RNA–Protein interactions for RNA: tF(GAA)B

tF(GAA)B, Transcript of Phenylalanine tRNA (tRNA-Phe), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tF(GAA)B, Length 73 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tF(GAA)BtF(GAA)B MSS1P32559 526 aaPredicted RBP0.34□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B TIM12P32830 109 aa0.34□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B MFT1P33441 392 aaKnown RBP0.34□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B YBL055CP34220 418 aaPredicted RBP0.34□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B MRPL38P35996 138 aaPredicted RBP0.34□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B YKL071WP36086 256 aa0.34□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B RPL32P38061 130 aaKnown RBP0.34□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B YPK3P38070 525 aa0.34□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B SVP26P38869 228 aa0.34□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B UTP9P38882 575 aaKnown RBP0.34□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B MLH1P38920 769 aa0.34□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B YER079WP40052 210 aaKnown RBP0.34□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B YJL163CP46996 555 aa0.34□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B YJR142WP47173 342 aa0.34□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B TOS2P50078 622 aa0.34□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B EOS1P53938 366 aa0.34□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B YNL010WP53981 241 aaKnown RBP0.34□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B YDR476CQ03362 224 aa0.34□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B HMO1Q03973 246 aaKnown RBP0.34□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B BNA7Q04066 261 aa0.34□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B SNT309Q06091 175 aaPredicted RBP0.34□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B SYO1Q07395 620 aa0.34□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B SDO1Q07953 250 aaKnown RBP0.34□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B MCH4Q08268 501 aa0.34□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B FRE5Q08908 694 aa0.34□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B YOR289WQ12012 251 aaPredicted RBP0.34□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B YDR029WQ12111 104 aa0.34□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B YPR013CQ12145 317 aa0.34□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B YCT1Q12235 531 aa0.34□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B VAM3Q12241 283 aa0.34□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B ORT1Q12375 292 aa0.34□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B KTI11Q3E840 82 aa0.34□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B MES1P00958 751 aaKnown RBP0.33□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B PET494P07390 489 aaPredicted RBP0.33□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B RNR2P09938 399 aaKnown RBP0.33□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B RPS11AP0CX47 156 aaKnown RBP0.33□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B RPS11BP0CX48 156 aaKnown RBP0.33□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B UBC4P15731 148 aa0.33□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B MEK1P24719 497 aaPredicted RBP0.33□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B PEX3P28795 441 aa0.33□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B AAR2P32357 355 aaPredicted RBP0.33□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B RNP1P32385 249 aa0.33□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B APE2P32454 952 aaKnown RBP0.33□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B SUA5P32579 426 aa0.33□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B AST1P35183 429 aa0.33□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B BLI1P35727 113 aa0.33□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B RFT1P38206 574 aaPredicted RBP0.33□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B ATG14P38270 344 aa0.33□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B YHK8P38776 514 aa0.33□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B GEP4P38812 185 aa0.33□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B YHR219WP38900 624 aa0.33□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B ASP1P38986 381 aaPredicted RBP0.33□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B YHB1P39676 399 aaKnown RBP0.33□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B BDH2P39713 417 aa0.33□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B BDH1P39714 382 aa0.33□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B ATF1P40353 525 aa0.33□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B PGD1P40356 397 aa0.33□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B COA1P40452 197 aa0.33□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B YIL077CP40508 320 aa0.33□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B CTK2P46962 323 aa0.33□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B YJR015WP47090 510 aa0.33□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B YMR155WQ03795 547 aa0.33□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B MRPS8Q03799 155 aa0.33□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B TSA2Q04120 196 aa0.33□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B YMR130WQ04223 302 aa0.33□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B YPR127WQ06494 345 aa0.33□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B HRT1Q08273 121 aa0.33□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B SYC1Q08553 188 aaPredicted RBP0.33□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B RIO1Q12196 484 aaKnown RBP0.33□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B NCA2Q12374 616 aa0.33□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B PRM4Q12498 284 aa0.33□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B YLL066W-BQ8TGJ7 56 aa0.33□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B YBR126W-AQ8TGU7 68 aa0.33□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B YAR023CD6VPM8 179 aa0.32□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B NFT1P0CE68 1218 aa0.32□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B DIT1P21623 536 aa0.32□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B CLB4P24871 460 aa0.32□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B STE50P25344 346 aa0.32□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B YCR090CP25654 182 aaKnown RBP0.32□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B POP5P28005 173 aa0.32□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B ARC19P33204 171 aaKnown RBP0.32□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B LTV1P34078 463 aa0.32□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B CPR5P35176 225 aa0.32□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B SPC34P36131 295 aa0.32□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B YBR013CP38215 129 aa0.32□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B SLM4P38247 162 aa0.32□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B ALP1P38971 573 aa0.32□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B CAT5P41735 233 aa0.32□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B YJL118WP47022 219 aa0.32□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B IRC18P47056 224 aa0.32□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B SDS23P53172 527 aa0.32□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B PXR1P53335 271 aaPredicted RBP0.32□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B HAP5Q02516 242 aa0.32□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B SPO19Q03029 223 aa0.32□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B GRX3Q03835 250 aa0.32□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B YPD1Q07688 167 aa0.32□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B SKI7Q08491 747 aaPredicted RBP0.32□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B TMA17Q12513 150 aa0.32□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B RRT15Q3E811 62 aa0.32□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B ATG40Q99325 256 aa0.32□□□□□ -2.36
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