RNA–Protein interactions for RNA: YLR008C

PAM18, Transcript of Subunit of the import motor (PAM complex), yeast

Gene PAM18, Length 507 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PAM18	YLR008C	UBC12	P52491	188 aa		3.4	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	RHO4	Q00246	291 aa		3.4	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	PET191	Q02772	108 aa		3.4	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	MRX11	Q03079	207 aa		3.4	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	SCS7	Q03529	384 aa		3.4	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	YDR391C	Q04170	232 aa		3.4	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	UTP15	Q04305	513 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	YMR253C	Q04835	414 aa		3.4	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	FMP42	Q04991	504 aa		3.4	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	PEX30	Q06169	523 aa		3.4	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	RFM1	Q12192	310 aa		3.4	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	YOR214C	Q12282	236 aa		3.4	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	GEP5	Q12393	293 aa		3.4	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	CCH1	P50077	2039 aa		3.39	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	CDC7	P06243	507 aa		3.39	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	CAP2	P13517	287 aa		3.39	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	PEX34	P25584	144 aa		3.39	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	CDC50	P25656	391 aa		3.39	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	YMC1	P32331	307 aa		3.39	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	YGP1	P38616	354 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	DOG2	P38773	246 aa		3.39	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	DOG1	P38774	246 aa		3.39	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	AIM18	P38884	321 aa		3.39	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	PEX22	P39718	180 aa		3.39	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	ERV46	P39727	415 aa		3.39	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	XBP1	P40489	647 aa		3.39	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	DFG10	P40526	253 aa		3.39	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	MEP2	P41948	499 aa		3.39	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	YFL015C	P43578	164 aa		3.39	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	AIM25	P47140	327 aa		3.39	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	SOL1	P50278	321 aa		3.39	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	ORC5	P50874	479 aa		3.39	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	FLC3	P53121	802 aa		3.39	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	YGL039W	P53183	348 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	YGR017W	P53210	297 aa		3.39	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	HST4	P53688	370 aa		3.39	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	YNR048W	P53740	393 aa		3.39	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	YNL184C	P53876	108 aa		3.39	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	SLM2	P53955	656 aa		3.39	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	PLP1	Q04004	230 aa		3.39	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	SEI1	Q06058	285 aa		3.39	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	DIC1	Q06143	298 aa		3.39	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	HRD1	Q08109	551 aa		3.39	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	MDM32	Q12171	622 aa		3.39	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	MCT1	Q12283	360 aa		3.39	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	MHT1	Q12525	324 aa		3.39	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	TAD3	Q9URQ3	322 aa		3.39	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	RPL2A	P0CX45	254 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	RPL2B	P0CX46	254 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	HYM1	P32464	399 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	AEP1	P32493	518 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	RFS1	P38234	210 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	YBR220C	P38318	560 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	PHO89	P38361	574 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	CHL4	P38907	458 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	VMA7	P39111	118 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	PAC10	P48363	199 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	MZM1	Q03429	123 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	GPI17	Q04080	534 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	HPT1	Q04178	221 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	SPG4	Q04438	115 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	THI20	Q08224	551 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	FDH1	Q08911	376 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	YPL257W	Q08974	193 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	HTZ1	Q12692	134 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	CSR2	Q12734	1121 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	SAS5	Q99314	248 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	YKR104W	P0CE69	306 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	ERD2	P18414	219 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	AHC2	P25649	128 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	MRP49	P32388	137 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	ERG24	P32462	438 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	ALK2	P32789	676 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	PDC2	P32896	925 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	RPS20	P38701	121 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	BAT1	P38891	393 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	STB1	P42845	420 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	AVT4	P50944	713 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	ATP23	P53722	227 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	IRC15	Q02733	499 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	YPL113C	Q02961	396 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	NHP10	Q03435	203 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	YET2	Q04210	160 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	TRM12	Q04235	462 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	FAR10	Q06001	478 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	YLR446W	Q06204	433 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	LOA1	Q06508	300 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	YDL218W	Q07629	317 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	TFC7	Q12415	435 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	YDL085C-A	Q3E7B7	68 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	YPL229W	Q99395	206 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	PBI2	P0CT04	75 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	MAK32	P23060	363 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	YCR007C	P25354	239 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	ATG22	P25568	528 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	PEX2	P32800	271 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	PMU1	P36069	295 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	LEU5	P38702	357 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	YEA4	P40004	342 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	YNL010W	P53981	241 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87

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