RNA–Protein interactions for RNA: YDR289C

RTT103, Transcript of Protein involved in transcription termination by RNA polymerase II, yeast

Gene RTT103, Length 1,230 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RTT103	YDR289C	TY1B-PR1	P0C2I9	1755 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
RTT103	YDR289C	TY1B-PR2	P0C2J0	1756 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RTT103	YDR289C	TY1B-PR3	P0C2J1	1755 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
RTT103	YDR289C	TY1B-JR1	P47098	1755 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RTT103	YDR289C	TY1B-ML2	Q03434	1755 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
RTT103	YDR289C	TY1B-ER1	Q03612	1755 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RTT103	YDR289C	TY1B-ML1	Q04711	1755 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
RTT103	YDR289C	TY1B-GR2	Q12269	1755 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RTT103	YDR289C	TY1B-OL	Q12273	1755 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RTT103	YDR289C	TY1B-PL	Q12414	1755 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
RTT103	YDR289C	MET2	P08465	486 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RTT103	YDR289C	CPT1	P17898	393 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RTT103	YDR289C	PRE7	P23724	241 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
RTT103	YDR289C	OAC1	P32332	324 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RTT103	YDR289C	TRM7	P38238	310 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
RTT103	YDR289C	SPL2	P38839	148 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RTT103	YDR289C	YER189W	P40104	122 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RTT103	YDR289C	EFM5	P53200	248 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
RTT103	YDR289C	SYF2	P53277	215 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
RTT103	YDR289C	YLR179C	Q06252	201 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
RTT103	YDR289C	GRE1	Q08969	168 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RTT103	YDR289C	TIM22	Q12328	207 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RTT103	YDR289C	YBL112C	Q3E7Y4	105 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RTT103	YDR289C	YPL229W	Q99395	206 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RTT103	YDR289C	ULS1	Q08562	1619 aa		4.09	□□□□□ -1.76
RTT103	YDR289C	YAK1	P14680	807 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RTT103	YDR289C	SFC1	P33303	322 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RTT103	YDR289C	CAF4	P36130	643 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RTT103	YDR289C	SUR2	P38992	349 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RTT103	YDR289C	CAT5	P41735	233 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RTT103	YDR289C	YJR056C	P47115	236 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RTT103	YDR289C	SMD1	Q02260	146 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
RTT103	YDR289C	PRM15	Q03262	622 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RTT103	YDR289C	TSA2	Q04120	196 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RTT103	YDR289C	YET3	Q07451	203 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RTT103	YDR289C	TY1B-BR	Q12193	1756 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RTT103	YDR289C	TY1B-GR3	Q12316	1755 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RTT103	YDR289C	TY1B-OR	Q92393	1755 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RTT103	YDR289C	GEA1	P47102	1408 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
RTT103	YDR289C	YOL163W	P0CF20	169 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RTT103	YDR289C	APS1	P35181	156 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RTT103	YDR289C	ECM13	P38195	257 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RTT103	YDR289C	SHG1	P38337	142 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RTT103	YDR289C	YJR141W	P47172	347 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
RTT103	YDR289C	YGL159W	P53110	370 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RTT103	YDR289C	YGR067C	P53243	804 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RTT103	YDR289C	YMR279C	Q03263	540 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RTT103	YDR289C	IES3	Q12345	250 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RTT103	YDR289C	YBT1	P32386	1661 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RTT103	YDR289C	RPL35A	P0CX84	120 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
RTT103	YDR289C	RPL35B	P0CX85	120 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
RTT103	YDR289C	CUP2	P15315	225 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RTT103	YDR289C	MRPL28	P36527	147 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RTT103	YDR289C	ECM14	P38836	430 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RTT103	YDR289C	POG1	P40473	351 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RTT103	YDR289C	FAR7	P43592	221 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RTT103	YDR289C	GTR2	P53290	341 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RTT103	YDR289C	ERV29	P53337	310 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RTT103	YDR289C	YML096W	Q04489	525 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RTT103	YDR289C	SCW10	Q04951	389 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RTT103	YDR289C	YNG1	Q08465	219 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RTT103	YDR289C	YPL264C	Q08980	353 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RTT103	YDR289C	LSO2	Q3E772	92 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
RTT103	YDR289C	SEC22	P22214	214 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RTT103	YDR289C	RNP1	P32385	249 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RTT103	YDR289C	YPT52	P36018	234 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
RTT103	YDR289C	MRPS9	P38120	278 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RTT103	YDR289C	COG3	P40094	801 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RTT103	YDR289C	INM2	Q05533	292 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RTT103	YDR289C	PRR2	Q12310	699 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RTT103	YDR289C	HTL1	Q9URQ5	78 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RTT103	YDR289C	YLR462W	O13556	202 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RTT103	YDR289C	LDB16	P25587	256 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RTT103	YDR289C	SRP14	P38985	146 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RTT103	YDR289C	SEO1	P39709	593 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RTT103	YDR289C	YEL075C	P39972	122 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RTT103	YDR289C	MDM32	Q12171	622 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RTT103	YDR289C	EMP46	Q12396	444 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RTT103	YDR289C	YPL247C	Q12523	523 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RTT103	YDR289C	VTH1	P40438	1549 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RTT103	YDR289C	VTH2	P40890	1549 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RTT103	YDR289C	TY1B-JR2	P47100	1755 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
RTT103	YDR289C	TY1B-ER2	Q03619	1755 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RTT103	YDR289C	TY1B-MR1	Q04214	1755 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RTT103	YDR289C	TY1B-MR2	Q04670	1755 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
RTT103	YDR289C	TY1B-LR1	Q12088	1755 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
RTT103	YDR289C	TY1B-NL1	Q12112	1755 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RTT103	YDR289C	TY1B-GR1	Q12141	1755 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RTT103	YDR289C	TY1B-BL	Q12490	1755 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RTT103	YDR289C	TSC11	P40061	1430 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RTT103	YDR289C	ECM33	P38248	429 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
RTT103	YDR289C	PRM8	P53174	237 aa		4.03	□□□□□ -1.76
RTT103	YDR289C	YIP3	P53633	176 aa		4.03	□□□□□ -1.76
RTT103	YDR289C	ALG9	P53868	555 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
RTT103	YDR289C	YMD8	Q03697	442 aa		4.03	□□□□□ -1.76
RTT103	YDR289C	PIN3	Q06449	215 aa		4.03	□□□□□ -1.76
RTT103	YDR289C	YPL257W	Q08974	193 aa		4.03	□□□□□ -1.76
RTT103	YDR289C	GCN2	P15442	1659 aa		4.03	□□□□□ -1.76
RTT103	YDR289C	PDR10	P51533	1564 aa		4.02	□□□□□ -1.77
RTT103	YDR289C	ERG24	P32462	438 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77

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