RNA–Protein interactions for RNA: YGR063C

SPT4, Transcript of Component of the universally conserved Spt4/5 complex (DSIF complex), yeastyeast

Gene SPT4, Length 309 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPT4YGR063C MRPL27P36526 146 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
SPT4YGR063C REG2P38232 338 aa3.14□□□□□ -1.91
SPT4YGR063C SAF1P38352 637 aa3.14□□□□□ -1.91
SPT4YGR063C YBR292CP38357 123 aa3.14□□□□□ -1.91
SPT4YGR063C FYV4P38783 130 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
SPT4YGR063C PRM5P40476 318 aa3.14□□□□□ -1.91
SPT4YGR063C MEP2P41948 499 aa3.14□□□□□ -1.91
SPT4YGR063C ALK1P43633 760 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
SPT4YGR063C SCD6P45978 349 aaKnown RBP RIP-Chip data3.14□□□□□ -1.91not detected
SPT4YGR063C ATG27P46989 271 aa3.14□□□□□ -1.91
SPT4YGR063C IKS1P47042 667 aa3.14□□□□□ -1.91
SPT4YGR063C XPT1P47165 209 aa3.14□□□□□ -1.91
SPT4YGR063C LYS5P50113 272 aa3.14□□□□□ -1.91
SPT4YGR063C SBH2P52871 88 aa3.14□□□□□ -1.91
SPT4YGR063C MTC3P53077 123 aa3.14□□□□□ -1.91
SPT4YGR063C YNL092WP53934 400 aa3.14□□□□□ -1.91
SPT4YGR063C YPL077CQ02831 240 aa3.14□□□□□ -1.91
SPT4YGR063C YML083CQ04526 418 aa3.14□□□□□ -1.91
SPT4YGR063C YMR074CQ04773 145 aa3.14□□□□□ -1.91
SPT4YGR063C HRI1Q05905 244 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
SPT4YGR063C YPR114WQ06107 315 aa3.14□□□□□ -1.91
SPT4YGR063C YPR174CQ06616 221 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
SPT4YGR063C IES4Q08561 116 aa3.14□□□□□ -1.91
SPT4YGR063C MET32Q12041 191 aa3.14□□□□□ -1.91
SPT4YGR063C TGS1Q12052 315 aa3.14□□□□□ -1.91
SPT4YGR063C YDR262WQ12331 272 aa3.14□□□□□ -1.91
SPT4YGR063C FRE7Q12333 620 aa3.14□□□□□ -1.91
SPT4YGR063C ORT1Q12375 292 aa3.14□□□□□ -1.91
SPT4YGR063C ICT1Q12385 394 aa3.14□□□□□ -1.91
SPT4YGR063C YOR338WQ99326 363 aa3.14□□□□□ -1.91
SPT4YGR063C YPR096CO13587 100 aa3.13□□□□□ -1.91
SPT4YGR063C TPI1P00942 248 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
SPT4YGR063C RPS9BP05755 195 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
SPT4YGR063C RPL35AP0CX84 120 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
SPT4YGR063C RPL35BP0CX85 120 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
SPT4YGR063C MAK32P23060 363 aa3.13□□□□□ -1.91
SPT4YGR063C RBK1P25332 333 aa3.13□□□□□ -1.91
SPT4YGR063C YCR023CP25351 611 aa3.13□□□□□ -1.91
SPT4YGR063C PPA2P28239 310 aa3.13□□□□□ -1.91
SPT4YGR063C MKK2P32491 506 aa3.13□□□□□ -1.91
SPT4YGR063C SRB5P32585 307 aa3.13□□□□□ -1.91
SPT4YGR063C YKU70P32807 602 aa3.13□□□□□ -1.91
SPT4YGR063C DUT1P33317 147 aa3.13□□□□□ -1.91
SPT4YGR063C PRP18P33411 251 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
SPT4YGR063C MRPL24P36525 258 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
SPT4YGR063C UMP1P38293 148 aa3.13□□□□□ -1.91
SPT4YGR063C SLM6P38343 150 aa3.13□□□□□ -1.91
SPT4YGR063C WSC4P38739 605 aa3.13□□□□□ -1.91
SPT4YGR063C YPT35P38815 214 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
