RNA–Protein interactions for RNA: YOL013C

HRD1, Transcript of Ubiquitin-protein ligase, yeastyeast

Gene HRD1, Length 1,656 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HRD1YOL013C YLR036CQ07986 203 aa2.65□□□□□ -1.99
HRD1YOL013C ERV2Q12284 196 aa2.65□□□□□ -1.99
HRD1YOL013C NOT5Q12514 560 aaPredicted RBP2.65□□□□□ -1.99
HRD1YOL013C RRP5Q05022 1729 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
HRD1YOL013C RFS1P38234 210 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
HRD1YOL013C PDS1P40316 373 aaPredicted RBP2.64□□□□□ -1.99
HRD1YOL013C RSM25P40496 264 aa2.64□□□□□ -1.99
HRD1YOL013C FLC3P53121 802 aa2.64□□□□□ -1.99
HRD1YOL013C GOT1Q03554 138 aa2.64□□□□□ -1.99
HRD1YOL013C INP1Q03694 420 aa2.64□□□□□ -1.99
HRD1YOL013C ECM11Q04110 302 aa2.64□□□□□ -1.99
HRD1YOL013C YDR115WQ04598 105 aa2.64□□□□□ -1.99
HRD1YOL013C SYC1Q08553 188 aaPredicted RBP2.64□□□□□ -1.99
HRD1YOL013C FDH1Q08911 376 aa2.64□□□□□ -1.99
HRD1YOL013C RDI1Q12434 202 aa2.64□□□□□ -1.99
HRD1YOL013C YBL008W-AQ3E821 79 aa2.64□□□□□ -1.99
HRD1YOL013C YAP3P38749 330 aa2.63□□□□□ -1.99
HRD1YOL013C DOG1P38774 246 aa2.63□□□□□ -1.99
HRD1YOL013C SPL2P38839 148 aa2.63□□□□□ -1.99
HRD1YOL013C CYC2P38909 366 aa2.63□□□□□ -1.99
HRD1YOL013C CAT5P41735 233 aa2.63□□□□□ -1.99
HRD1YOL013C FMP32P43557 207 aa2.63□□□□□ -1.99
HRD1YOL013C FAR7P43592 221 aa2.63□□□□□ -1.99
HRD1YOL013C HST4P53688 370 aa2.63□□□□□ -1.99
HRD1YOL013C RNH201P53942 307 aa2.63□□□□□ -1.99
HRD1YOL013C HSK3P69852 69 aa2.63□□□□□ -1.99
HRD1YOL013C JID1Q12350 301 aa2.63□□□□□ -1.99
HRD1YOL013C BCK1Q01389 1478 aa2.63□□□□□ -1.99
HRD1YOL013C SNF2P22082 1703 aa2.63□□□□□ -1.99
HRD1YOL013C MGT1P26188 188 aa2.63□□□□□ -1.99
HRD1YOL013C PTM1P32857 523 aa2.63□□□□□ -1.99
HRD1YOL013C PRY2P36110 329 aa2.63□□□□□ -1.99
HRD1YOL013C YBL081WP38180 368 aaKnown RBP2.63□□□□□ -1.99
HRD1YOL013C SLM6P38343 150 aa2.63□□□□□ -1.99
HRD1YOL013C NVJ1P38881 321 aa2.63□□□□□ -1.99
HRD1YOL013C EDC2P40023 145 aaPredicted RBP2.63□□□□□ -1.99
HRD1YOL013C RRG9P40156 214 aa2.63□□□□□ -1.99
HRD1YOL013C YGR042WP53227 271 aa2.63□□□□□ -1.99
HRD1YOL013C MPA43P53583 542 aaPredicted RBP2.63□□□□□ -1.99
HRD1YOL013C LSM7P53905 115 aaKnown RBP2.63□□□□□ -1.99
HRD1YOL013C RPL21AQ02753 160 aaKnown RBP2.63□□□□□ -1.99
HRD1YOL013C ELP3Q02908 557 aaKnown RBP2.63□□□□□ -1.99
HRD1YOL013C YPL039WQ03080 316 aa2.63□□□□□ -1.99
HRD1YOL013C EMI1Q04406 187 aa2.63□□□□□ -1.99
HRD1YOL013C DYN3Q04949 312 aa2.63□□□□□ -1.99
HRD1YOL013C PBA1Q05778 276 aa2.63□□□□□ -1.99
HRD1YOL013C YLR053CQ12026 108 aa2.63□□□□□ -1.99
