RNA–Protein interactions for RNA: YKL003C

MRP17, Transcript of Mitochondrial ribosomal protein of the small subunit, yeast

Gene MRP17, Length 396 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MRP17	YKL003C	NVJ1	P38881	321 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MRP17	YKL003C	BOL3	P39724	118 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MRP17	YKL003C	AVT6	P40074	448 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MRP17	YKL003C	MSS2	P40990	351 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MRP17	YKL003C	YFL015C	P43578	164 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MRP17	YKL003C	SSN8	P47821	323 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MRP17	YKL003C	UFD1	P53044	361 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MRP17	YKL003C	YMR166C	Q03829	368 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MRP17	YKL003C	YMR254C	Q04838	102 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MRP17	YKL003C	PEX30	Q06169	523 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MRP17	YKL003C	MRX9	Q07349	420 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MRP17	YKL003C	LUC7	Q07508	261 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MRP17	YKL003C	GRC3	Q07845	632 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MRP17	YKL003C	MED11	Q99278	115 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MRP17	YKL003C	RPL25	P04456	142 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MRP17	YKL003C	ARO4	P32449	370 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MRP17	YKL003C	DAL3	P32459	195 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRP17	YKL003C	RCN1	P36054	211 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRP17	YKL003C	MRPL36	P36531	177 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRP17	YKL003C	SSZ1	P38788	538 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MRP17	YKL003C	XPT1	P47165	209 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRP17	YKL003C	BUD25	P85052	153 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRP17	YKL003C	YPL067C	Q02754	198 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRP17	YKL003C	YPL108W	Q02872	168 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MRP17	YKL003C	YLR283W	Q05867	314 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRP17	YKL003C	SRL1	Q08673	210 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRP17	YKL003C	RAX2	Q12465	1220 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRP17	YKL003C	YLR099W-A	Q3E798	87 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRP17	YKL003C	YEL009C-A	A0A023PZF2	135 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRP17	YKL003C	YLR358C	O13565	187 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRP17	YKL003C	MET17	P06106	444 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRP17	YKL003C	PAU2	P32612	120 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRP17	YKL003C	SNC2	P33328	115 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRP17	YKL003C	YKL063C	P35725	167 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRP17	YKL003C	SFK1	P35735	353 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRP17	YKL003C	NAT2	P37293	288 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRP17	YKL003C	ADH5	P38113	351 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MRP17	YKL003C	YGL114W	P53134	725 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRP17	YKL003C	MRH4	P53166	561 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRP17	YKL003C	MAK3	Q03503	176 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRP17	YKL003C	ADH6	Q04894	360 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MRP17	YKL003C	YOR186W	Q08560	144 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRP17	YKL003C	RFM1	Q12192	310 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRP17	YKL003C	ATP10	P18496	279 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRP17	YKL003C	PET18	P25362	215 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRP17	YKL003C	PEX4	P29340	183 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRP17	YKL003C	ARO7	P32178	256 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRP17	YKL003C	AGA2	P32781	87 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRP17	YKL003C	YNK1	P36010	153 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
MRP17	YKL003C	YCR041W	P37265	110 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRP17	YKL003C	UMP1	P38293	148 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRP17	YKL003C	AGE2	P40529	298 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRP17	YKL003C	TAX4	P47030	604 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRP17	YKL003C	YGL262W	P53054	175 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRP17	YKL003C	DOC1	P53068	250 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRP17	YKL003C	IMO32	P53219	342 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRP17	YKL003C	PRP3	Q03338	469 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
MRP17	YKL003C	YDR415C	Q04033	374 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
MRP17	YKL003C	TIR4	Q12218	487 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
MRP17	YKL003C	RBD2	Q12270	262 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRP17	YKL003C	AHC2	P25649	128 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MRP17	YKL003C	VAM7	P32912	316 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MRP17	YKL003C	TMA19	P35691	167 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MRP17	YKL003C	ICS2	P38284	255 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MRP17	YKL003C	PDS1	P40316	373 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MRP17	YKL003C	MRX5	P47007	382 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MRP17	YKL003C	YGR054W	P53235	642 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MRP17	YKL003C	SCW4	P53334	386 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MRP17	YKL003C	RPL21A	Q02753	160 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MRP17	YKL003C	LIP2	Q06005	328 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MRP17	YKL003C	ATG17	Q06410	417 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MRP17	YKL003C	ARR2	Q06597	130 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MRP17	YKL003C	ALG6	Q12001	544 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MRP17	YKL003C	RPL21B	Q12672	160 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MRP17	YKL003C	YOR192C-C	Q3E736	78 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MRP17	YKL003C	GDH1	P07262	454 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MRP17	YKL003C	SPS4	P09937	338 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRP17	YKL003C	YER190C-B	P0CX94	160 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRP17	YKL003C	YEL077W-A	P0CX95	160 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRP17	YKL003C	YGR296C-B	P0CX96	160 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRP17	YKL003C	YPL283W-B	P0CX97	160 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRP17	YKL003C	YPR204C-A	P0CX98	160 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRP17	YKL003C	YFL068W	P0CX99	160 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRP17	YKL003C	YLL066W-A	P0CY00	160 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRP17	YKL003C	YLL067W-A	P0CY01	160 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRP17	YKL003C	PET122	P10355	254 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRP17	YKL003C	ATG22	P25568	528 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRP17	YKL003C	PSD1	P39006	500 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRP17	YKL003C	YJL218W	P40892	196 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MRP17	YKL003C	GWT1	P47026	490 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRP17	YKL003C	YAE1	P47118	141 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MRP17	YKL003C	YGR045C	P53229	120 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRP17	YKL003C	OKP1	P53298	406 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRP17	YKL003C	YNL234W	P53857	426 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRP17	YKL003C	UPS1	Q05776	175 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRP17	YKL003C	FCY1	Q12178	158 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRP17	YKL003C	VAM3	Q12241	283 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRP17	YKL003C	GCN4	P03069	281 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MRP17	YKL003C	YLL053C	P0CD98	152 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MRP17	YKL003C	SWD2	P36104	329 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68

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