RNA–Protein interactions for RNA: YLR466W

YRF1-4, Transcript of Helicase encoded by the Y' element of subtelomeric regions, yeast

Gene YRF1-4, Length 4,149 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YRF1-4	YLR466W	EMC5	P40540	141 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YRF1-4	YLR466W	BUD8	P41698	603 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YRF1-4	YLR466W	MCM22	P47167	239 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YRF1-4	YLR466W	SNN1	P48232	102 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YRF1-4	YLR466W	BUL1	P48524	976 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YRF1-4	YLR466W	PHO23	P50947	330 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YRF1-4	YLR466W	RCE1	Q03530	315 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YRF1-4	YLR466W	YDR286C	Q05530	114 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YRF1-4	YLR466W	SYM1	Q06563	197 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YRF1-4	YLR466W	IZH2	Q12442	317 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YRF1-4	YLR466W	RIP1	P08067	215 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YRF1-4	YLR466W	RFA1	P22336	621 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
YRF1-4	YLR466W	GLC7	P32598	312 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
YRF1-4	YLR466W	ARC40	P38328	384 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
YRF1-4	YLR466W	SSN8	P47821	323 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YRF1-4	YLR466W	NSA1	P53136	463 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
YRF1-4	YLR466W	YAP6	Q03935	383 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YRF1-4	YLR466W	ATG40	Q99325	256 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YRF1-4	YLR466W	QCR2	P07257	368 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YRF1-4	YLR466W	YLL053C	P0CD98	152 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YRF1-4	YLR466W	MCH2	P36032	473 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YRF1-4	YLR466W	OSH7	P38755	437 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YRF1-4	YLR466W	SLX9	P53251	210 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
YRF1-4	YLR466W	VPS28	Q02767	242 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YRF1-4	YLR466W	YCT1	Q12235	531 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YRF1-4	YLR466W	YBR197C	P38306	217 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YRF1-4	YLR466W	ALG12	P53730	551 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YRF1-4	YLR466W	YNL165W	P53891	406 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YRF1-4	YLR466W	TSA2	Q04120	196 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YRF1-4	YLR466W	PRP11	Q07350	266 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
YRF1-4	YLR466W	HO	P09932	586 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YRF1-4	YLR466W	ECM31	P38122	312 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YRF1-4	YLR466W	TOK1	P40310	691 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YRF1-4	YLR466W	YGL117W	P53133	265 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YRF1-4	YLR466W	GRE1	Q08969	168 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YRF1-4	YLR466W	CYR1	P08678	2026 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
YRF1-4	YLR466W	GDH1	P07262	454 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
YRF1-4	YLR466W	TRR1	P29509	319 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
YRF1-4	YLR466W	ERV15	P38312	142 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YRF1-4	YLR466W	GPP1	P41277	250 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
YRF1-4	YLR466W	ATG4	P53867	494 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YRF1-4	YLR466W	CRR1	Q05790	422 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YRF1-4	YLR466W	ATP14	Q12349	124 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YRF1-4	YLR466W	PRS2	P38620	318 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YRF1-4	YLR466W	YEL057C	P39983	233 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YRF1-4	YLR466W	YDR415C	Q04033	374 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YRF1-4	YLR466W	COQ11	Q05892	277 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YRF1-4	YLR466W	GAL1	P04385	528 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YRF1-4	YLR466W	RPD3	P32561	433 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YRF1-4	YLR466W	REC114	P32841	428 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YRF1-4	YLR466W	RIB5	P38145	238 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YRF1-4	YLR466W	POP7	P38291	140 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YRF1-4	YLR466W	MID1	P41821	548 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YRF1-4	YLR466W	TNA1	P53322	534 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YRF1-4	YLR466W	YMR254C	Q04838	102 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YRF1-4	YLR466W	ERP1	Q05359	219 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YRF1-4	YLR466W	PRS5	Q12265	496 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YRF1-4	YLR466W	HUT1	Q12520	339 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YRF1-4	YLR466W	RPA34	P47006	233 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YRF1-4	YLR466W	YHC3	P47040	408 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YRF1-4	YLR466W	MOG1	P47123	218 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YRF1-4	YLR466W	THI74	Q04083	370 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YRF1-4	YLR466W	YMR090W	Q04304	227 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YRF1-4	YLR466W	YPR098C	Q06089	161 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YRF1-4	YLR466W	PIN3	Q06449	215 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YRF1-4	YLR466W	ATP16	Q12165	160 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YRF1-4	YLR466W	YHR213W-A	Q8TGT4	77 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YRF1-4	YLR466W	LDS1	P31379	325 aa		4.96	□□□□□ -1.61
YRF1-4	YLR466W	MSK1	P32048	576 aa		4.96	□□□□□ -1.61
YRF1-4	YLR466W	YHL044W	P38727	235 aa		4.96	□□□□□ -1.61
YRF1-4	YLR466W	SOL1	P50278	321 aa		4.96	□□□□□ -1.61
YRF1-4	YLR466W	UBC13	P52490	153 aa		4.96	□□□□□ -1.61
YRF1-4	YLR466W	YFH1	Q07540	174 aa		4.96	□□□□□ -1.61
YRF1-4	YLR466W	PCL1	P24867	279 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YRF1-4	YLR466W	CLB6	P32943	380 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YRF1-4	YLR466W	LNP1	P38878	278 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YRF1-4	YLR466W	YER079W	P40052	210 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YRF1-4	YLR466W	CAF16	P43569	289 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YRF1-4	YLR466W	MRPS17	Q03246	237 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YRF1-4	YLR466W	FCY22	Q12119	530 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YRF1-4	YLR466W	SEC22	P22214	214 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YRF1-4	YLR466W	SRY1	P36007	326 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YRF1-4	YLR466W	FLO10	P36170	1169 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YRF1-4	YLR466W	MRX5	P47007	382 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YRF1-4	YLR466W	HNT2	P49775	206 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YRF1-4	YLR466W	CAC2	Q04199	468 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YRF1-4	YLR466W	LIP2	Q06005	328 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YRF1-4	YLR466W	AGC1	Q12482	902 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YRF1-4	YLR466W	HFA1	P32874	2273 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YRF1-4	YLR466W	CDC28	P00546	298 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
YRF1-4	YLR466W	OCH1	P31755	480 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YRF1-4	YLR466W	CBT1	P36038	271 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
YRF1-4	YLR466W	AGX1	P43567	385 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YRF1-4	YLR466W	YCL001W-A	P87012	153 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YRF1-4	YLR466W	PAM18	Q07914	168 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YRF1-4	YLR466W	FLO9	P39712	1322 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YRF1-4	YLR466W	PRP8	P33334	2413 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
YRF1-4	YLR466W	MET3	P08536	511 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YRF1-4	YLR466W	ISC10	P32645	267 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YRF1-4	YLR466W	YIL169C	P40442	995 aa		4.95	□□□□□ -1.62

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