RNA–Protein interactions for RNA: YOR073W

SGO1, Transcript of Component of the spindle checkpoint, yeast

Gene SGO1, Length 1,773 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SGO1	YOR073W	UTP30	P36144	274 aa	Known RBP	0.93	□□□□□ -2.26
SGO1	YOR073W	YHR180W	P38868	163 aa		0.93	□□□□□ -2.26
SGO1	YOR073W	YRB2	P40517	327 aa		0.93	□□□□□ -2.26
SGO1	YOR073W	PRM10	P42946	383 aa		0.93	□□□□□ -2.26
SGO1	YOR073W	DSK2	P48510	373 aa		0.93	□□□□□ -2.26
SGO1	YOR073W	RPL9B	P51401	191 aa	Known RBP	0.93	□□□□□ -2.26
SGO1	YOR073W	YGR050C	P53231	118 aa		0.93	□□□□□ -2.26
SGO1	YOR073W	LSM7	P53905	115 aa	Known RBP	0.93	□□□□□ -2.26
SGO1	YOR073W	GAS3	Q03655	524 aa		0.93	□□□□□ -2.26
SGO1	YOR073W	SPG3	Q04398	127 aa	Predicted RBP	0.93	□□□□□ -2.26
SGO1	YOR073W	ATG38	Q05789	226 aa	Known RBP	0.93	□□□□□ -2.26
SGO1	YOR073W	GGA1	Q06336	557 aa		0.93	□□□□□ -2.26
SGO1	YOR073W	ARR2	Q06597	130 aa		0.93	□□□□□ -2.26
SGO1	YOR073W	CDC8	P00572	216 aa		0.92	□□□□□ -2.26
SGO1	YOR073W	ADH3	P07246	375 aa	Known RBP	0.92	□□□□□ -2.26
SGO1	YOR073W	MRPL28	P36527	147 aa		0.92	□□□□□ -2.26
SGO1	YOR073W	POP4	P38336	279 aa		0.92	□□□□□ -2.26
SGO1	YOR073W	RSM25	P40496	264 aa		0.92	□□□□□ -2.26
SGO1	YOR073W	YGR026W	P53217	278 aa		0.92	□□□□□ -2.26
SGO1	YOR073W	YMD8	Q03697	442 aa		0.92	□□□□□ -2.26
SGO1	YOR073W	YNG1	Q08465	219 aa		0.92	□□□□□ -2.26
SGO1	YOR073W	USB1	Q12208	290 aa	Known RBP	0.92	□□□□□ -2.26
SGO1	YOR073W	TDA8	Q6B2U8	126 aa		0.92	□□□□□ -2.26
SGO1	YOR073W	SAC3	P46674	1301 aa		0.91	□□□□□ -2.26
SGO1	YOR073W	MSW1	P04803	379 aa		0.91	□□□□□ -2.26
SGO1	YOR073W	RPL27A	P0C2H6	136 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
SGO1	YOR073W	RPL27B	P0C2H7	136 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
SGO1	YOR073W	YLR156W	P0CE96	114 aa		0.91	□□□□□ -2.26
SGO1	YOR073W	YLR159W	P0CE97	114 aa		0.91	□□□□□ -2.26
SGO1	YOR073W	YLR161W	P0CE98	114 aa		0.91	□□□□□ -2.26
SGO1	YOR073W	ATG22	P25568	528 aa		0.91	□□□□□ -2.26
SGO1	YOR073W	YOR062C	P36025	268 aa		0.91	□□□□□ -2.26
SGO1	YOR073W	MMS2	P53152	137 aa		0.91	□□□□□ -2.26
SGO1	YOR073W	GIM3	P53900	129 aa		0.91	□□□□□ -2.26
SGO1	YOR073W	TLG1	Q03322	224 aa		0.91	□□□□□ -2.26
SGO1	YOR073W	CGI121	Q03705	181 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
SGO1	YOR073W	YDR249C	Q03787	373 aa		0.91	□□□□□ -2.26
SGO1	YOR073W	YOL160W	Q08321	113 aa		0.91	□□□□□ -2.26
SGO1	YOR073W	GRE1	Q08969	168 aa		0.91	□□□□□ -2.26
SGO1	YOR073W	YPL162C	Q12042	273 aa		0.91	□□□□□ -2.26
SGO1	YOR073W	MCP1	Q12106	302 aa		0.91	□□□□□ -2.26
SGO1	YOR073W	RAS2	P01120	322 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
SGO1	YOR073W	MRS1	P07266	363 aa		0.91	□□□□□ -2.26
SGO1	YOR073W	AST2	P39945	430 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
SGO1	YOR073W	YIL001W	P40560	513 aa		0.91	□□□□□ -2.26
SGO1	YOR073W	YJL027C	P47063	138 aa	Predicted RBP	0.91	□□□□□ -2.26
SGO1	YOR073W	AIM25	P47140	327 aa		0.91	□□□□□ -2.26
SGO1	YOR073W	DAN1	P47178	298 aa		0.91	□□□□□ -2.26
