025 MSH5O43196 834 aa26.39■■□□□ 1.82
SPCS1-201ENST00000233025 AFF2P51816 1311 aa26.39■■□□□ 1.81
SPCS1-201ENST00000233025 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa26.37■■□□□ 1.81
SPCS1-201ENST00000233025 GCC2Q8IWJ2 1684 aa26.37■■□□□ 1.81
SPCS1-201ENST00000233025 MYOM3Q5VTT5 1437 aa26.36■■□□□ 1.81
SPCS1-201ENST00000233025 NHSL1Q5SYE7 1610 aa26.36■■□□□ 1.81
SPCS1-201ENST00000233025 KANK1Q14678 1352 aa26.33■■□□□ 1.81
SPCS1-201ENST00000233025 EP400Q96L91 3159 aa26.33■■□□□ 1.81
SPCS1-201ENST00000233025 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP26.33■■□□□ 1.81
SPCS1-201ENST00000233025 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP26.32■■□□□ 1.8
SPCS1-201ENST00000233025 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP26.32■■□□□ 1.8
SPCS1-201ENST00000233025 CADPS2Q86UW7 1296 aa26.32■■□□□ 1.8
SPCS1-201ENST00000233025 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP26.32■■□□□ 1.8
SPCS1-201ENST00000233025 BCANQ96GW7 911 aa26.32■■□□□ 1.8
SPCS1-201ENST00000233025 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa26.31■■□□□ 1.8
SPCS1-201ENST00000233025 SETD5Q9C0A6 1442 aa26.3■■□□□ 1.8
SPCS1-201ENST00000233025 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa26.29■■□□□ 1.8
SPCS1-201ENST00000233025 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa26.29■■□□□ 1.8
SPCS1-201ENST00000233025 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP26.28■■□□□ 1.8
SPCS1-201ENST00000233025 BRINP3Q76B58 766 aa26.28■■□□□ 1.8
SPCS1-201ENST00000233025 C14orf37Q86TY3 774 aa26.27■■□□□ 1.8
SPCS1-201ENST00000233025 C19orf44Q9H6X5 657 aa26.27■■□□□ 1.8
SPCS1-201ENST00000233025 RIMS2Q9UQ26 1411 aa26.27■■□□□ 1.8
SPCS1-201ENST00000233025 ABCC5O15440 1437 aa26.26■■□□□ 1.79
SPCS1-201ENST00000233025 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa26.26■■□□□ 1.79
SPCS1-201ENST00000233025 SLC52A1Q9NWF4 448 aa26.26■■□□□ 1.79
SPCS1-201ENST00000233025 ATF3P18847 181 aa26.25■■□□□ 1.79
SPCS1-201ENST00000233025 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa26.25■■□□□ 1.79
SPCS1-201ENST00000233025 TBX22Q9Y458 520 aa26.25■■□□□ 1.79
SPCS1-201ENST00000233025 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
SPCS1-201ENST00000233025 ATAD2Q6PL18 1390 aa26.23■■□□□ 1.79
SPCS1-201ENST00000233025 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP26.23■■□□□ 1.79
SPCS1-201ENST00000233025 DCCP43146 1447 aa26.22■■□□□ 1.79
SPCS1-201ENST00000233025 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
SPCS1-201ENST00000233025 PIK3R4Q99570 1358 aa26.2■■□□□ 1.79
SPCS1-201ENST00000233025 C8orf37Q96NL8 207 aa26.2■■□□□ 1.78
SPCS1-201ENST00000233025 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP26.19■■□□□ 1.78
SPCS1-201ENST00000233025 ZRANB1Q9UGI0 708 aa26.19■■□□□ 1.78
SPCS1-201ENST00000233025 PTPN23Q9H3S7 1636 aa26.18■■□□□ 1.78
SPCS1-201ENST00000233025 PNPLA6Q8IY17 1366 aa26.18■■□□□ 1.78
SPCS1-201ENST00000233025 DAPK1P53355 1430 aa26.17■■□□□ 1.78
SPCS1-201ENST00000233025 MST1RQ04912 1400 aa26.17■■□□□ 1.78
SPCS1-201ENST00000233025 TRPM2O94759 1503 aa26.17■■□□□ 1.78
SPCS1-201ENST00000233025 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP26.17■■□□□ 1.78
