RNA–Protein interactions for RNA: YKR080W

MTD1, Transcript of NAD-dependent 5,10-methylenetetrahydrafolate dehydrogenase, yeast

Gene MTD1, Length 963 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MTD1	YKR080W	SME1	Q12330	94 aa	Predicted RBP	2.8	□□□□□ -1.96
MTD1	YKR080W	MHT1	Q12525	324 aa		2.8	□□□□□ -1.96
MTD1	YKR080W	FLO9	P39712	1322 aa		2.79	□□□□□ -1.96
MTD1	YKR080W	SPT3	P06844	337 aa		2.79	□□□□□ -1.96
MTD1	YKR080W	GCY1	P14065	312 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.79	□□□□□ -1.96	not detected
MTD1	YKR080W	ETR1	P38071	380 aa		2.79	□□□□□ -1.96
MTD1	YKR080W	ARN2	P38724	620 aa		2.79	□□□□□ -1.96
MTD1	YKR080W	SUR2	P38992	349 aa		2.79	□□□□□ -1.96
MTD1	YKR080W	YRB1	P41920	201 aa	Known RBP	2.79	□□□□□ -1.96
MTD1	YKR080W	YGL088W	P53151	121 aa		2.79	□□□□□ -1.96
MTD1	YKR080W	YPL039W	Q03080	316 aa		2.79	□□□□□ -1.96
MTD1	YKR080W	YET3	Q07451	203 aa		2.79	□□□□□ -1.96
MTD1	YKR080W	TDH2	P00358	332 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
MTD1	YKR080W	GPA2	P10823	449 aa		2.78	□□□□□ -1.96
MTD1	YKR080W	ZWF1	P11412	505 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
MTD1	YKR080W	RAD17	P48581	401 aa		2.78	□□□□□ -1.96
MTD1	YKR080W	RPL22B	P56628	122 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
MTD1	YKR080W	LAP3	Q01532	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.78	□□□□□ -1.96	not detected
MTD1	YKR080W	ATC1	Q04005	294 aa		2.78	□□□□□ -1.96
MTD1	YKR080W	YEL009C-A	A0A023PZF2	135 aa		2.77	□□□□□ -1.97
MTD1	YKR080W	YSF3	P0C074	85 aa	Predicted RBP	2.77	□□□□□ -1.97
MTD1	YKR080W	MRP1	P10662	321 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
MTD1	YKR080W	MIG1	P27705	504 aa		2.77	□□□□□ -1.97
MTD1	YKR080W	SDH4	P37298	181 aa		2.77	□□□□□ -1.97
MTD1	YKR080W	HEK2	P38199	381 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.77	□□□□□ -1.97	not detected
MTD1	YKR080W	YAR1	P46683	200 aa		2.77	□□□□□ -1.97
MTD1	YKR080W	YJR012C	P47087	207 aa		2.77	□□□□□ -1.97
MTD1	YKR080W	MAL13	P53338	473 aa		2.77	□□□□□ -1.97
MTD1	YKR080W	ADH6	Q04894	360 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
MTD1	YKR080W	HRT1	Q08273	121 aa		2.77	□□□□□ -1.97
MTD1	YKR080W	FEX1	Q08913	375 aa		2.77	□□□□□ -1.97
MTD1	YKR080W	FEX2	Q08991	375 aa		2.77	□□□□□ -1.97
MTD1	YKR080W	TIM22	Q12328	207 aa		2.77	□□□□□ -1.97
MTD1	YKR080W	ISD11	Q6Q560	94 aa		2.77	□□□□□ -1.97
MTD1	YKR080W	CDC39	P25655	2108 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
MTD1	YKR080W	KRE1	P17260	313 aa		2.76	□□□□□ -1.97
MTD1	YKR080W	YCR090C	P25654	182 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
MTD1	YKR080W	HSP150	P32478	413 aa		2.76	□□□□□ -1.97
MTD1	YKR080W	YUH1	P35127	236 aa		2.76	□□□□□ -1.97
MTD1	YKR080W	GRE3	P38715	327 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.76	□□□□□ -1.97	not detected
MTD1	YKR080W	YER084W	P40057	128 aa		2.76	□□□□□ -1.97
MTD1	YKR080W	YJR141W	P47172	347 aa	Predicted RBP	2.76	□□□□□ -1.97
MTD1	YKR080W	OST3	P48439	350 aa		2.76	□□□□□ -1.97
MTD1	YKR080W	SLX9	P53251	210 aa	Predicted RBP	2.76	□□□□□ -1.97
MTD1	YKR080W	YMR166C	Q03829	368 aa		2.76	□□□□□ -1.97
MTD1	YKR080W	BTS1	Q12051	335 aa		2.76	□□□□□ -1.97
MTD1	YKR080W	RUD3	Q12234	484 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
MTD1	YKR080W	YCL012C	Q8J0M4	134 aa		2.76	□□□□□ -1.97
