RNA–Protein interactions for RNA: YKL163W

PIR3, Transcript of O-glycosylated covalently-bound cell wall protein, yeastyeast

Gene PIR3, Length 978 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PIR3YKL163W RPS18BP0CX56 146 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
PIR3YKL163W SEC22P22214 214 aa3.49□□□□□ -1.85
PIR3YKL163W AEP1P32493 518 aa3.49□□□□□ -1.85
PIR3YKL163W UPS2P35200 230 aa3.49□□□□□ -1.85
PIR3YKL163W GOS1P38736 223 aa3.49□□□□□ -1.85
PIR3YKL163W MDM31P38880 579 aa3.49□□□□□ -1.85
PIR3YKL163W MOB2P43563 287 aa3.49□□□□□ -1.85
PIR3YKL163W RRT5P43607 289 aa3.49□□□□□ -1.85
PIR3YKL163W VMA10P48836 114 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
PIR3YKL163W JAC1P53193 184 aa3.49□□□□□ -1.85
PIR3YKL163W IDP3P53982 420 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
PIR3YKL163W TPS1Q00764 495 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
PIR3YKL163W ELP3Q02908 557 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
PIR3YKL163W DIG1Q03063 452 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
PIR3YKL163W SPG4Q04438 115 aa3.49□□□□□ -1.85
PIR3YKL163W DXO1Q06349 442 aa3.49□□□□□ -1.85
PIR3YKL163W YLR031WQ07978 186 aa3.49□□□□□ -1.85
PIR3YKL163W COQ10Q08058 207 aa3.49□□□□□ -1.85
PIR3YKL163W YOL024WQ08172 172 aa3.49□□□□□ -1.85
PIR3YKL163W FCY22Q12119 530 aa3.49□□□□□ -1.85
PIR3YKL163W YPL245WQ12179 454 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
PIR3YKL163W MRX4Q12467 430 aa3.49□□□□□ -1.85
PIR3YKL163W AGC1Q12482 902 aa3.49□□□□□ -1.85
PIR3YKL163W YDL085C-AQ3E7B7 68 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
PIR3YKL163W COX5AP00424 153 aa3.48□□□□□ -1.85
PIR3YKL163W PHO80P20052 293 aa3.48□□□□□ -1.85
PIR3YKL163W MRPL20P22354 195 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
PIR3YKL163W TRX3P25372 127 aa3.48□□□□□ -1.85
PIR3YKL163W LDB16P25587 256 aa3.48□□□□□ -1.85
PIR3YKL163W URA10P30402 227 aa3.48□□□□□ -1.85
PIR3YKL163W ECM33P38248 429 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
PIR3YKL163W MED8P38304 223 aa3.48□□□□□ -1.85
PIR3YKL163W CYC2P38909 366 aa3.48□□□□□ -1.85
PIR3YKL163W PDS1P40316 373 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
PIR3YKL163W HAC1P41546 238 aa3.48□□□□□ -1.85
PIR3YKL163W AZF1P41696 914 aa3.48□□□□□ -1.85
PIR3YKL163W PSA1P41940 361 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
PIR3YKL163W SNO3P43544 222 aa3.48□□□□□ -1.85
PIR3YKL163W IKS1P47042 667 aa3.48□□□□□ -1.85
PIR3YKL163W BXI1P48558 297 aa3.48□□□□□ -1.85
PIR3YKL163W YGL260WP53056 76 aa3.48□□□□□ -1.85
PIR3YKL163W PLP1Q04004 230 aa3.48□□□□□ -1.85
PIR3YKL163W SPC24Q04477 213 aa3.48□□□□□ -1.85
PIR3YKL163W SEI1Q06058 285 aa3.48□□□□□ -1.85
PIR3YKL163W YMR316C-AI2HB70 103 aa3.47□□□□□ -1.85
PIR3YKL163W CMD1P06787 147 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
PIR3YKL163W YOL163WP0CF20 169 aa3.47□□□□□ -1.85
PIR3YKL163W COS2P0CX12 379 aa3.47□□□□□ -1.85
PIR3YKL163W COS3P0CX13 379 aa3.47□□□□□ -1.85
