RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421832.2

CTU1-201, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTU1, Length 2,087 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU1-201ENST00000421832 EPC2Q52LR7 807 aa26.22■■□□□ 1.79
CTU1-201ENST00000421832 FBXO47Q5MNV8 452 aa26.22■■□□□ 1.79
CTU1-201ENST00000421832 UBXN11Q5T124 520 aa26.22■■□□□ 1.79
CTU1-201ENST00000421832 GJB7Q6PEY0 223 aa26.22■■□□□ 1.79
CTU1-201ENST00000421832 TRAF7Q6Q0C0 670 aa26.22■■□□□ 1.79
CTU1-201ENST00000421832 SEMA4DQ92854 862 aa26.22■■□□□ 1.79
CTU1-201ENST00000421832 ELMO3Q96BJ8 720 aa26.22■■□□□ 1.79
CTU1-201ENST00000421832 CGRRF1Q99675 332 aa26.22■■□□□ 1.79
CTU1-201ENST00000421832 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP26.22■■□□□ 1.79
CTU1-201ENST00000421832 NLRC4Q9NPP4 1024 aa26.22■■□□□ 1.79
CTU1-201ENST00000421832 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP26.22■■□□□ 1.795e-8■■■■■ 262.6
CTU1-201ENST00000421832 CCT5P48643 541 aa26.21■■□□□ 1.79
CTU1-201ENST00000421832 ENPEPQ07075 957 aa26.21■■□□□ 1.79
CTU1-201ENST00000421832 FAM26DQ5JW98 314 aa26.21■■□□□ 1.79
CTU1-201ENST00000421832 KRT39Q6A163 491 aa26.21■■□□□ 1.79
CTU1-201ENST00000421832 USP37Q86T82 979 aa26.21■■□□□ 1.79
CTU1-201ENST00000421832 TAS1R2Q8TE23 839 aa26.21■■□□□ 1.79
CTU1-201ENST00000421832 CXCL16Q9H2A7 254 aa26.21■■□□□ 1.79
CTU1-201ENST00000421832 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
CTU1-201ENST00000421832 CLTAP09496 248 aa26.21■■□□□ 1.79
CTU1-201ENST00000421832 AXLP30530 894 aa26.21■■□□□ 1.79
CTU1-201ENST00000421832 LIG3P49916 1009 aa26.21■■□□□ 1.79
CTU1-201ENST00000421832 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
CTU1-201ENST00000421832 LPIN1Q14693 890 aa26.21■■□□□ 1.79
CTU1-201ENST00000421832 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa26.21■■□□□ 1.79
CTU1-201ENST00000421832 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa26.21■■□□□ 1.79
CTU1-201ENST00000421832 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa26.21■■□□□ 1.79
CTU1-201ENST00000421832 GPIHBP1Q8IV16 184 aa26.21■■□□□ 1.79
CTU1-201ENST00000421832 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
CTU1-201ENST00000421832 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
CTU1-201ENST00000421832 PLCB1Q9NQ66 1216 aa26.21■■□□□ 1.79
CTU1-201ENST00000421832 ABHD10Q9NUJ1 306 aa26.21■■□□□ 1.79
CTU1-201ENST00000421832 GOLGA6CA6NDK9 693 aa26.2■■□□□ 1.78
CTU1-201ENST00000421832 GOLGA6DP0CG33 693 aa26.2■■□□□ 1.78
CTU1-201ENST00000421832 CD52P31358 61 aa26.2■■□□□ 1.78
CTU1-201ENST00000421832 MBTPS1Q14703 1052 aa26.2■■□□□ 1.78
CTU1-201ENST00000421832 SLC10A6Q3KNW5 377 aa26.2■■□□□ 1.78
CTU1-201ENST00000421832 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.78
CTU1-201ENST00000421832 ZNF662Q6ZS27 426 aa26.2■■□□□ 1.78
CTU1-201ENST00000421832 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa26.2■■□□□ 1.78
CTU1-201ENST00000421832 TMEM130Q8N3G9 435 aa26.2■■□□□ 1.78
CTU1-201ENST00000421832 EHBP1Q8NDI1 1231 aa26.2■■□□□ 1.78
CTU1-201ENST00000421832 BAP1Q92560 729 aa26.2■■□□□ 1.78
CTU1-201ENST00000421832 SNTG2Q9NY99 539 aa26.2■■□□□ 1.78
CTU1-201ENST00000421832 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa26.2■■□□□ 1.78
CTU1-201ENST00000421832 A0A1W2PQJ5 194 aa26.19■■□□□ 1.78
CTU1-201ENST00000421832 LACTBL1A8MY62 500 aa26.19■■□□□ 1.78
CTU1-201ENST00000421832 GOLGA8KD6RF30 607 aa26.19■■□□□ 1.78
CTU1-201ENST00000421832 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP26.19■■□□□ 1.78
