RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000107060.7

Eftud2-202, Transcript of 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Eftud2, Length 3,339 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Myom2Q14BI5 1463 aa20.43■□□□□ 0.86
Eftud2-202ENSMUST00000107060 DnmbpQ6TXD4 1580 aa20.43■□□□□ 0.86
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Mroh3A0A1D5RM54 893 aa20.43■□□□□ 0.86
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm156Q58A37 223 aa20.41■□□□□ 0.86
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ptch1Q61115 1434 aa20.4■□□□□ 0.86
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Adamts7Q68SA9 1657 aa20.4■□□□□ 0.86
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Myo3aQ8K3H5 1613 aa20.38■□□□□ 0.85
Eftud2-202ENSMUST00000107060 ErbinQ80TH2 1402 aa20.38■□□□□ 0.85
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Sall3Q62255 1320 aa20.38■□□□□ 0.85
Eftud2-202ENSMUST00000107060 AatkQ80YE4 1365 aa20.38■□□□□ 0.85
Eftud2-202ENSMUST00000107060 PrxO55103 1391 aa20.37■□□□□ 0.85
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Arid4bA2CG63 1314 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Plxnc1Q9QZC2 1574 aa20.36■□□□□ 0.85
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Uggt1Q6P5E4 1551 aa20.35■□□□□ 0.85
Eftud2-202ENSMUST00000107060 NrdcQ8BHG1 1161 aa20.35■□□□□ 0.85
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm16486A0A1D5RMD1 1434 aa20.34■□□□□ 0.85
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Adgrl3Q80TS3 1537 aa20.34■□□□□ 0.85
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ift172Q6VH22 1749 aa20.33■□□□□ 0.85
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Nphp4P59240 1425 aa20.33■□□□□ 0.85
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Tex14Q7M6U3 1450 aa20.32■□□□□ 0.84
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ttc37F8VPK0 1563 aa20.32■□□□□ 0.84
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Talpid3E9PV87 1520 aa20.32■□□□□ 0.84
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Myom1Q62234 1667 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
Eftud2-202ENSMUST00000107060 SafbD3YXK2 937 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Mroh1E0CZ22 1640 aa20.3■□□□□ 0.84
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Slc24a1Q91WD8 1130 aa20.28■□□□□ 0.84
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Srcin1Q9QWI6 1250 aa20.28■□□□□ 0.84
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Knl1Q66JQ7 1612 aa20.27■□□□□ 0.84
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Hecw2Q6I6G8 1578 aa20.27■□□□□ 0.84
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Stard8Q8K031 1019 aa20.27■□□□□ 0.83
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Pank3Q8R2W9 370 aa20.27■□□□□ 0.83
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Kdm5aQ3UXZ9 1690 aa20.27■□□□□ 0.83
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Calr4Q3TQS0 420 aa20.26■□□□□ 0.83
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Rpgrip1lQ8CG73 1264 aa20.24■□□□□ 0.83
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Erich6D3Z6S9 713 aa20.24■□□□□ 0.83
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Zscan10Q3URR7 782 aa20.23■□□□□ 0.83
Eftud2-202ENSMUST00000107060 CenpbP27790 599 aa20.23■□□□□ 0.83
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Tmf1B9EKI3 1091 aa20.22■□□□□ 0.83
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Yeats2Q3TUF7 1407 aa20.22■□□□□ 0.83
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Synj2Q9D2G5 1434 aa20.22■□□□□ 0.83
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Inpp5dQ9ES52 1191 aa20.2■□□□□ 0.82
Eftud2-202ENSMUST00000107060 MaddQ80U28 1577 aa20.2■□□□□ 0.82
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm38655A0A286YDK6 273 aa20.2■□□□□ 0.82
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ttbk1Q6PCN3 1308 aa20.18■□□□□ 0.82
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Kdm2aP59997 1161 aa20.17■□□□□ 0.82
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Zscan21Q07231 555 aa20.17■□□□□ 0.82
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Stk24Q99KH8 431 aa20.17■□□□□ 0.82
Eftud2-202ENSMUST00000107060 AU022751B1B0V2 589 aa20.16■□□□□ 0.82
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm20521D3Z5F7 333 aa20.16■□□□□ 0.82