SPCS1-201ENST00000233025 PTPRUQ92729 1446 aa26.14■■□□□ 1.77
SPCS1-201ENST00000233025 HDGFP51858 240 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
SPCS1-201ENST00000233025 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
SPCS1-201ENST00000233025 NGLY1Q96IV0 654 aa26.12■■□□□ 1.77
SPCS1-201ENST00000233025 UNC13BO14795 1591 aa26.12■■□□□ 1.77
SPCS1-201ENST00000233025 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
SPCS1-201ENST00000233025 LAMC1P11047 1609 aa26.09■■□□□ 1.77
SPCS1-201ENST00000233025 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa26.07■■□□□ 1.76
SPCS1-201ENST00000233025 VPS8Q8N3P4 1428 aa26.07■■□□□ 1.76
SPCS1-201ENST00000233025 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP26.07■■□□□ 1.76
SPCS1-201ENST00000233025 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa26.07■■□□□ 1.76
SPCS1-201ENST00000233025 LRP5O75197 1615 aa26.06■■□□□ 1.76
SPCS1-201ENST00000233025 NALCNQ8IZF0 1738 aa26.05■■□□□ 1.76
SPCS1-201ENST00000233025 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa26.05■■□□□ 1.76
SPCS1-201ENST00000233025 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
SPCS1-201ENST00000233025 ATRNO75882 1429 aa26.03■■□□□ 1.76
SPCS1-201ENST00000233025 E9PCH4 1651 aa26.01■■□□□ 1.75
SPCS1-201ENST00000233025 ADAMTS2O95450 1211 aa26.01■■□□□ 1.75
SPCS1-201ENST00000233025 ADGRL2O95490 1459 aa26■■□□□ 1.75
SPCS1-201ENST00000233025 USP21Q9UK80 565 aa25.99■■□□□ 1.75
SPCS1-201ENST00000233025 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
SPCS1-201ENST00000233025 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
SPCS1-201ENST00000233025 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa25.98■■□□□ 1.75
SPCS1-201ENST00000233025 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
SPCS1-201ENST00000233025 CCDC125Q86Z20 511 aa25.98■■□□□ 1.75
SPCS1-201ENST00000233025 PTCH1Q13635 1447 aa25.97■■□□□ 1.75
SPCS1-201ENST00000233025 CHIC2Q9UKJ5 165 aa25.97■■□□□ 1.75
SPCS1-201ENST00000233025 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
SPCS1-201ENST00000233025 IQGAP3Q86VI3 1631 aa25.93■■□□□ 1.74
SPCS1-201ENST00000233025 CHGAP10645 457 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
SPCS1-201ENST00000233025 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
SPCS1-201ENST00000233025 C1orf167Q5SNV9 1468 aa25.91■■□□□ 1.74
SPCS1-201ENST00000233025 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa25.9■■□□□ 1.74
SPCS1-201ENST00000233025 BRWD3Q6RI45 1802 aa25.89■■□□□ 1.74
SPCS1-201ENST00000233025 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
SPCS1-201ENST00000233025 BCL9LQ86UU0 1499 aa25.88■■□□□ 1.73
SPCS1-201ENST00000233025 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
SPCS1-201ENST00000233025 MYOM2P54296 1465 aa25.86■■□□□ 1.73
SPCS1-201ENST00000233025 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa25.86■■□□□ 1.73
SPCS1-201ENST00000233025 METP08581 1390 aa25.85■■□□□ 1.73
SPCS1-201ENST00000233025 GLI3P10071 1580 aa25.82■■□□□ 1.72
SPCS1-201ENST00000233025 DEFB132Q7Z7B7 95 aa25.78■■□□□ 1.72
SPCS1-201ENST00000233025 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP25.77■■□□□ 1.72
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