CTU1-201ENST00000421832 P4HA2O15460 535 aa26.19■■□□□ 1.78
CTU1-201ENST00000421832 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
CTU1-201ENST00000421832 CD4P01730 458 aa26.19■■□□□ 1.78
CTU1-201ENST00000421832 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
CTU1-201ENST00000421832 GTF2H1P32780 548 aa26.19■■□□□ 1.78
CTU1-201ENST00000421832 GGCXP38435 758 aa26.19■■□□□ 1.78
CTU1-201ENST00000421832 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
CTU1-201ENST00000421832 ACRBPQ8NEB7 543 aa26.19■■□□□ 1.78
CTU1-201ENST00000421832 CAPS2Q9BXY5 557 aa26.19■■□□□ 1.78
CTU1-201ENST00000421832 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP26.19■■□□□ 1.78
CTU1-201ENST00000421832 PADI3Q9ULW8 664 aa26.19■■□□□ 1.78
CTU1-201ENST00000421832 AGPSO00116 658 aa26.19■■□□□ 1.78
CTU1-201ENST00000421832 PMM2O15305 246 aa26.19■■□□□ 1.78
CTU1-201ENST00000421832 GRM5P41594 1212 aa26.19■■□□□ 1.78
CTU1-201ENST00000421832 GJA8P48165 433 aa26.19■■□□□ 1.78
CTU1-201ENST00000421832 COQ4Q9Y3A0 265 aa26.19■■□□□ 1.78
CTU1-201ENST00000421832 UCHL3P15374 230 aa26.18■■□□□ 1.78
CTU1-201ENST00000421832 ZBED6P86452 979 aa26.18■■□□□ 1.78
CTU1-201ENST00000421832 ZACNQ401N2 412 aa26.18■■□□□ 1.78
CTU1-201ENST00000421832 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa26.18■■□□□ 1.78
CTU1-201ENST00000421832 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP26.18■■□□□ 1.78
CTU1-201ENST00000421832 HAUS4Q9H6D7 363 aa26.18■■□□□ 1.78
CTU1-201ENST00000421832 ERVK-5Q9HDB9 667 aa26.18■■□□□ 1.78
CTU1-201ENST00000421832 CEP72Q9P209 647 aa26.18■■□□□ 1.78
CTU1-201ENST00000421832 MROH7Q68CQ1 1323 aa26.18■■□□□ 1.78
CTU1-201ENST00000421832 VNN1O95497 513 aa26.18■■□□□ 1.78
CTU1-201ENST00000421832 COL6A1P12109 1028 aa26.18■■□□□ 1.78
CTU1-201ENST00000421832 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
CTU1-201ENST00000421832 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa26.18■■□□□ 1.78
CTU1-201ENST00000421832 ACAP3Q96P50 834 aa26.18■■□□□ 1.78
CTU1-201ENST00000421832 DNAJC7Q99615 494 aa26.18■■□□□ 1.78
CTU1-201ENST00000421832 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP26.18■■□□□ 1.78
CTU1-201ENST00000421832 MTMR12Q9C0I1 747 aa26.18■■□□□ 1.78
CTU1-201ENST00000421832 RNF39Q9H2S5 420 aa26.18■■□□□ 1.78
CTU1-201ENST00000421832 NFICP08651 508 aa26.17■■□□□ 1.78
CTU1-201ENST00000421832 RRAGAQ7L523 313 aa26.17■■□□□ 1.78
CTU1-201ENST00000421832 WDR49Q8IV35 697 aa26.17■■□□□ 1.78
CTU1-201ENST00000421832 FBXL13Q8NEE6 735 aa26.17■■□□□ 1.78
CTU1-201ENST00000421832 SH3GL2Q99962 352 aa26.17■■□□□ 1.78
CTU1-201ENST00000421832 APOL6Q9BWW8 343 aa26.17■■□□□ 1.78
CTU1-201ENST00000421832 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa26.17■■□□□ 1.78
CTU1-201ENST00000421832 LRRC53A6NM62 1247 aa26.16■■□□□ 1.78
CTU1-201ENST00000421832 CAND2O75155 1236 aa26.16■■□□□ 1.78
CTU1-201ENST00000421832 SKOR1P84550 965 aa26.16■■□□□ 1.78
CTU1-201ENST00000421832 BIRC3Q13489 604 aa26.16■■□□□ 1.78
CTU1-201ENST00000421832 IQCEQ6IPM2 695 aa26.16■■□□□ 1.78
CTU1-201ENST00000421832 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa26.16■■□□□ 1.78
CTU1-201ENST00000421832 ARHGEF19Q8IW93 802 aa26.16■■□□□ 1.78
CTU1-201ENST00000421832 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
CTU1-201ENST00000421832 CABS1Q96KC9 395 aa26.16■■□□□ 1.78
CTU1-201ENST00000421832 PI4K2AQ9BTU6 479 aa26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.6 ms