RNA–Protein interactions for RNA: YDL117W

CYK3, Transcript of SH3-domain protein located in the bud neck and cytokinetic actin ring, yeast

Gene CYK3, Length 2,658 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CYK3	YDL117W	YNR048W	P53740	393 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CYK3	YDL117W	YKR011C	Q02209	353 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CYK3	YDL117W	VBA1	Q04301	562 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CYK3	YDL117W	FIT1	Q04433	528 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CYK3	YDL117W	COQ11	Q05892	277 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CYK3	YDL117W	SWC7	Q06707	132 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CYK3	YDL117W	SIA1	Q12212	622 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CYK3	YDL117W	NDJ1	Q12366	352 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CYK3	YDL117W	IXR1	P33417	597 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CYK3	YDL117W	SOR1	P35497	357 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CYK3	YDL117W	SPC25	P40014	221 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CYK3	YDL117W	PRM5	P40476	318 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CYK3	YDL117W	YHC3	P47040	408 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CYK3	YDL117W	YNR040W	P53736	256 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CYK3	YDL117W	HRI1	Q05905	244 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CYK3	YDL117W	SOR2	Q07786	357 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CYK3	YDL117W	YLR050C	Q12155	161 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CYK3	YDL117W	HIS1	P00498	297 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CYK3	YDL117W	RAS1	P01119	309 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CYK3	YDL117W	CPA1	P07258	411 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CYK3	YDL117W	RPS16A	P0CX51	143 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CYK3	YDL117W	RPS16B	P0CX52	143 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CYK3	YDL117W	HYP2	P23301	157 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CYK3	YDL117W	OAC1	P32332	324 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CYK3	YDL117W	PRS4	P38063	326 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CYK3	YDL117W	VBA2	P38358	474 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CYK3	YDL117W	RPS20	P38701	121 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CYK3	YDL117W	YHL026C	P38740	315 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CYK3	YDL117W	ASP1	P38986	381 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CYK3	YDL117W	YGR149W	P48236	432 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CYK3	YDL117W	GPB1	Q08886	897 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CYK3	YDL117W	NUS1	Q12063	375 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CYK3	YDL117W	SWM1	Q12379	170 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CYK3	YDL117W	YEL009C-A	A0A023PZF2	135 aa		4.59	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	YLR415C	O13578	112 aa		4.59	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	YKR104W	P0CE69	306 aa		4.59	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	TY2A-F	P0CX61	438 aa		4.59	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	TY2A-GR2	P0CX62	438 aa		4.59	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	VAC17	P25591	423 aa		4.59	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	YKL151C	P36059	337 aa		4.59	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	YFL065C	P43539	102 aa		4.59	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	YJR124C	P47159	448 aa		4.59	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	MPC1	P53157	130 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	YGR283C	P53336	341 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	NUP100	Q02629	959 aa		4.59	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	YPR114W	Q06107	315 aa		4.59	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	YPR203W	Q08994	102 aa		4.59	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	YKL107W	P34251	309 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	AVT1	P47082	602 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	CDH1	P53197	566 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	ERG26	P53199	349 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	TDA6	Q06466	467 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	TIM9	O74700	87 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	URA10	P30402	227 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	HOM6	P31116	359 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	SDH3	P33421	198 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	SFK1	P35735	353 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	TOS1	P38288	455 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	SAF1	P38352	637 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	AIR1	P40507	360 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	IBD2	P53892	351 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	PRM6	Q04705	352 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	YPR174C	Q06616	221 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	PRM3	Q08931	133 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	RPL7B	Q12213	244 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	ADH1	P00330	348 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	COX1	P00401	534 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	RPS31	P05759	152 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	HIP1	P06775	603 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	PAU19	P0CE85	124 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	PAU21	P0CE86	164 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	PAU22	P0CE87	164 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	UBI4	P0CG63	381 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	VMA3	P25515	160 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	PAU3	P25610	124 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	YKL187C	P34231	750 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	NNK1	P36003	928 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	SLM6	P38343	150 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	YIF1	P53845	314 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	YFH1	Q07540	174 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	YOR059C	Q08448	450 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	YLR118C	Q12354	227 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	RAX2	Q12465	1220 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	PUP3	P25451	205 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	VID24	P38263	362 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	EMC5	P40540	141 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	MRPL49	P40858	161 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	DUG3	P53871	357 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	NUP53	Q03790	475 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	YMR320W	Q04897	101 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	ERF2	Q06551	359 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	RXT3	Q07458	294 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	HNT3	Q08702	217 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	CDC26	P14724	124 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	POP5	P28005	173 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	GAR1	P28007	205 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	TRR2	P38816	342 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	SAS2	P40963	338 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	UBC9	P50623	157 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CYK3	YDL117W	VHT1	P53241	593 aa		4.56	□□□□□ -1.68

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