RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000001172.11

Ankrd39-201, Transcript of Ankyrin repeat domain-containing protein 39, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ankrd39, Length 2,109 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Ppp1r18Q8BQ30 594 aa24.41■■□□□ 1.5
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Akap12Q9WTQ5 1684 aa24.41■■□□□ 1.5
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Cul9Q80TT8 1865 aa24.4■■□□□ 1.5
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Ttc37F8VPK0 1563 aa24.4■■□□□ 1.5
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Rims1Q99NE5 1463 aa24.4■■□□□ 1.5
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Ehbp1l1Q99MS7 1716 aa24.4■■□□□ 1.5
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Gm20521D3Z5F7 333 aa24.39■■□□□ 1.49
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Pola1P33609 1465 aa24.39■■□□□ 1.49
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Efcab6Q6P1E8 1516 aa24.38■■□□□ 1.49
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 PrxO55103 1391 aa24.37■■□□□ 1.49
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Ino80Q6ZPV2 1559 aa24.36■■□□□ 1.49
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Prdm2A2A7B5 1709 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Os9Q8K2C7 672 aa24.36■■□□□ 1.49
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Myo3aQ8K3H5 1613 aa24.36■■□□□ 1.49
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Pank3Q8R2W9 370 aa24.35■■□□□ 1.49
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Synj2Q9D2G5 1434 aa24.35■■□□□ 1.49
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Talpid3E9PV87 1520 aa24.34■■□□□ 1.49
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Srpk2O54781 681 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Myom2Q14BI5 1463 aa24.33■■□□□ 1.49
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Sbno1Q689Z5 1390 aa24.32■■□□□ 1.48
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Hecw2Q6I6G8 1578 aa24.31■■□□□ 1.48
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Fan1Q69ZT1 1020 aa24.31■■□□□ 1.48
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Aplp2Q06335 707 aa24.3■■□□□ 1.48
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 1700123L14RikQ3V2K7 440 aa24.3■■□□□ 1.48
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Inpp5dQ9ES52 1191 aa24.29■■□□□ 1.48
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Cdk5rap2Q8K389 1822 aa24.29■■□□□ 1.48
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Adamts7Q68SA9 1657 aa24.29■■□□□ 1.48
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Stard8Q8K031 1019 aa24.29■■□□□ 1.48
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Gtf2e1Q9D0D5 440 aa24.28■■□□□ 1.48
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Tmf1B9EKI3 1091 aa24.28■■□□□ 1.48
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Usp40Q8BWR4 1235 aa24.28■■□□□ 1.48
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Cfap65Q3V0B4 1847 aa24.27■■□□□ 1.48
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Itsn2Q9Z0R6 1659 aa24.27■■□□□ 1.48
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Nphp4P59240 1425 aa24.27■■□□□ 1.48
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Knl1Q66JQ7 1612 aa24.26■■□□□ 1.47
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Zscan10Q3URR7 782 aa24.25■■□□□ 1.47
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 AU022751B1B0V2 589 aa24.25■■□□□ 1.47
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Slc4a1apE9PX68 744 aa24.23■■□□□ 1.47
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Rpgrip1lQ8CG73 1264 aa24.23■■□□□ 1.47
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Anp32bQ9EST5 272 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Puf60Q3UEB3 564 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Mroh1E0CZ22 1640 aa24.22■■□□□ 1.47
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Arid4bA2CG63 1314 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Uggt1Q6P5E4 1551 aa24.21■■□□□ 1.47
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 DnmbpQ6TXD4 1580 aa24.21■■□□□ 1.47
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Gm16486A0A1D5RMD1 1434 aa24.21■■□□□ 1.47
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Plxnc1Q9QZC2 1574 aa24.2■■□□□ 1.46
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Fam184bQ0KK56 942 aa24.19■■□□□ 1.46
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Ttbk1Q6PCN3 1308 aa24.19■■□□□ 1.46
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Skint5A7XUY5 1461 aa24.19■■□□□ 1.46
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Sipa1l1Q8C0T5 1782 aa24.18■■□□□ 1.46
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 SafbD3YXK2 937 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.46
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Q7TT23 1179 aa24.14■■□□□ 1.46
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Hfm1D3Z4R1 1434 aa24.14■■□□□ 1.45
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Zmym4A2A791 1549 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Eif5bQ05D44 1216 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Zscan21Q07231 555 aa24.13■■□□□ 1.45
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Gm38655A0A286YDK6 273 aa24.11■■□□□ 1.45
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Ofd1Q80Z25 1017 aa24.11■■□□□ 1.45
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Ahdc1Q6PAL7 1594 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Myom1Q62234 1667 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Afap1Q80YS6 731 aa24.11■■□□□ 1.45
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Slc52a2Q9D8F3 450 aa24.11■■□□□ 1.45
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Calr4Q3TQS0 420 aa24.1■■□□□ 1.45
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Tex14Q7M6U3 1450 aa24.1■■□□□ 1.45
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Rsph4aQ8BYM7 716 aa24.1■■□□□ 1.45
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Lrrc7Q80TE7 1490 aa24.09■■□□□ 1.45
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 NpatQ8BMA5 1420 aa24.09■■□□□ 1.45
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 PalldQ9ET54 1408 aa24.09■■□□□ 1.45
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Prrc2bQ7TPM1 1486 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.44
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Qser1A2BIE1 1698 aa24.06■■□□□ 1.44
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Stag3O70576 1240 aa24.05■■□□□ 1.44
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Kdm5aQ3UXZ9 1690 aa24.05■■□□□ 1.44
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Ppp2r1aQ76MZ3 589 aa24.05■■□□□ 1.44
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 PtprmP28828 1452 aa24.04■■□□□ 1.44
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Ift172Q6VH22 1749 aa24.03■■□□□ 1.44
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Arhgap23Q69ZH9 1483 aa24.02■■□□□ 1.44
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 CltcQ68FD5 1675 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Rab3gap2Q8BMG7 1366 aa24.01■■□□□ 1.43
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 IqubQ8CDK3 788 aa24.01■■□□□ 1.43
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Mak16Q8BGS0 296 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 P3h3Q8CG70 732 aa24.01■■□□□ 1.43
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 MaddQ80U28 1577 aa23.99■■□□□ 1.43
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Kif7B7ZNG0 1348 aa23.98■■□□□ 1.43
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 InsrP15208 1372 aa23.96■■□□□ 1.43
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Kif13aQ9EQW7 1749 aa23.96■■□□□ 1.43
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Dcaf11Q91VU6 549 aa23.95■■□□□ 1.42
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Cnga1P29974 684 aa23.95■■□□□ 1.42
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Shq1Q7TMX5 569 aa23.95■■□□□ 1.42
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Itsn1Q9Z0R4 1714 aa23.94■■□□□ 1.42
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Gprasp1Q5U4C1 1347 aa23.94■■□□□ 1.42
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Naip7Q9JIB3 1402 aa23.94■■□□□ 1.42
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 CenpjQ569L8 1344 aa23.94■■□□□ 1.42
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Atp1b4Q99ME6 356 aa23.93■■□□□ 1.42
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 RictorQ6QI06 1708 aa23.93■■□□□ 1.42
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Zfp444Q3TDV8 331 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Stk26Q99JT2 416 aa23.92■■□□□ 1.42
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Atf7ipQ7TT18 1306 aa23.91■■□□□ 1.42
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 L3mbtl2P59178 703 aa23.91■■□□□ 1.42
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 CenpbP27790 599 aa23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 16.6 ms