RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000316939.2

GADD45GIP1-201, Transcript of GADD45G interacting protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GADD45GIP1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CDHR5Q9HBB8 845 aa23.42■■□□□ 1.34
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ABCB6Q9NP58 842 aa23.42■■□□□ 1.34
GADD45GIP1-201ENST00000316939 C2CD2Q9Y426 696 aa23.42■■□□□ 1.34
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SP3Q02447 781 aa23.41■■□□□ 1.34
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GNASQ5JWF2 1037 aa23.41■■□□□ 1.34
GADD45GIP1-201ENST00000316939 JADE1Q6IE81 842 aa23.41■■□□□ 1.34
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ACAD10Q6JQN1 1059 aa23.41■■□□□ 1.34
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SLC27A1Q6PCB7 646 aa23.41■■□□□ 1.34
GADD45GIP1-201ENST00000316939 C1orf127Q8N9H9 656 aa23.41■■□□□ 1.34
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CAGE1Q8TC20 777 aa23.41■■□□□ 1.34
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa23.41■■□□□ 1.34
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ACAP3Q96P50 834 aa23.41■■□□□ 1.34
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SPC25Q9HBM1 224 aa23.41■■□□□ 1.34
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SIX4Q9UIU6 781 aa23.41■■□□□ 1.34
GADD45GIP1-201ENST00000316939 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa23.41■■□□□ 1.34
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KIF4AO95239 1232 aa23.4■■□□□ 1.34
GADD45GIP1-201ENST00000316939 UNGP13051 313 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FGFR4P22455 802 aa23.4■■□□□ 1.34
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RPS6KA1Q15418 735 aa23.4■■□□□ 1.34
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NOTUMQ6P988 496 aa23.4■■□□□ 1.34
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa23.4■■□□□ 1.34
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TRIM72Q6ZMU5 477 aa23.4■■□□□ 1.34
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DAAM2Q86T65 1068 aa23.4■■□□□ 1.34
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MSANTD4Q8NCY6 345 aa23.4■■□□□ 1.34
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CXorf38Q8TB03 319 aa23.4■■□□□ 1.34
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GTF3C4Q9UKN8 822 aa23.4■■□□□ 1.34
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GINS2Q9Y248 185 aa23.4■■□□□ 1.34
GADD45GIP1-201ENST00000316939 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RARBP10826 455 aa23.4■■□□□ 1.34
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ASPAP45381 313 aa23.4■■□□□ 1.34
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SNX17Q15036 470 aa23.4■■□□□ 1.34
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TAF2Q6P1X5 1199 aa23.4■■□□□ 1.34
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NT5DC3Q86UY8 548 aa23.4■■□□□ 1.34
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
GADD45GIP1-201ENST00000316939 VRTNQ9H8Y1 702 aa23.4■■□□□ 1.34
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa23.4■■□□□ 1.34
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CREBZFQ9NS37 354 aa23.4■■□□□ 1.34
GADD45GIP1-201ENST00000316939 COG5Q9UP83 839 aa23.4■■□□□ 1.34
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TRIP11Q15643 1979 aa23.39■■□□□ 1.33
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CYP1A2P05177 515 aa23.39■■□□□ 1.33
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GNA15P30679 374 aa23.39■■□□□ 1.33
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ATICP31939 592 aa23.39■■□□□ 1.33
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CXCR5P32302 372 aa23.39■■□□□ 1.33
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TMEM132DQ14C87 1099 aa23.39■■□□□ 1.33
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PEX26Q7Z412 305 aa23.39■■□□□ 1.33
GADD45GIP1-201ENST00000316939 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa23.39■■□□□ 1.33
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PSMB7Q99436 277 aa23.39■■□□□ 1.33
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CLSTN1O94985 981 aa23.38■■□□□ 1.33
GADD45GIP1-201ENST00000316939 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CAP1Q01518 475 aa23.38■■□□□ 1.33
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CENPCQ03188 943 aa23.38■■□□□ 1.33
GADD45GIP1-201ENST00000316939 C11orf63Q6NUN7 778 aa23.38■■□□□ 1.33
GADD45GIP1-201ENST00000316939 BCO2Q9BYV7 579 aa23.38■■□□□ 1.33
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GOLPH3Q9H4A6 298 aa23.38■■□□□ 1.33
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa23.38■■□□□ 1.33
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CISHQ9NSE2 258 aa23.38■■□□□ 1.33
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DERAQ9Y315 318 aa23.38■■□□□ 1.33
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ADAMTS4O75173 837 aa23.37■■□□□ 1.33
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NPTXRO95502 500 aa23.37■■□□□ 1.33
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PAFAH1B1P43034 410 aa23.37■■□□□ 1.33
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CCDC181Q5TID7 509 aa23.37■■□□□ 1.33
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa23.37■■□□□ 1.33
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HES6Q96HZ4 224 aa23.37■■□□□ 1.33
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa23.37■■□□□ 1.33
GADD45GIP1-201ENST00000316939 UVRAGQ9P2Y5 699 aa23.37■■□□□ 1.33
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa23.37■■□□□ 1.33
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ITGA11Q9UKX5 1188 aa23.37■■□□□ 1.33
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CALCAP01258 141 aa23.37■■□□□ 1.33
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TRIM32Q13049 653 aa23.37■■□□□ 1.33
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CFAP221Q4G0U5 840 aa23.37■■□□□ 1.33
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TMEM40Q8WWA1 233 aa23.37■■□□□ 1.33
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TRIM11Q96F44 468 aa23.37■■□□□ 1.33
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PBKQ96KB5 322 aa23.37■■□□□ 1.33
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
GADD45GIP1-201ENST00000316939 AMFRQ9UKV5 643 aa23.37■■□□□ 1.33
GADD45GIP1-201ENST00000316939 STAU1O95793 577 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PGK1P00558 417 aa23.36■■□□□ 1.33
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ITGB3P05106 788 aa23.36■■□□□ 1.33
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MYBL1P10243 752 aa23.36■■□□□ 1.33
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF667Q5HYK9 610 aa23.36■■□□□ 1.33
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF653Q96CK0 615 aa23.36■■□□□ 1.33
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PARD6BQ9BYG5 372 aa23.36■■□□□ 1.33
GADD45GIP1-201ENST00000316939 EPC1Q9H2F5 836 aa23.36■■□□□ 1.33
GADD45GIP1-201ENST00000316939 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RNF186Q9NXI6 227 aa23.36■■□□□ 1.33
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TUBBP07437 444 aa23.35■■□□□ 1.33
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KRT19P08727 400 aa23.35■■□□□ 1.33
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CXCL17Q6UXB2 119 aa23.35■■□□□ 1.33
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SPATA4Q8NEY3 305 aa23.35■■□□□ 1.33
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SNX27Q96L92 541 aa23.35■■□□□ 1.33
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CST5P28325 142 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.9 ms