SPT4YGR063C YHR210CP38893 341 aa3.13□□□□□ -1.91
SPT4YGR063C YIL165CP40446 119 aa3.13□□□□□ -1.91
SPT4YGR063C SEC24P40482 926 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
SPT4YGR063C YPS6P40583 537 aa3.13□□□□□ -1.91
SPT4YGR063C GTS1P40956 396 aa3.13□□□□□ -1.91
SPT4YGR063C YJL163CP46996 555 aa3.13□□□□□ -1.91
SPT4YGR063C HSV2P50079 448 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
SPT4YGR063C PDR17P53844 350 aa3.13□□□□□ -1.91
SPT4YGR063C YNL260CP53846 198 aa3.13□□□□□ -1.91
SPT4YGR063C MTQ2Q03920 221 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
SPT4YGR063C CRD1Q07560 283 aa3.13□□□□□ -1.91
SPT4YGR063C MRH1Q12117 320 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
SPT4YGR063C WTM2Q12206 467 aa3.13□□□□□ -1.91
SPT4YGR063C TPT1Q12272 230 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
SPT4YGR063C YLR146W-AQ2V2P1 62 aa3.13□□□□□ -1.91
SPT4YGR063C YCL012CQ8J0M4 134 aa3.13□□□□□ -1.91
SPT4YGR063C GSC2P40989 1895 aa3.13□□□□□ -1.91
SPT4YGR063C GAL7P08431 366 aa3.12□□□□□ -1.91
SPT4YGR063C DPM1P14020 267 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
SPT4YGR063C SAC7P17121 654 aa3.12□□□□□ -1.91
SPT4YGR063C SAG1P20840 650 aa3.12□□□□□ -1.91
SPT4YGR063C MEK1P24719 497 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
SPT4YGR063C YMC1P32331 307 aa3.12□□□□□ -1.91
SPT4YGR063C MDH3P32419 343 aaKnown RBP RIP-Chip data3.12□□□□□ -1.91not detected
SPT4YGR063C TKL2P33315 681 aa3.12□□□□□ -1.91
SPT4YGR063C PPZ2P33329 710 aa3.12□□□□□ -1.91
SPT4YGR063C IXR1P33417 597 aa3.12□□□□□ -1.91
SPT4YGR063C UPS2P35200 230 aa3.12□□□□□ -1.91
SPT4YGR063C PAN3P36102 679 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
SPT4YGR063C LSM2P38203 95 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
SPT4YGR063C DOG2P38773 246 aa3.12□□□□□ -1.91
SPT4YGR063C YHR127WP38833 243 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
SPT4YGR063C YEL028WP39989 153 aa3.12□□□□□ -1.91
SPT4YGR063C YEA4P40004 342 aa3.12□□□□□ -1.91
SPT4YGR063C YIL060WP40519 144 aa3.12□□□□□ -1.91
SPT4YGR063C PAM16P42949 149 aa3.12□□□□□ -1.91
SPT4YGR063C RPS10BP46784 105 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
SPT4YGR063C TTI2P47168 421 aa3.12□□□□□ -1.91
SPT4YGR063C YIP4P53093 235 aa3.12□□□□□ -1.91
SPT4YGR063C DUO1P53168 247 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
SPT4YGR063C COX18P53239 316 aa3.12□□□□□ -1.91
SPT4YGR063C PDR16P53860 351 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
SPT4YGR063C EFM6P53970 246 aa3.12□□□□□ -1.91
SPT4YGR063C APS2Q00381 147 aa3.12□□□□□ -1.91
SPT4YGR063C YPL062WQ02781 134 aa3.12□□□□□ -1.91
SPT4YGR063C ADD37Q03233 198 aa3.12□□□□□ -1.91
SPT4YGR063C MZM1Q03429 123 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
SPT4YGR063C CCE1Q03702 353 aa3.12□□□□□ -1.91
SPT4YGR063C YMR252CQ04814 134 aa3.12□□□□□ -1.91
SPT4YGR063C COQ11Q05892 277 aa3.12□□□□□ -1.91
SPT4YGR063C BSP1Q06604 576 aa3.12□□□□□ -1.91
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