SGO1	YOR073W	AIF1	P52923	378 aa		0.91	□□□□□ -2.26
SGO1	YOR073W	COG5	P53951	403 aa		0.91	□□□□□ -2.26
SGO1	YOR073W	YML108W	Q03759	105 aa		0.91	□□□□□ -2.26
SGO1	YOR073W	NEJ1	Q06148	342 aa		0.91	□□□□□ -2.26
SGO1	YOR073W	EMC6	Q12431	108 aa		0.91	□□□□□ -2.26
SGO1	YOR073W	MHT1	Q12525	324 aa		0.91	□□□□□ -2.26
SGO1	YOR073W	YFR032C-B	Q8TGU2	87 aa		0.91	□□□□□ -2.26
SGO1	YOR073W	IKI3	Q06706	1349 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.27
SGO1	YOR073W	PUT1	P09368	476 aa		0.9	□□□□□ -2.27
SGO1	YOR073W	KSS1	P14681	368 aa		0.9	□□□□□ -2.27
SGO1	YOR073W	MAG1	P22134	296 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.27
SGO1	YOR073W	PEX4	P29340	183 aa		0.9	□□□□□ -2.27
SGO1	YOR073W	MEI4	P29467	408 aa		0.9	□□□□□ -2.27
SGO1	YOR073W	VMA11	P32842	164 aa		0.9	□□□□□ -2.27
SGO1	YOR073W	TRM5	P38793	499 aa		0.9	□□□□□ -2.27
SGO1	YOR073W	RMD6	P39975	231 aa		0.9	□□□□□ -2.27
SGO1	YOR073W	FCY21	P40039	528 aa		0.9	□□□□□ -2.27
SGO1	YOR073W	SWP1	Q02795	286 aa		0.9	□□□□□ -2.27
SGO1	YOR073W	MRPS8	Q03799	155 aa		0.9	□□□□□ -2.27
SGO1	YOR073W	ARO80	Q04052	950 aa		0.9	□□□□□ -2.27
SGO1	YOR073W	RPL25	P04456	142 aa	Known RBP	0.89	□□□□□ -2.27
SGO1	YOR073W	SCL1	P21243	252 aa	Known RBP	0.89	□□□□□ -2.27
SGO1	YOR073W	MDH3	P32419	343 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.89	□□□□□ -2.27	not detected
SGO1	YOR073W	MRPL17	P36528	281 aa		0.89	□□□□□ -2.27
SGO1	YOR073W	FMP23	P38231	175 aa		0.89	□□□□□ -2.27
SGO1	YOR073W	HMF1	P40037	129 aa	Known RBP	0.89	□□□□□ -2.27
SGO1	YOR073W	ICE2	P40499	491 aa		0.89	□□□□□ -2.27
SGO1	YOR073W	ERG10	P41338	398 aa	Known RBP	0.89	□□□□□ -2.27
SGO1	YOR073W	UBC12	P52491	188 aa		0.89	□□□□□ -2.27
SGO1	YOR073W	YNL184C	P53876	108 aa		0.89	□□□□□ -2.27
SGO1	YOR073W	GPM2	Q12008	311 aa		0.89	□□□□□ -2.27
SGO1	YOR073W	MDM32	Q12171	622 aa		0.89	□□□□□ -2.27
SGO1	YOR073W	ATO3	Q12359	275 aa		0.89	□□□□□ -2.27
SGO1	YOR073W	PDR18	P53756	1333 aa		0.88	□□□□□ -2.27
SGO1	YOR073W	TIM9	O74700	87 aa		0.88	□□□□□ -2.27
SGO1	YOR073W	SIR2	P06700	562 aa		0.88	□□□□□ -2.27
SGO1	YOR073W	RPB3	P16370	318 aa	Known RBP	0.88	□□□□□ -2.27
SGO1	YOR073W	PET9	P18239	318 aa	Known RBP	0.88	□□□□□ -2.27
SGO1	YOR073W	ATP15	P21306	62 aa		0.88	□□□□□ -2.27
SGO1	YOR073W	CNB1	P25296	175 aa		0.88	□□□□□ -2.27
SGO1	YOR073W	PGD1	P40356	397 aa		0.88	□□□□□ -2.27
SGO1	YOR073W	RPL33B	P41056	107 aa	Known RBP	0.88	□□□□□ -2.27
SGO1	YOR073W	CIS3	P47001	227 aa		0.88	□□□□□ -2.27
SGO1	YOR073W	DOC1	P53068	250 aa		0.88	□□□□□ -2.27
SGO1	YOR073W	BOL2	P53082	120 aa		0.88	□□□□□ -2.27
SGO1	YOR073W	HOP2	P53187	214 aa		0.88	□□□□□ -2.27
SGO1	YOR073W	YGR219W	P53307	113 aa		0.88	□□□□□ -2.27
SGO1	YOR073W	YNR062C	P53748	327 aa		0.88	□□□□□ -2.27
SGO1	YOR073W	YNR077C	P53758	84 aa		0.88	□□□□□ -2.27
SGO1	YOR073W	DAD3	P69850	94 aa		0.88	□□□□□ -2.27
SGO1	YOR073W	MEU1	Q07938	337 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.88	□□□□□ -2.27	not detected
SGO1	YOR073W	TSC3	Q3E790	80 aa		0.88	□□□□□ -2.27

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