PIR3YKL163W FUN26P31381 517 aa3.47□□□□□ -1.85
PIR3YKL163W TIP20P33891 701 aa3.47□□□□□ -1.85
PIR3YKL163W PRY2P36110 329 aa3.47□□□□□ -1.85
PIR3YKL163W MIX23P38162 196 aa3.47□□□□□ -1.85
PIR3YKL163W PEX22P39718 180 aa3.47□□□□□ -1.85
PIR3YKL163W YIL054WP40524 105 aa3.47□□□□□ -1.85
PIR3YKL163W PHB1P40961 287 aa3.47□□□□□ -1.85
PIR3YKL163W COS4P43542 379 aa3.47□□□□□ -1.85
PIR3YKL163W LCB3P47013 409 aa3.47□□□□□ -1.85
PIR3YKL163W YNR066CP53752 436 aa3.47□□□□□ -1.85
PIR3YKL163W SCS7Q03529 384 aa3.47□□□□□ -1.85
PIR3YKL163W YMR315WQ04869 349 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
PIR3YKL163W YLR030WQ07967 263 aa3.47□□□□□ -1.85
PIR3YKL163W VPS68Q12016 184 aa3.47□□□□□ -1.85
PIR3YKL163W MDM32Q12171 622 aa3.47□□□□□ -1.85
PIR3YKL163W YGK3Q12222 375 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
PIR3YKL163W RDI1Q12434 202 aa3.47□□□□□ -1.85
PIR3YKL163W SCL1P21243 252 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
PIR3YKL163W IDP1P21954 428 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
PIR3YKL163W DBF2P22204 572 aa3.46□□□□□ -1.86
PIR3YKL163W MIR1P23641 311 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
PIR3YKL163W CAM1P29547 415 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
PIR3YKL163W MDH3P32419 343 aaKnown RBP RIP-Chip data3.46□□□□□ -1.86not detected
PIR3YKL163W NAT2P37293 288 aa3.46□□□□□ -1.86
PIR3YKL163W HEK2P38199 381 aaKnown RBP RIP-Chip data3.46□□□□□ -1.86 RIP-Chip
PIR3YKL163W PET8P38921 284 aa3.46□□□□□ -1.86
PIR3YKL163W YEL028WP39989 153 aa3.46□□□□□ -1.86
PIR3YKL163W OST1P41543 476 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
PIR3YKL163W BIR1P47134 954 aa3.46□□□□□ -1.86
PIR3YKL163W YDR248CQ03786 193 aa3.46□□□□□ -1.86
PIR3YKL163W LIP2Q06005 328 aa3.46□□□□□ -1.86
PIR3YKL163W SWC7Q06707 132 aa3.46□□□□□ -1.86
PIR3YKL163W RRP40Q08285 240 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
PIR3YKL163W YOR283WQ12040 230 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
PIR3YKL163W ATX2Q12067 313 aa3.46□□□□□ -1.86
PIR3YKL163W USB1Q12208 290 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
PIR3YKL163W SFM1Q12314 213 aa3.46□□□□□ -1.86
PIR3YKL163W IGO2Q9P305 131 aa3.46□□□□□ -1.86
PIR3YKL163W HFA1P32874 2273 aa3.46□□□□□ -1.86
PIR3YKL163W CDC28P00546 298 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
PIR3YKL163W MET2P08465 486 aa3.45□□□□□ -1.86
PIR3YKL163W CUP2P15315 225 aa3.45□□□□□ -1.86
PIR3YKL163W BUB2P26448 306 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
PIR3YKL163W LDS1P31379 325 aa3.45□□□□□ -1.86
PIR3YKL163W TRS65P32893 560 aa3.45□□□□□ -1.86
PIR3YKL163W LSM12P38828 187 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
PIR3YKL163W TIM17P39515 158 aa3.45□□□□□ -1.86
PIR3YKL163W YER076CP40049 302 aa3.45□□□□□ -1.86
PIR3YKL163W DIM1P41819 318 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
PIR3YKL163W SNX4P47057 423 aa3.45□□□□□ -1.86
PIR3YKL163W MSO1P53604 210 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 25.2 ms