RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000020657.12

Ube2b-201, Transcript of Ubiquitin-conjugating enzyme E2 B, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ube2b, Length 1,792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Rims1Q99NE5 1463 aa28.68■■■□□ 2.18
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Ehbp1l1Q99MS7 1716 aa28.68■■■□□ 2.18
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Stard8Q8K031 1019 aa28.66■■■□□ 2.18
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Anp32bQ9EST5 272 aaKnown RBP28.65■■■□□ 2.18
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Srcin1Q9QWI6 1250 aa28.65■■■□□ 2.18
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Talpid3E9PV87 1520 aa28.65■■■□□ 2.18
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Myom2Q14BI5 1463 aa28.64■■■□□ 2.18
Ube2b-201ENSMUST00000020657 AatkQ80YE4 1365 aa28.63■■■□□ 2.17
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Ino80Q6ZPV2 1559 aa28.63■■■□□ 2.17
Ube2b-201ENSMUST00000020657 1700123L14RikQ3V2K7 440 aa28.62■■■□□ 2.17
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Zmym4A2A791 1549 aaKnown RBP28.62■■■□□ 2.17
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Stk24Q99KH8 431 aa28.62■■■□□ 2.17
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Prdm2A2A7B5 1709 aaKnown RBP28.61■■■□□ 2.17
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Kdm2aP59997 1161 aa28.61■■■□□ 2.17
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Itsn2Q9Z0R6 1659 aa28.61■■■□□ 2.17
Ube2b-201ENSMUST00000020657 PrxO55103 1391 aa28.59■■■□□ 2.17
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Gm20521D3Z5F7 333 aa28.58■■■□□ 2.17
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Ttc37F8VPK0 1563 aa28.57■■■□□ 2.16
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Adamts7Q68SA9 1657 aa28.57■■■□□ 2.16
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Cul9Q80TT8 1865 aa28.57■■■□□ 2.16
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Synj2Q9D2G5 1434 aa28.57■■■□□ 2.16
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Tmf1B9EKI3 1091 aa28.56■■■□□ 2.16
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Srpk2O54781 681 aaKnown RBP28.55■■■□□ 2.16
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Os9Q8K2C7 672 aa28.55■■■□□ 2.16
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Myo3aQ8K3H5 1613 aa28.55■■■□□ 2.16
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Zbtb4Q5F293 982 aa28.55■■■□□ 2.16
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Pank3Q8R2W9 370 aa28.53■■■□□ 2.16
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Nphp4P59240 1425 aa28.53■■■□□ 2.16
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Uggt1Q6P5E4 1551 aa28.53■■■□□ 2.16
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Hecw2Q6I6G8 1578 aa28.52■■■□□ 2.16
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Cdk5rap2Q8K389 1822 aa28.52■■■□□ 2.16
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Plxnc1Q9QZC2 1574 aa28.5■■■□□ 2.15
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Gtf2e1Q9D0D5 440 aa28.5■■■□□ 2.15
Ube2b-201ENSMUST00000020657 DnmbpQ6TXD4 1580 aa28.49■■■□□ 2.15
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Yeats2Q3TUF7 1407 aa28.48■■■□□ 2.15
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Zscan10Q3URR7 782 aa28.47■■■□□ 2.15
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Knl1Q66JQ7 1612 aa28.46■■■□□ 2.15
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Gm16486A0A1D5RMD1 1434 aa28.45■■■□□ 2.15
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Ppp1r18Q8BQ30 594 aa28.45■■■□□ 2.14
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Inpp5dQ9ES52 1191 aa28.45■■■□□ 2.14
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Sipa1l1Q8C0T5 1782 aa28.44■■■□□ 2.14
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Usp40Q8BWR4 1235 aa28.43■■■□□ 2.14
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Mroh1E0CZ22 1640 aa28.43■■■□□ 2.14
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Fan1Q69ZT1 1020 aa28.42■■■□□ 2.14
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Rsph4aQ8BYM7 716 aa28.42■■■□□ 2.14
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Calr4Q3TQS0 420 aa28.42■■■□□ 2.14
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Fam184bQ0KK56 942 aa28.41■■■□□ 2.14
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Zscan21Q07231 555 aa28.4■■■□□ 2.14