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Fam184bQ0KK56 942 aa20.15■□□□□ 0.82
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ofd1Q80Z25 1017 aa20.15■□□□□ 0.82
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Anp32bQ9EST5 272 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.82
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Skint5A7XUY5 1461 aa20.14■□□□□ 0.81
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Atf7ipQ7TT18 1306 aa20.14■□□□□ 0.81
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Qser1A2BIE1 1698 aa20.14■□□□□ 0.81
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ahdc1Q6PAL7 1594 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gtf2e1Q9D0D5 440 aa20.14■□□□□ 0.81
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Kank1E9Q238 1360 aa20.13■□□□□ 0.81
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gprasp1Q5U4C1 1347 aa20.13■□□□□ 0.81
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Q7TT23 1179 aa20.13■□□□□ 0.81
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Usp40Q8BWR4 1235 aa20.13■□□□□ 0.81
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Cfap65Q3V0B4 1847 aa20.13■□□□□ 0.81
Eftud2-202ENSMUST00000107060 PalldQ9ET54 1408 aa20.13■□□□□ 0.81
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Slc4a1apE9PX68 744 aa20.13■□□□□ 0.81
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Srpk2O54781 681 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Zbtb4Q5F293 982 aa20.11■□□□□ 0.81
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Lrrc7Q80TE7 1490 aa20.11■□□□□ 0.81
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Rab3gap2Q8BMG7 1366 aa20.1■□□□□ 0.81
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Arhgap23Q69ZH9 1483 aa20.1■□□□□ 0.81
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Fan1Q69ZT1 1020 aa20.1■□□□□ 0.81
Eftud2-202ENSMUST00000107060 KdrP35918 1367 aa20.09■□□□□ 0.81
Eftud2-202ENSMUST00000107060 L3mbtl2P59178 703 aa20.09■□□□□ 0.81
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Mak16Q8BGS0 296 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Itsn1Q9Z0R4 1714 aa20.08■□□□□ 0.81
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Eif2ak4Q9QZ05 1648 aa20.08■□□□□ 0.81
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Puf60Q3UEB3 564 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ppp2r1aQ76MZ3 589 aa20.08■□□□□ 0.81
Eftud2-202ENSMUST00000107060 PtprmP28828 1452 aa20.08■□□□□ 0.8
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Slc52a2Q9D8F3 450 aa20.07■□□□□ 0.8
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Kif13aQ9EQW7 1749 aa20.07■□□□□ 0.8
Eftud2-202ENSMUST00000107060 RictorQ6QI06 1708 aa20.06■□□□□ 0.8
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Hfm1D3Z4R1 1434 aa20.05■□□□□ 0.8
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ttc41Q692V3 1318 aa20.05■□□□□ 0.8
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Eif5bQ05D44 1216 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Zfp444Q3TDV8 331 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
Eftud2-202ENSMUST00000107060 InsrP15208 1372 aa20.04■□□□□ 0.8
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Erbb3Q61526 1339 aa20.04■□□□□ 0.8
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Mink1Q9JM52 1308 aa20.03■□□□□ 0.8
Eftud2-202ENSMUST00000107060 CltcQ68FD5 1675 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Anp32aO35381 247 aa20.02■□□□□ 0.8
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Arhgef28P97433 1693 aa20.01■□□□□ 0.79
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Prrc2bQ7TPM1 1486 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Os9Q8K2C7 672 aa20■□□□□ 0.79
Eftud2-202ENSMUST00000107060 P3h3Q8CG70 732 aa19.99■□□□□ 0.79
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Nrxn1Q9CS84 1514 aa19.98■□□□□ 0.79
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Zc3h13E9Q784 1729 aaKnown RBP19.96■□□□□ 0.79
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Kif7B7ZNG0 1348 aa19.96■□□□□ 0.79
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Rsph4aQ8BYM7 716 aa19.95■□□□□ 0.78
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Adgrl1Q80TR1 1466 aa19.95■□□□□ 0.78
Eftud2-202ENSMUST00000107060 PplQ9R269 1755 aa19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 23.7 ms