RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000155840.9

KCNQ1-201, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNQ1, Length 3,245 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-201ENST00000155840 ARHGAP5Q13017 1502 aa22.4■■□□□ 1.18
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KCNQ1-201ENST00000155840 CARD14Q9BXL6 1004 aa22.38■■□□□ 1.17
KCNQ1-201ENST00000155840 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa22.38■■□□□ 1.17
KCNQ1-201ENST00000155840 ITSN2Q9NZM3 1697 aa22.38■■□□□ 1.17
KCNQ1-201ENST00000155840 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
KCNQ1-201ENST00000155840 KDM5DQ9BY66 1539 aa22.37■■□□□ 1.17
KCNQ1-201ENST00000155840 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
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KCNQ1-201ENST00000155840 CCDC141Q6ZP82 1450 aa22.36■■□□□ 1.17
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KCNQ1-201ENST00000155840 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa22.35■■□□□ 1.17
KCNQ1-201ENST00000155840 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa22.35■■□□□ 1.17
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KCNQ1-201ENST00000155840 SYNJ2O15056 1496 aa22.33■■□□□ 1.16
KCNQ1-201ENST00000155840 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa22.32■■□□□ 1.16
KCNQ1-201ENST00000155840 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa22.32■■□□□ 1.16
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KCNQ1-201ENST00000155840 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
KCNQ1-201ENST00000155840 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
KCNQ1-201ENST00000155840 TCP11L2Q8N4U5 519 aa22.29■■□□□ 1.16
KCNQ1-201ENST00000155840 E9PSI1 815 aa22.28■■□□□ 1.16
KCNQ1-201ENST00000155840 FOXD4L1Q9NU39 408 aa22.28■■□□□ 1.16
KCNQ1-201ENST00000155840 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa22.28■■□□□ 1.16
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KCNQ1-201ENST00000155840 ZNF521Q96K83 1311 aa22.27■■□□□ 1.16
KCNQ1-201ENST00000155840 CDCA8Q53HL2 280 aa22.27■■□□□ 1.15
KCNQ1-201ENST00000155840 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa22.27■■□□□ 1.15
KCNQ1-201ENST00000155840 STK26Q9P289 416 aa22.27■■□□□ 1.15
KCNQ1-201ENST00000155840 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa22.26■■□□□ 1.15
KCNQ1-201ENST00000155840 CROCC2H7BZ55 1655 aa22.26■■□□□ 1.15
KCNQ1-201ENST00000155840 GGT6Q6P531 493 aa22.26■■□□□ 1.15
KCNQ1-201ENST00000155840 MTHFSP49914 203 aa22.25■■□□□ 1.15
KCNQ1-201ENST00000155840 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa22.25■■□□□ 1.15
KCNQ1-201ENST00000155840 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa22.25■■□□□ 1.15
KCNQ1-201ENST00000155840 WDR7Q9Y4E6 1490 aa22.25■■□□□ 1.15
KCNQ1-201ENST00000155840 RSPH4AQ5TD94 716 aa22.24■■□□□ 1.15
KCNQ1-201ENST00000155840 USP19O94966 1318 aa22.23■■□□□ 1.15
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KCNQ1-201ENST00000155840 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
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KCNQ1-201ENST00000155840 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa22.21■■□□□ 1.15
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KCNQ1-201ENST00000155840 SHANK2Q9UPX8 1470 aa22.19■■□□□ 1.14
KCNQ1-201ENST00000155840 BECN1Q14457 450 aa22.19■■□□□ 1.14
KCNQ1-201ENST00000155840 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
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KCNQ1-201ENST00000155840 PANK2Q9BZ23 570 aa22.16■■□□□ 1.14
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KCNQ1-201ENST00000155840 GGNBP2Q9H3C7 697 aa22.14■■□□□ 1.14
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KCNQ1-201ENST00000155840 NUP160Q12769 1436 aa22.13■■□□□ 1.13
KCNQ1-201ENST00000155840 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
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KCNQ1-201ENST00000155840 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa22.1■■□□□ 1.13
KCNQ1-201ENST00000155840 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa22.09■■□□□ 1.13
KCNQ1-201ENST00000155840 RUNDC1Q96C34 613 aa22.09■■□□□ 1.13
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KCNQ1-201ENST00000155840 LNPKQ9C0E8 428 aa22.09■■□□□ 1.13
KCNQ1-201ENST00000155840 PDE3AQ14432 1141 aa22.08■■□□□ 1.12
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KCNQ1-201ENST00000155840 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
KCNQ1-201ENST00000155840 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa22.05■■□□□ 1.12
KCNQ1-201ENST00000155840 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP22.05■■□□□ 1.12
KCNQ1-201ENST00000155840 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
KCNQ1-201ENST00000155840 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
KCNQ1-201ENST00000155840 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
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KCNQ1-201ENST00000155840 CFAP53Q96M91 514 aa22.03■■□□□ 1.12
KCNQ1-201ENST00000155840 C22orf23Q9BZE7 217 aa22.03■■□□□ 1.12
KCNQ1-201ENST00000155840 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
KCNQ1-201ENST00000155840 MYO5CQ9NQX4 1742 aa22.02■■□□□ 1.12
KCNQ1-201ENST00000155840 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
KCNQ1-201ENST00000155840 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
KCNQ1-201ENST00000155840 SSH1Q8WYL5 1049 aa22.01■■□□□ 1.11
KCNQ1-201ENST00000155840 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP22.01■■□□□ 1.11
KCNQ1-201ENST00000155840 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
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