MTD1	YKR080W	RSR1	P13856	272 aa		2.75	□□□□□ -1.97
MTD1	YKR080W	FES1	P38260	290 aa		2.75	□□□□□ -1.97
MTD1	YKR080W	PRS2	P38620	318 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
MTD1	YKR080W	PEP8	P40335	379 aa		2.75	□□□□□ -1.97
MTD1	YKR080W	ALB1	P47019	175 aa	Predicted RBP	2.75	□□□□□ -1.97
MTD1	YKR080W	LSM3	P57743	89 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
MTD1	YKR080W	PEX10	Q05568	337 aa		2.75	□□□□□ -1.97
MTD1	YKR080W	CTS2	Q06350	511 aa		2.75	□□□□□ -1.97
MTD1	YKR080W	YOL019W	Q08157	551 aa		2.75	□□□□□ -1.97
MTD1	YKR080W	RRT8	Q08219	342 aa		2.75	□□□□□ -1.97
MTD1	YKR080W	YBL112C	Q3E7Y4	105 aa		2.75	□□□□□ -1.97
MTD1	YKR080W	Q0297	Q9ZZV8	51 aa		2.75	□□□□□ -1.97
MTD1	YKR080W	HIS3	P06633	220 aa		2.74	□□□□□ -1.97
MTD1	YKR080W	COS2	P0CX12	379 aa		2.74	□□□□□ -1.97
MTD1	YKR080W	COS3	P0CX13	379 aa		2.74	□□□□□ -1.97
MTD1	YKR080W	RPB4	P20433	221 aa	Predicted RBP	2.74	□□□□□ -1.97
MTD1	YKR080W	YGP1	P38616	354 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
MTD1	YKR080W	YER034W	P40022	185 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
MTD1	YKR080W	YFL051C	P43552	160 aa		2.74	□□□□□ -1.97
MTD1	YKR080W	EFM5	P53200	248 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
MTD1	YKR080W	DIA1	P54005	336 aa		2.74	□□□□□ -1.97
MTD1	YKR080W	MET31	Q03081	177 aa		2.74	□□□□□ -1.97
MTD1	YKR080W	HPT1	Q04178	221 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
MTD1	YKR080W	MIX14	Q04341	121 aa		2.74	□□□□□ -1.97
MTD1	YKR080W	YKL018C-A	Q3E7A7	99 aa		2.74	□□□□□ -1.97
MTD1	YKR080W	Q0144	Q9ZZW2	109 aa		2.74	□□□□□ -1.97
MTD1	YKR080W	RPS1A	P33442	255 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
MTD1	YKR080W	YKR032W	P36127	104 aa		2.73	□□□□□ -1.97
MTD1	YKR080W	YHB1	P39676	399 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
MTD1	YKR080W	SMX2	P40204	77 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
MTD1	YKR080W	YFR054C	P43622	192 aa		2.73	□□□□□ -1.97
MTD1	YKR080W	NIF3	P53081	288 aa		2.73	□□□□□ -1.97
MTD1	YKR080W	NHP10	Q03435	203 aa		2.73	□□□□□ -1.97
MTD1	YKR080W	CGI121	Q03705	181 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
MTD1	YKR080W	RIO1	Q12196	484 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
MTD1	YKR080W	YFR010W-A	P0C5N0	62 aa		2.72	□□□□□ -1.97
MTD1	YKR080W	RPT5	P33297	434 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
MTD1	YKR080W	AIM2	P39721	246 aa		2.72	□□□□□ -1.97
MTD1	YKR080W	AST2	P39945	430 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
MTD1	YKR080W	SYF2	P53277	215 aa	Predicted RBP	2.72	□□□□□ -1.97
MTD1	YKR080W	AAH1	P53909	347 aa		2.72	□□□□□ -1.97
MTD1	YKR080W	YNL140C	P53910	189 aa		2.72	□□□□□ -1.97
MTD1	YKR080W	FCF1	Q05498	189 aa	Predicted RBP	2.72	□□□□□ -1.97
MTD1	YKR080W	YLR053C	Q12026	108 aa		2.72	□□□□□ -1.97
MTD1	YKR080W	YPL119C-A	Q3E751	87 aa		2.72	□□□□□ -1.97
MTD1	YKR080W	YOR032W-A	Q8TGS1	66 aa		2.72	□□□□□ -1.97
MTD1	YKR080W	BUB2	P26448	306 aa	Predicted RBP	2.71	□□□□□ -1.98
MTD1	YKR080W	QRI5	P32344	111 aa		2.71	□□□□□ -1.98
MTD1	YKR080W	SEC17	P32602	292 aa		2.71	□□□□□ -1.98
MTD1	YKR080W	UBC6	P33296	250 aa	Predicted RBP	2.71	□□□□□ -1.98
MTD1	YKR080W	PRS4	P38063	326 aa	Predicted RBP	2.71	□□□□□ -1.98
MTD1	YKR080W	BIG1	P38813	335 aa		2.71	□□□□□ -1.98

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 17.1 ms