RNA–Protein interactions for RNA: YKL223W

YKL223W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YKL223W, Length 333 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YKL223W	YKL223W	ERG4	P25340	473 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YKL223W	YKL223W	AGP1	P25376	633 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YKL223W	YKL223W	PRY2	P36110	329 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YKL223W	YKL223W	RPF1	P38805	295 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
YKL223W	YKL223W	FLO5	P38894	1075 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YKL223W	YKL223W	UBC9	P50623	157 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
YKL223W	YKL223W	MTO1	P53070	669 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YKL223W	YKL223W	THG1	P53215	237 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
YKL223W	YKL223W	RNH201	P53942	307 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YKL223W	YKL223W	SAM50	P53969	484 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YKL223W	YKL223W	MTQ2	Q03920	221 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
YKL223W	YKL223W	THI74	Q04083	370 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YKL223W	YKL223W	ATG39	Q06159	398 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YKL223W	YKL223W	YLR030W	Q07967	263 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YKL223W	YKL223W	ORT1	Q12375	292 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YKL223W	YKL223W	MES1	P00958	751 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YKL223W	YKL223W	QCR2	P07257	368 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YKL223W	YKL223W	YFL068W	P0CX99	160 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YKL223W	YKL223W	YLL066W-A	P0CY00	160 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YKL223W	YKL223W	YLL067W-A	P0CY01	160 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YKL223W	YKL223W	RPB5	P20434	215 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YKL223W	YKL223W	MDH3	P32419	343 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.97	□□□□□ -1.61	not detected
YKL223W	YKL223W	CSE2	P33308	149 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YKL223W	YKL223W	YKL069W	P36088	180 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YKL223W	YKL223W	GEX2	P36173	615 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YKL223W	YKL223W	MIX23	P38162	196 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YKL223W	YKL223W	YHL044W	P38727	235 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YKL223W	YKL223W	TIM17	P39515	158 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YKL223W	YKL223W	YEL057C	P39983	233 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YKL223W	YKL223W	AIR1	P40507	360 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YKL223W	YKL223W	SMD3	P43321	101 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YKL223W	YKL223W	SFH5	P47008	294 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YKL223W	YKL223W	BXI1	P48558	297 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YKL223W	YKL223W	SCS3	P53012	380 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YKL223W	YKL223W	YGL235W	P53071	178 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YKL223W	YKL223W	HHT1	P61830	136 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YKL223W	YKL223W	RCE1	Q03530	315 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YKL223W	YKL223W	CAB5	Q03941	241 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YKL223W	YKL223W	RTN1	Q04947	295 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YKL223W	YKL223W	YML053C	Q04978	212 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YKL223W	YKL223W	FSH2	Q05015	223 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YKL223W	YKL223W	YOR378W	Q08902	515 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YKL223W	YKL223W	YDL157C	Q12082	118 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YKL223W	YKL223W	YCT1	Q12235	531 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YKL223W	YKL223W	VAM3	Q12241	283 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YKL223W	YKL223W	SUL2	Q12325	893 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YKL223W	YKL223W	PEX11	Q12462	236 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YKL223W	YKL223W	HUT1	Q12520	339 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YKL223W	YKL223W	YDR461C-A	Q2V2P7	80 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YKL223W	YKL223W	CCH1	P50077	2039 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YKL223W	YKL223W	MBF1	O14467	151 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YKL223W	YKL223W	RPS21A	P0C0V8	87 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YKL223W	YKL223W	PAU1	P0CE88	120 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YKL223W	YKL223W	PAU14	P0CE89	120 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YKL223W	YKL223W	PAU6	P0CE90	120 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YKL223W	YKL223W	PAU18	P0CE91	120 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YKL223W	YKL223W	PAU8	P0CE92	120 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YKL223W	YKL223W	PAU11	P0CE93	120 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YKL223W	YKL223W	DAL82	P21705	255 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YKL223W	YKL223W	MCK1	P21965	375 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YKL223W	YKL223W	YCR007C	P25354	239 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YKL223W	YKL223W	RNQ1	P25367	405 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YKL223W	YKL223W	MTR2	P34232	184 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YKL223W	YKL223W	PAU16	P35994	123 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YKL223W	YKL223W	YPT53	P36019	220 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YKL223W	YKL223W	FIG1	P38224	298 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YKL223W	YKL223W	UMP1	P38293	148 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YKL223W	YKL223W	YBR220C	P38318	560 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YKL223W	YKL223W	PAU13	P38725	120 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YKL223W	YKL223W	DOG1	P38774	246 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YKL223W	YKL223W	YHR127W	P38833	243 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YKL223W	YKL223W	GGC1	P38988	300 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YKL223W	YKL223W	XBP1	P40489	647 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YKL223W	YKL223W	GPP1	P41277	250 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YKL223W	YKL223W	TOS2	P50078	622 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YKL223W	YKL223W	EMC4	P53073	190 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YKL223W	YKL223W	PAU4	P53427	120 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YKL223W	YKL223W	PAU10	Q03050	120 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YKL223W	YKL223W	RCR2	Q03446	210 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YKL223W	YKL223W	CGI121	Q03705	181 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YKL223W	YKL223W	HRI1	Q05905	244 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YKL223W	YKL223W	SNT309	Q06091	175 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YKL223W	YKL223W	STP4	Q07351	490 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YKL223W	YKL223W	PAU20	Q08322	120 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YKL223W	YKL223W	HSP33	Q08914	237 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YKL223W	YKL223W	TPT1	Q12272	230 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YKL223W	YKL223W	ERV2	Q12284	196 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YKL223W	YKL223W	RDL1	Q12305	139 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YKL223W	YKL223W	FRE7	Q12333	620 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YKL223W	YKL223W	PAU9	Q3E770	120 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YKL223W	YKL223W	SLO1	Q3E784	85 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YKL223W	YKL223W	YLR358C	O13565	187 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YKL223W	YKL223W	POR1	P04840	283 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
YKL223W	YKL223W	STE7	P06784	515 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YKL223W	YKL223W	ELO2	P25358	347 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YKL223W	YKL223W	AFG1	P32317	509 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YKL223W	YKL223W	TIM23	P32897	222 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YKL223W	YKL223W	RPL14A	P36105	138 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
YKL223W	YKL223W	QDR3	P38227	689 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YKL223W	YKL223W	RPL14B	P38754	138 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62

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