HRD1YOL013C PEX11Q12462 236 aa2.63□□□□□ -1.99
HRD1YOL013C SEC22P22214 214 aa2.62□□□□□ -1.99
HRD1YOL013C SDH3P33421 198 aa2.62□□□□□ -1.99
HRD1YOL013C TIP20P33891 701 aa2.62□□□□□ -1.99
HRD1YOL013C SMP1P38128 452 aa2.62□□□□□ -1.99
HRD1YOL013C PHO89P38361 574 aa2.62□□□□□ -1.99
HRD1YOL013C PTH1P38876 190 aaKnown RBP2.62□□□□□ -1.99
HRD1YOL013C YGL204CP53089 101 aa2.62□□□□□ -1.99
HRD1YOL013C PRM8P53174 237 aa2.62□□□□□ -1.99
HRD1YOL013C COG5P53951 403 aa2.62□□□□□ -1.99
HRD1YOL013C YDR124WQ04608 324 aa2.62□□□□□ -1.99
HRD1YOL013C TIM22Q12328 207 aa2.62□□□□□ -1.99
HRD1YOL013C URB1P34241 1764 aaKnown RBP2.61□□□□□ -1.99
HRD1YOL013C SCO1P23833 295 aa2.61□□□□□ -1.99
HRD1YOL013C TCA17P32613 152 aa2.61□□□□□ -1.99
HRD1YOL013C ZRT3P34240 503 aa2.61□□□□□ -1.99
HRD1YOL013C CSG2P35206 410 aa2.61□□□□□ -1.99
HRD1YOL013C BDH1P39714 382 aa2.61□□□□□ -1.99
HRD1YOL013C MIG3P39943 394 aa2.61□□□□□ -1.99
HRD1YOL013C SWT21P53873 357 aaPredicted RBP2.61□□□□□ -1.99
HRD1YOL013C ACT1P60010 375 aaKnown RBP2.61□□□□□ -1.99
HRD1YOL013C API2Q04413 109 aa2.61□□□□□ -1.99
HRD1YOL013C RIO1Q12196 484 aaKnown RBP2.61□□□□□ -1.99
HRD1YOL013C TRM10Q12400 293 aa2.61□□□□□ -1.99
HRD1YOL013C HAP1P0CE41 1502 aa2.61□□□□□ -1.99
HRD1YOL013C APC1P53886 1748 aa2.6□□□□□ -1.99
HRD1YOL013C SIR2P06700 562 aa2.6□□□□□ -1.99
HRD1YOL013C ERG24P32462 438 aaKnown RBP2.6□□□□□ -1.99
HRD1YOL013C UPS2P35200 230 aa2.6□□□□□ -1.99
HRD1YOL013C LSM4P40070 187 aaKnown RBP2.6□□□□□ -1.99
HRD1YOL013C MOG1P47123 218 aa2.6□□□□□ -1.99
HRD1YOL013C BOR1P53838 576 aa2.6□□□□□ -1.99
HRD1YOL013C AIM34Q03673 198 aa2.6□□□□□ -1.99
HRD1YOL013C HNT1Q04344 158 aaKnown RBP2.6□□□□□ -1.99
HRD1YOL013C YLR030WQ07967 263 aa2.6□□□□□ -1.99
HRD1YOL013C MDM32Q12171 622 aa2.6□□□□□ -1.99
HRD1YOL013C ATG5Q12380 294 aa2.6□□□□□ -1.99
HRD1YOL013C YBL112CQ3E7Y4 105 aa2.6□□□□□ -1.99
HRD1YOL013C FKS3Q04952 1785 aa2.6□□□□□ -1.99
HRD1YOL013C AAT2P23542 418 aaKnown RBP2.6□□□□□ -1.99
HRD1YOL013C ERG2P32352 222 aa2.6□□□□□ -1.99
HRD1YOL013C YHL044WP38727 235 aa2.6□□□□□ -1.99
HRD1YOL013C GGC1P38988 300 aa2.6□□□□□ -1.99
HRD1YOL013C AVT6P40074 448 aa2.6□□□□□ -1.99
HRD1YOL013C YJL028WP47062 111 aa2.6□□□□□ -1.99
HRD1YOL013C COQ5P49017 307 aa2.6□□□□□ -1.99
HRD1YOL013C YGR050CP53231 118 aa2.6□□□□□ -1.99
HRD1YOL013C COS6P53344 381 aa2.6□□□□□ -1.99
HRD1YOL013C VHS1Q03785 461 aa2.6□□□□□ -1.99
HRD1YOL013C YOL029CQ08187 201 aa2.6□□□□□ -1.99
HRD1YOL013C YPR202WQ08993 238 aa2.6□□□□□ -1.99
HRD1YOL013C YPS3Q12303 508 aa2.6□□□□□ -1.99
HRD1YOL013C YRF1-2P40105 1681 aa2.59□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 24.2 ms