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Rpgrip1lQ8CG73 1264 aa28.4■■■□□ 2.14
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Slc4a1apE9PX68 744 aa28.39■■■□□ 2.13
Ube2b-201ENSMUST00000020657 CenpbP27790 599 aa28.39■■■□□ 2.13
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Cfap65Q3V0B4 1847 aa28.38■■■□□ 2.13
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Tex14Q7M6U3 1450 aa28.37■■■□□ 2.13
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Puf60Q3UEB3 564 aaKnown RBP28.36■■■□□ 2.13
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Ofd1Q80Z25 1017 aa28.36■■■□□ 2.13
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Skint5A7XUY5 1461 aa28.36■■■□□ 2.13
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Slc52a2Q9D8F3 450 aa28.35■■■□□ 2.13
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Kdm5aQ3UXZ9 1690 aa28.34■■■□□ 2.13
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Ttbk1Q6PCN3 1308 aa28.33■■■□□ 2.12
Ube2b-201ENSMUST00000020657 PalldQ9ET54 1408 aa28.3■■■□□ 2.12
Ube2b-201ENSMUST00000020657 AU022751B1B0V2 589 aa28.3■■■□□ 2.12
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Eif5bQ05D44 1216 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Hfm1D3Z4R1 1434 aa28.29■■■□□ 2.12
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Myom1Q62234 1667 aaKnown RBP28.29■■■□□ 2.12
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Ahdc1Q6PAL7 1594 aaKnown RBP28.28■■■□□ 2.12
Ube2b-201ENSMUST00000020657 SafbD3YXK2 937 aaKnown RBP28.28■■■□□ 2.12
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Lrrc7Q80TE7 1490 aa28.28■■■□□ 2.12
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Rab3gap2Q8BMG7 1366 aa28.27■■■□□ 2.12
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Ift172Q6VH22 1749 aa28.27■■■□□ 2.12
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Mak16Q8BGS0 296 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
Ube2b-201ENSMUST00000020657 MaddQ80U28 1577 aa28.25■■■□□ 2.11
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Q7TT23 1179 aa28.24■■■□□ 2.11
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Ppp2r1aQ76MZ3 589 aa28.22■■■□□ 2.11
Ube2b-201ENSMUST00000020657 IqubQ8CDK3 788 aa28.22■■■□□ 2.11
Ube2b-201ENSMUST00000020657 NpatQ8BMA5 1420 aa28.21■■■□□ 2.11
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Atf7ipQ7TT18 1306 aa28.21■■■□□ 2.11
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Prrc2bQ7TPM1 1486 aaKnown RBP28.19■■■□□ 2.1
Ube2b-201ENSMUST00000020657 InsrP15208 1372 aa28.19■■■□□ 2.1
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Qser1A2BIE1 1698 aa28.18■■■□□ 2.1
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Gprasp1Q5U4C1 1347 aa28.17■■■□□ 2.1
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Gm38655A0A286YDK6 273 aa28.17■■■□□ 2.1
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Stag3O70576 1240 aa28.17■■■□□ 2.1
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Eif2ak4Q9QZ05 1648 aa28.17■■■□□ 2.1
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Arhgap23Q69ZH9 1483 aa28.14■■■□□ 2.1
Ube2b-201ENSMUST00000020657 CenpjQ569L8 1344 aa28.14■■■□□ 2.1
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Kif7B7ZNG0 1348 aa28.13■■■□□ 2.09
Ube2b-201ENSMUST00000020657 CltcQ68FD5 1675 aaKnown RBP28.13■■■□□ 2.09
Ube2b-201ENSMUST00000020657 PtprmP28828 1452 aa28.11■■■□□ 2.09
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Afap1Q80YS6 731 aa28.11■■■□□ 2.09
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Upf2A2AT37 1269 aaKnown RBP28.1■■■□□ 2.09
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Kank1E9Q238 1360 aa28.09■■■□□ 2.09
Ube2b-201ENSMUST00000020657 KdrP35918 1367 aa28.09■■■□□ 2.09
Ube2b-201ENSMUST00000020657 RictorQ6QI06 1708 aa28.08■■■□□ 2.08
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Dnajc5P60904 198 aa28.07■■■□□ 2.08
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Zfp444Q3TDV8 331 aaKnown RBP28.07■■■□□ 2.08
Ube2b-201ENSMUST00000020657 P3h3Q8CG70 732 aa28.07■■■□□ 2.08
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Anp32aO35381 247 aa28.06■■■□□ 2.08
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Dcaf11Q91VU6 549 aa28.06■■■□□ 2.08
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Kif13aQ9EQW7 1749 aa28.05■■■□□ 2.08
Ube2b-201ENSMUST00000020657 Itsn1Q9Z0R4 1714 aa28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 30.6 ms